Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03947
• Subject: XM_017007035.1
• Aligned Length: 2047
• Identities: 1812
• Gaps: 200

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGCC----------GGC---------GCTCGGGCCGCCG  22
                                             ||.|||          |||         ||||.||||..|.
Sbjct    1  ATGGCAGCGGGACCGGCGGCTCTAAGTCGTCTTATCGCCAGACCTGGAGGGCTTCCTGTCAGCTCAGGCCATCC  74

Query   23  CCGCC----------GCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGC--AACCAGCCGCCTCAGGAGCT----  80
            ||.||          ||||.|...||||     |.||..||||   ||  |.||.|||..||||     |    
Sbjct   75  CCACCCTAAGCACTGGCTGGCAGTGCGG-----TGGGAATCTT---GCCGACCCTGCCATCTCA-----TTCCC  135

Query   81  ----GGGGCTTGGGGAGCT---GCTGGAGGAGTTCTCC---CGGACTCAGTACC-----GGGCCAAGGATGGCA  139
                |.||.||.||.||||   ||...|  ||||.|||   .|.|.||.||.||     |..|||       ||
Sbjct  136  CCACGTGGTTTTGGCAGCTTTAGCACCA--AGTTTTCCAGTGGAATTCTGTTCCATCCTGCACCA-------CA  200

Query  140  G----CGG----GACCGGCGGCTC------TAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCC  199
            |    |.|    |||      |||      ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  GAACTCTGATTTGAC------CTCAGAGATTACCGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCC  268

Query  200  GAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTC  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  GAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTC  342

Query  274  CTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCT  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  CTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCT  416

Query  348  CATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACA  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACA  490

Query  422  TTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGG  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  TTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGG  564

Query  496  GGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCA  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCA  638

Query  570  TCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGA  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  TCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGA  712

Query  644  TGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTAT  717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  TGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTAT  786

Query  718  GCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACAT  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACAT  860

Query  792  GGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  861  GGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAG----------------------------------------------  888

Query  866  ACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTG  939
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  -----------------------------CAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTG  933

Query  940  CTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCC  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  CTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCC  1007

Query 1014  CCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGA  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  CCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGA  1081

Query 1088  TCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAG  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  TCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAG  1155

Query 1162  GAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAG  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  GAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAG  1229

Query 1236  GAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTG  1309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230  GAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTG  1303

Query 1310  GCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACC  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304  GCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACC  1377

Query 1384  TATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCC  1457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378  TATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCC  1451

Query 1458  ACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCA  1531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452  ACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCA  1525

Query 1532  GGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCC  1605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526  GGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCC  1599

Query 1606  AAACCCAGATCAGTGGACCATCCCCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAAC  1679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600  AAACCCAGATCAGTGGACCATCCCCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAAC  1673

Query 1680  GGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGCGGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGC  1753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674  GGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGCGGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGC  1747

Query 1754  TCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTG  1827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748  TCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTG  1821

Query 1828  GCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGA  1901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822  GCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGA  1895

Query 1902  GCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896  GCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1944