Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03947
• Subject: XR_245152.2
• Aligned Length: 2484
• Identities: 1770
• Gaps: 714

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GAAGTAGAAGGCGGTGGCTGAGGCGGTTCCGGAGGTTCTAGTGTCGGAGTTGGGTGCAGGCAGGTGCCATGGGC  74

Query    1  -------------------------------------ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGG  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCTTGAGGCACACTGAGGGGACGCGGGGCTGGGCCATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGG  148

Query   38  CGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCAGGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCC  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCAGGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCC  222

Query  112  CGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCGGCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCT  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCGGCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCT  296

Query  186  GGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCC  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCC  370

Query  260  GGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGC  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGC  444

Query  334  AAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTT  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTT  518

Query  408  CAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACT  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACT  592

Query  482  ATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGA  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGA  666

Query  556  AGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATA  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATA  740

Query  630  CATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACA  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACA  814

Query  704  AAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAA  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAA  888

Query  778  GATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCC  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCC  962

Query  852  CGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAA  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAA  1036

Query  926  ACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGC  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGC  1110

Query 1000  TGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCT  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCT  1184

Query 1074  GAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGC  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGC  1258

Query 1148  TCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCT  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCT  1332

Query 1222  CTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAG  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAG  1406

Query 1296  ACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCA  1369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCA  1480

Query 1370  CTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGC  1443
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1481  CTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTT-----------  1543

Query 1444  CACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGG  1517
                                                                                      
Sbjct 1544  --------------------------------------------------------------------------  1543

Query 1518  GCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTC  1591
                                                                                      
Sbjct 1544  --------------------------------------------------------------------------  1543

Query 1592  CCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCCCCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGC  1665
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  ---------------------GATCAGTGGACCATCCCCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGC  1596

Query 1666  TGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGCGGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAG  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597  TGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGCGGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAG  1670

Query 1740  CTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGC  1813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671  CTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGC  1744

Query 1814  GCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATC  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745  GCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATC  1818

Query 1888  GGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG-----------  1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1819  GGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTGTGAAGAAGCCA  1892

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 1893  GCCCATGACATTTTCCTGCTCCTCTCTCAGCTGAGCCCTTAGCAGAGAATCAAAGCCATGCCTGGCCGAAGGGG  1966

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 1967  TACTTCCAGGTCAGGGGAAATTTCAGTCCCCCATCTCCATCATGAACATGGCAGCCCCAAAGCTGAGCAAGGCC  2040

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2041  AAAGACAGGGTTTTCCAACCCCCAGCCTCTTGACTGGTGACCACCACCCCTTCTTGTCACTGTCTCCCACCCAC  2114

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2115  CCCATCTTTGCTGGGATTCCCATCAACTCTCAGAACTGTGTGGGGTTTCCCTGGGGCCTTGTGGAAGCCATGAC  2188

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2189  TTCACAAAGACCCTACCTGTCAGTTCTTGTTTCTGGGGAGGAGGGATCACCTGCACTGAGAATGAGGCAGTTTG  2262

Query 1951  ------------------------------------------  1950
                                                      
Sbjct 2263  ACACAGATCACAAAATAAAATCAAAGTCTTTTTGAATAGCCA  2304