Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03947
- Subject:
- XM_011534013.1
- Aligned Length:
- 1950
- Identities:
- 1587
- Gaps:
- 363
Alignment
Query 1 ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCCCGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC 370
|||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------ATGGCCC 7
Query 371 GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT 81
Query 445 GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA 155
Query 519 TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT 229
Query 593 ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230 ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG 303
Query 667 TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT 377
Query 741 CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT 451
Query 815 GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC 525
Query 889 CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA 599
Query 963 TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC 673
Query 1037 TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT 747
Query 1111 GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA 821
Query 1185 TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG 895
Query 1259 ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC 969
Query 1333 GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC 1043
Query 1407 AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC 1117
Query 1481 CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA 1191
Query 1555 AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC 1265
Query 1629 CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1266 CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC 1339
Query 1703 GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340 GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA 1413
Query 1777 GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414 GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG 1487
Query 1851 GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC 1561
Query 1925 TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG 1950
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG 1587