Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03965
• Subject: XM_005260806.4
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1086
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTCTGTCTGTCGAGCGAGGAGCCGCGCCGCCCGCTGCGAAGCGACATGGTCCACTTCCAGGCCTCGGA  74

Query   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCCAGCAGCTGCTACACAACAAGTTCGTGGTCATCTTGGGGGACTCCATTCAGAGGGCTGTGTACAAGGACC  148

Query  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGGGGGAGCTGAGCTTTGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGCTCTTGCTCCAGAAAGACTCACTGCTCACAGCTGCCCAGCTGAAAGCCAAGGGGGAGCTGAGCTTTGAA  222

Query  223  CAGGACCAGCTGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGTGAGGTCCGCCAGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGACCAGCTGGTGGCTGGGGGCCAGCTGGGCGAGCTGCACAACGGGACACAGTATCGTGAGGTCCGCCAGTT  296

Query  297  CTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTACTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCTCGGGCTCTGGCCACCACCTTGTGCGCTTCTACTTCCTCACTCGTGTTTACTCCGAGTACCTTGAGGATG  370

Query  371  TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGGAAGAGCTGACATATGGACCTGCCCCGGACCTGGTGATCATCAACTCCTGCCTCTGGGATCTCTCCAGA  444

Query  445  TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGGTCGCTGCTCAATGGAGAGCTACCGGGAGAACCTGGAGCGGGTGTTTGTGCGCATGGACCAAGTATTGCC  518

Query  519  AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACTCCTGCCTGCTGGTGTGGAACATGGCGATGCCCCTCGGGGAACGTATCACTGGGGGTTTCCTCCTGCCAG  592

Query  593  AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCCAGCCCCTGGCAGGCTCCCTGCGGCGGGATGTGGTTGAAGGGAACTTCTACAGTGCTACGCTGGCCGGG  666

Query  667  GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCACTGCTTTGATGTCCTAGACCTCCACTTTCACTTCCGGCATGCAGTACAGCACCGTCATCGGGATGGTGT  740

Query  741  CCACTGGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACTGGGACCAGCATGCACACCGCCACCTCTCACACCTGCTTCTGACCCATGTGGCTGACGCCTGGGGCGTGG  814

Query  815  AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCTGACCCGTGGATTGAGGACTGGGCAGAGATGAATCATCCATTCCAGGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  815  AGCTGCCCAAGCGTGGCTATCCCCCT------------------------------------------------  840

Query  889  AGCCATAGGCAGACCCCAGACTTCGGGGAGCACCTGGCCTTGCTCCCACCCCCACCTTCTTCTTTGCCTCCTCC  962
                                                                                      
Sbjct  841  --------------------------------------------------------------------------  840

Query  963  CATGCCTTTTCCCTACCCGCTTCCTCAGCCCTCGCCACCTCCCCTCTTCCCACCCCTGCCCCAGGATACCCCTT  1036
                                                                                      
Sbjct  841  --------------------------------------------------------------------------  840

Query 1037  TTTTCCCAGGCCAGCCCTTCCCACCCCATGAATTCTTCAACTATAATCCAGTGGAGGACTTCTCGATGCCACCC  1110
                                                                                      
Sbjct  841  --------------------------------------------------------------------------  840

Query 1111  CACTTAGGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCA  1184
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  ------GGATGTGGCCCTGGAGTGAACTTTGTGCCTGGCCCTCTGCCACCTCCAATCCCTGGCCCTAATCCCCA  908

Query 1185  TGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  909  TGGTCAGCACTGGGGCCCAGTGGTCCACCGGGGGATGCCACGCTATGTTCCTAACAGCCCCTACCATGTGCGGA  982

Query 1259  GAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  983  GAATGGGGGGGCCCTGCAGGCAGCGGCTCAGACACTCAGAGAGACTGATCCACACATACAAACTGGACAGACGG  1056

Query 1333  CCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  CCTCCTGCCCATTCGGGGACATGGCCTGGG  1086