Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03947
- Subject:
- XM_011534012.1
- Aligned Length:
- 1950
- Identities:
- 1668
- Gaps:
- 282
Alignment
Query 1 ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCCCGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCG 148
|||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------ATGGCAGCGGGACCG 15
Query 149 GCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATT 222
|||||||||||
Sbjct 16 GCGGCTCTAAG--------------------------------------------------------------- 26
Query 223 CCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAA 296
Sbjct 27 -------------------------------------------------------------------------- 26
Query 297 GGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 ------------GTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC 88
Query 371 GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT 162
Query 445 GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA 236
Query 519 TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT 310
Query 593 ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG 384
Query 667 TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT 458
Query 741 CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT 532
Query 815 GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC 606
Query 889 CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA 680
Query 963 TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC 754
Query 1037 TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 755 TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT 828
Query 1111 GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA 902
Query 1185 TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG 976
Query 1259 ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC 1050
Query 1333 GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC 1124
Query 1407 AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC 1198
Query 1481 CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA 1272
Query 1555 AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC 1346
Query 1629 CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347 CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC 1420
Query 1703 GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA 1494
Query 1777 GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG 1568
Query 1851 GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569 GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC 1642
Query 1925 TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG 1950
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643 TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG 1668