Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03974
• Subject: NM_001134774.1
• Aligned Length: 1866
• Identities: 1635
• Gaps: 231

Alignment

Query    1  ATGGCCATGATGGTGTTTCCGCGGGAGGAGAAGCTGAGCCAGGATGAGATCGTGCTGGGCACCAAGGCTGTCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCATGATGGTGTTTCCGCGGGAGGAGAAGCTGAGCCAGGATGAGATCGTGCTGGGCACCAAGGCTGTCAT  74

Query   75  CCAGGGACTGGAGACTCTGCGTGGGGAGCATCGTGCCCTGCTGGCTCCTCTGGTTGCACCTGAGGCCGGCGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGGGACTGGAGACTCTGCGTGGGGAGCATCGTGCCCTGCTGGCTCCTCTGGTTGCACCTGAGGCCGGCGAAG  148

Query  149  CCGAGCCTGGCTCGCAGGAGCGCTGCATCCTCCTGCGTCGCTCCCTGGAAGCCATTGAGCTTGGGCTGGGGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGCCTGGCTCGCAGGAGCGCTGCATCCTCCTGCGTCGCTCCCTGGAAGCCATTGAGCTTGGGCTGGGGGAG  222

Query  223  GCCCAGGTGATCTTGGCATTGTCGAGCCACCTGGGGGCTGTAGAATCAGAGAAGCAGAAGCTGCGGGCGCAGGT  296
            ||||||                                                                    
Sbjct  223  GCCCAG--------------------------------------------------------------------  228

Query  297  GCGGCGTCTGGTGCAGGAGAACCAGTGGCTGCGTGAGGAGCTGGCGGGGACACAGCAGAAGCTGCAGCGCAGTG  370
                                                                                      
Sbjct  229  --------------------------------------------------------------------------  228

Query  371  AGCAGGCCGTGGCCCAGCTCGAGGAGGAGAAGCAGCACTTGCTGTTCATGAGCCAGATCCGCAAGTTGGATGAA  444
                                                                                      
Sbjct  229  --------------------------------------------------------------------------  228

Query  445  GACGCCTCCCCTAACGAGGAGAAGGGGGACGTCCCCAAAGACACACTGGATGACCTGTTCCCCAATGAGGATGA  518
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  229  ---------------GAGGAGAAGGGGGACGTCCCCAAAGACACACTGGATGACCTGTTCCCCAATGAGGATGA  287

Query  519  GCAGAGCCCAGCCCCTAGCCCAGGAGGAGGGGATGTGTCTGGTCAGCATGGGGGCTACGAGATCCCGGCCCGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  GCAGAGCCCAGCCCCTAGCCCAGGAGGAGGGGATGTGTCTGGTCAGCATGGGGGCTACGAGATCCCGGCCCGGC  361

Query  593  TCCGCACCCTGCACAACCTGGTGATCCAATACGCCTCACAGGGCCGCTACGAGGTAGCTGTGCCACTCTGCAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TCCGCACCCTGCACAACCTGGTGATCCAATACGCCTCACAGGGCCGCTACGAGGTAGCTGTGCCACTCTGCAAG  435

Query  667  CAGGCACTCGAAGACCTGGAGAAGACGTCAGGCCACGACCACCCTGACGTTGCCACCATGCTGAACATCCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  CAGGCACTCGAAGACCTGGAGAAGACGTCAGGCCACGACCACCCTGACGTTGCCACCATGCTGAACATCCTGGC  509

Query  741  ACTGGTCTATCGGGATCAGAACAAGTACAAGGAGGCTGCCCACCTGCTCAATGATGCTCTGGCCATCCGGGAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  ACTGGTCTATCGGGATCAGAACAAGTACAAGGAGGCTGCCCACCTGCTCAATGATGCTCTGGCCATCCGGGAGA  583

Query  815  AAACACTGGGCAAGGACCACCCAGCCGTGGCTGCGACACTAAACAACCTGGCAGTCCTGTATGGCAAGAGGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  AAACACTGGGCAAGGACCACCCAGCCGTGGCTGCGACACTAAACAACCTGGCAGTCCTGTATGGCAAGAGGGGC  657

Query  889  AAGTACAAGGAGGCTGAGCCATTGTGCAAGCGGGCACTGGAGATCCGGGAGAAGGTCCTGGGCAAGTTTCACCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  AAGTACAAGGAGGCTGAGCCATTGTGCAAGCGGGCACTGGAGATCCGGGAGAAGGTCCTGGGCAAGTTTCACCC  731

Query  963  AGATGTGGCCAAGCAGCTCAGCAACCTGGCCCTGCTGTGCCAGAACCAGGGCAAAGCTGAGGAGGTGGAATATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  AGATGTGGCCAAGCAGCTCAGCAACCTGGCCCTGCTGTGCCAGAACCAGGGCAAAGCTGAGGAGGTGGAATATT  805

Query 1037  ACTATCGGCGGGCACTGGAGATCTATGCTACACGCCTCGGGCCCGATGACCCCAATGTGGCCAAGACCAAGAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  ACTATCGGCGGGCACTGGAGATCTATGCTACACGCCTCGGGCCCGATGACCCCAATGTGGCCAAGACCAAGAAC  879

Query 1111  AACCTGGCTTCCTGCTACCTGAAGCAGGGCAAGTACCAGGATGCGGAGACCTTGTACAAGGAGATCCTCACCCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  AACCTGGCTTCCTGCTACCTGAAGCAGGGCAAGTACCAGGATGCGGAGACCTTGTACAAGGAGATCCTCACCCG  953

Query 1185  CGCTCATGAGAAAGAGTTTGGCTCTGTCAATGGGGACAACAAGCCCATCTGGATGCACGCAGAGGAGCGGGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  CGCTCATGAGAAAGAGTTTGGCTCTGTCAATGGGGACAACAAGCCCATCTGGATGCACGCAGAGGAGCGGGAGG  1027

Query 1259  AAAGCAAGGATAAGCGCCGGGACAGCGCCCCCTATGGGGAATACGGCAGCTGGTACAAGGCCTGTAAAGTAGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  AAAGCAAGGATAAGCGCCGGGACAGCGCCCCCTATGGGGAATACGGCAGCTGGTACAAGGCCTGTAAAGTAGAC  1101

Query 1333  AGCCCCACAGTCAACACCACCCTGCGCAGCTTGGGGGCCCTATACCGGCGCCAGGGCAAGCTGGAAGCCGCGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  AGCCCCACAGTCAACACCACCCTGCGCAGCTTGGGGGCCCTATACCGGCGCCAGGGCAAGCTGGAAGCCGCGCA  1175

Query 1407  CACACTAGAGGACTGTGCCAGCCGTAACCGCAAGCAGGGTTTGGACCCCGCAAGCCAGACCAAGGTGGTAGAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CACACTAGAGGACTGTGCCAGCCGTAACCGCAAGCAGGGTTTGGACCCCGCAAGCCAGACCAAGGTGGTAGAAC  1249

Query 1481  TGCTGAAAGATGGCAGTGGCAGGCGGGGAGACCGCCGCAGCAGCCGAGACATGGCTGGGGGTGCCGGGCCTCGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TGCTGAAAGATGGCAGTGGCAGGCGGGGAGACCGCCGCAGCAGCCGAGACATGGCTGGGGGTGCCGGGCCTCGG  1323

Query 1555  TCTGAGTCTGACCTCGAGGACGTGGGACCTACAGCTGAGTGGAATGGGGATGGCAGTGGCTCCTTGAGGCGCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  TCTGAGTCTGACCTCGAGGACGTGGGACCTACAGCTGAGTGGAATGGGGATGGCAGTGGCTCCTTGAGGCGCAG  1397

Query 1629  CGGTTCCTTTGGGAAACTCCGGGATGCCCTGAGGCGCAGCAGTGAGATGCTGGTAAAGAAGCTGCAGGGGGGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  CGGTTCCTTTGGGAAACTCCGGGATGCCCTGAGGCGCAGCAGTGAGATGCTGGTAAAGAAGCTGCAGGGGGGCA  1471

Query 1703  CCCCCCAGGAGCCCCCTAACCCCAGGATGAAGCGGGCCAGTTCCCTCAACTTCCTCAACAAGAGCGTGGAAGAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  CCCCCCAGGAGCCCCCTAACCCCAGGATGAAGCGGGCCAGTTCCCTCAACTTCCTCAACAAGAGCGTGGAAGAG  1545

Query 1777  CCGACCCAGCCTGGAGGCACAGGTCTCTCTGACAGCCGCACTCTCAGCTCCAGCTCCATGGACCTCTCCCGACG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  CCGACCCAGCCTGGAGGCACAGGTCTCTCTGACAGCCGCACTCTCAGCTCCAGCTCCATGGACCTCTCCCGACG  1619

Query 1851  AAGCTCCCTGGTGGGC  1866
            ||||||||||||||||
Sbjct 1620  AAGCTCCCTGGTGGGC  1635