Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03911
• Subject: XM_011528986.2
• Aligned Length: 1191
• Identities: 1149
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ------------------------------------------ATGAATGCTGGCCCATCTTGGAATAAAGTGCA  32
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATCTCATCAGAAAAGCAGTTTTATTTTCTCACAGCAATATGAATGCTGGCCCATCTTGGAATAAAGTGCA  74

Query   33  ACATTCAAAGAATTCTTCAGGAAAAAGGCAGAGTAAATCCCAAGTACCCCACGCTTCTTCCCAGCCGAGAAGCA  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACATTCAAAGAATTCTTCAGGAAAAAGGCAGAGTAAATCCCAAGTACCCCACGCTTCTTCCCAGCCGAGAAGCA  148

Query  107  GCCTCACAGCTGTCACCCAGCCTACTGAAGAAAAACTTAAAGAAAGCATTTCCCCGGAAGCAAGACGCAAAAGG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCTCACAGCTGTCACCCAGCCTACTGAAGAAAAACTTAAAGAAAGCATTTCCCCGGAAGCAAGACGCAAAAGG  222

Query  181  AATCCACTCGGTTCCAGGTGTCAGGGGGCCTCAGGGAATAAACTGTTTCTTGATTTTCAGTCAATGAAAATTAT  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATCCACTCGGTTCCAGGTGTCAGGGGGCCTCAGGGAATAAACTGTTTCTTGATTTTCAGTCAATGAAAATTAT  296

Query  255  TAAAGAGAATGCTGATGAGGACAGTGCAAGTGATCTCTCTGATTCGGAAAGAATTCCCATTCCTCCTTCTCCCC  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGAGAATGCTGATGAGGACAGTGCAAGTGATCTCTCTGATTCGGAAAGAATTCCCATTCCTCCTTCTCCCC  370

Query  329  TCACACCTCCAGATCTCAATCTTCGAGCTGAAGAAATTGATCCAGTTTACTTTGATCTTCACCCTGGTCAGGGC  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACACCTCCAGATCTCAATCTTCGAGCTGAAGAAATTGATCCAGTTTACTTTGATCTTCACCCTGGTCAGGGC  444

Query  403  CATACAAAACCTGAATACTATTATCCTAATTTCCTTCCATCCCCTTTCAGCTCCTGGGACCTACGAGATATGGC  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATACAAAACCTGAATACTATTATCCTAATTTCCTTCCATCCCCTTTCAGCTCCTGGGACCTACGAGATATGGC  518

Query  477  CCTGCTTCTGAACGCAGAGAACAAAACGGAAGCCGTGCCCCGAGTGGGAGGACTTCTTGGGAAGTATATCGATA  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGCTTCTGAACGCAGAGAACAAAACGGAAGCCGTGCCCCGAGTGGGAGGACTTCTTGGGAAGTATATCGATA  592

Query  551  GACTTATTCAGCTTGAGTGGCTGCAAGTCCAGACTGTACAGTGTGAAAAAGCAAAGGGGGGCAAAGCAAGGCCC  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACTTATTCAGCTTGAGTGGCTGCAAGTCCAGACTGTACAGTGTGAAAAAGCAAAGGGGGGCAAAGCAAGGCCC  666

Query  625  CCCACTGCCCCTGGGACCTCAGGGGCACTGAAAAGCCCTGGGAGAAGTAAGCTAATTGCTAGTGCTCTGTCCAA  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCACTGCCCCTGGGACCTCAGGGGCACTGAAAAGCCCTGGGAGAAGTAAGCTAATTGCTAGTGCTCTGTCCAA  740

Query  699  GCCACTACCTCACCAGGAAGGGGCTTCAAAGTCAGGCCCTTCCCGAAAGAAAGCTTTTCACCATGAAGAAATCC  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCACTACCTCACCAGGAAGGGGCTTCAAAGTCAGGCCCTTCCCGAAAGAAAGCTTTTCACCATGAAGAAATCC  814

Query  773  ACCCATCACATTATGCATTTGAGACTTCCCCTAGACCCATTGATGTGCTTGGTGGTACCAGGTTTTGTTCTCAG  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCCATCACATTATGCATTTGAGACTTCCCCTAGACCCATTGATGTGCTTGGTGGTACCAGGTTTTGTTCTCAG  888

Query  847  AGGCAAACCCTTGAAATGAGGACAGAAGAAAAGAAAAAGAAATCAAGTAAGAGTACGAAGCTGCAGCGCTGGGA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGCAAACCCTTGAAATGAGGACAGAAGAAAAGAAAAAGAAATCAAGTAAGAGTACGAAGCTGCAGCGCTGGGA  962

Query  921  TCTGTCCGGCAGTGGAAGCAGCTCTAAGGTGGAAACCAGCGGTCACATTCGAGTTCCCAAACAGGCAGCTGTGA  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGTCCGGCAGTGGAAGCAGCTCTAAGGTGGAAACCAGCGGTCACATTCGAGTTCCCAAACAGGCAGCTGTGA  1036

Query  995  TTCTGGACTCAGCAGATTCCTGTAAGGCCTCCAAAACACAAGCACATGCACATCCTAGGAAAAAGGGAAAGGCA  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCTGGACTCAGCAGATTCCTGTAAGGCCTCCAAAACACAAGCACATGCACATCCTAGGAAAAAGGGAAAGGCA  1110

Query 1069  GAGAGCTGTGGTCATGCCACTGTATCGAGTGAGAAAAAACTGAAAACAAACGGAGTAAAGCAAAACACATATAA  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGAGCTGTGGTCATGCCACTGTATCGAGTGAGAAAAAACTGAAAACAAACGGAGTAAAGCAAAACACATATAA  1184

Query 1143  ACTAAAA  1149
            |||||||
Sbjct 1185  ACTAAAA  1191