Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03974
- Subject:
- XM_005274184.1
- Aligned Length:
- 1866
- Identities:
- 1797
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGGCCATGATGGTGTTTCCGCGGGAGGAGAAGCTGAGCCAGGATGAGATCGTGCTGGGCACCAAGGCTGTCAT 74
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Sbjct 1 ATGGCCATGATGGTGTTTCCGCGGGAGGAGAAGCTGAGCCAGGATGAGATCGTGCTGGGCACCAAGGCTGTCAT 74
Query 75 CCAGGGACTGGAGACTCTGCGTGGGGAGCATCGTGCCCTGCTGGCTCCTCTGGTTGCACCTGAGGCCGGCGAAG 148
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Sbjct 75 CCAGGGACTGGAGACTCTGCGTGGGGAGCATCGTGCCCTGCTGGCTCCTCTGGTTGCACCTGAGGCCGGCGAAG 148
Query 149 CCGAGCCTGGCTCGCAGGAGCGCTGCATCCTCCTGCGTCGCTCCCTGGAAGCCATTGAGCTTGGGCTGGGGGAG 222
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Sbjct 149 CCGAGCCTGGCTCGCAGGAGCGCTGCATCCTCCTGCGTCGCTCCCTGGAAGCCATTGAGCTTGGGCTGGGGGAG 222
Query 223 GCCCAGGTGATCTTGGCATTGTCGAGCCACCTGGGGGCTGTAGAATCAGAGAAGCAGAAGCTGCGGGCGCAGGT 296
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Sbjct 223 GCCCAGGTGATCTTGGCATTGTCGAGCCACCTGGGGGCTGTAGAATCAGAGAAGCAGAAGCTGCGGGCGCAGGT 296
Query 297 GCGGCGTCTGGTGCAGGAGAACCAGTGGCTGCGTGAGGAGCTGGCGGGGACACAGCAGAAGCTGCAGCGCAGTG 370
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Sbjct 297 GCGGCGTCTGGTGCAGGAGAACCAGTGGCTGCGTGAGGAGCTGGCGGGGACACAGCAGAAGCTGCAGCGCAGTG 370
Query 371 AGCAGGCCGTGGCCCAGCTCGAGGAGGAGAAGCAGCACTTGCTGTTCATGAGCCAGATCCGCAAGTTGGATGAA 444
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Sbjct 371 AGCAGGCCGTGGCCCAGCTCGAGGAGGAGAAGCAGCACTTGCTGTTCATGAGCCAGATCCGCAAGTTGGATGAA 444
Query 445 GACGCCTCCCCTAACGAGGAGAAGGGGGACGTCCCCAAAGACACACTGGATGACCTGTTCCCCAATGAGGATGA 518
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Sbjct 445 GACGCCTCCCCTAACGAGGAGAAGGGGGACGTCCCCAAAGACACACTGGATGACCTGTTCCCCAATGAGGATGA 518
Query 519 GCAGAGCCCAGCCCCTAGCCCAGGAGGAGGGGATGTGTCTGGTCAGCATGGGGGCTACGAGATCCCGGCCCGGC 592
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Sbjct 519 GCAGAGCCCAGCCCCTAGCCCAGGAGGAGGGGATGTGTCTGGTCAGCATGGGGGCTACGAGATCCCGGCCCGGC 592
Query 593 TCCGCACCCTGCACAACCTGGTGATCCAATACGCCTCACAGGGCCGCTACGAGGTAGCTGTGCCACTCTGCAAG 666
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Sbjct 593 TCCGCACCCTGCACAACCTGGTGATCCAATACGCCTCACAGGGCCGCTACGAGGTAGCTGTGCCACTCTGCAAG 666
Query 667 CAGGCACTCGAAGACCTGGAGAAGACGTCAGGCCACGACCACCCTGACGTTGCCACCATGCTGAACATCCTGGC 740
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Sbjct 667 CAGGCACTCGAAGACCTGGAGAAGACGTCAGGCCACGACCACCCTGACGTTGCCACCATGCTGAACATCCTGGC 740
Query 741 ACTGGTCTATCGGGATCAGAACAAGTACAAGGAGGCTGCCCACCTGCTCAATGATGCTCTGGCCATCCGGGAGA 814
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Sbjct 741 ACTGGTCTATCGGGATCAGAACAAGTACAAGGAGGCTGCCCACCTGCTCAATGATGCTCTGGCCATCCGGGAGA 814
Query 815 AAACACTGGGCAAGGACCACCCAGCCGTGGCTGCGACACTAAACAACCTGGCAGTCCTGTATGGCAAGAGGGGC 888
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Sbjct 815 AAACACTGGGCAAGGACCACCCAGCCGTGGCTGCGACACTAAACAACCTGGCAGTCCTGTATGGCAAGAGGGGC 888
Query 889 AAGTACAAGGAGGCTGAGCCATTGTGCAAGCGGGCACTGGAGATCCGGGAGAAGGTCCTGGGCAAGTTTCACCC 962
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Sbjct 889 AAGTACAAGGAGGCTGAGCCATTGTGCAAGCGGGCACTGGAGATCCGGGAGAAGGTCCTGGGCAAGTTTCACCC 962
Query 963 AGATGTGGCCAAGCAGCTCAGCAACCTGGCCCTGCTGTGCCAGAACCAGGGCAAAGCTGAGGAGGTGGAATATT 1036
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Sbjct 963 AGATGTGGCCAAGCAGCTCAGCAACCTGGCCCTGCTGTGCCAGAACCAGGGCAAAGCTGAGGAGGTGGAATATT 1036
Query 1037 ACTATCGGCGGGCACTGGAGATCTATGCTACACGCCTCGGGCCCGATGACCCCAATGTGGCCAAGACCAAGAAC 1110
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Sbjct 1037 ACTATCGGCGGGCACTGGAGATCTATGCTACACGCCTCGGGCCCGATGACCCCAATGTGGCCAAGACCAAGAAC 1110
Query 1111 AACCTGGCTTCCTGCTACCTGAAGCAGGGCAAGTACCAGGATGCGGAGACCTTGTACAAGGAGATCCTCACCCG 1184
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Sbjct 1111 AACCTGGCTTCCTGCTACCTGAAGCAGGGCAAGTACCAGGATGCGGAGACCTTGTACAAGGAGATCCTCACCCG 1184
Query 1185 CGCTCATGAGAAAGAGTTTGGCTCTGTCAATGGGGACAACAAGCCCATCTGGATGCACGCAGAGGAGCGGGAGG 1258
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Sbjct 1185 CGCTCATGAGAAAGAGTTTGGCTCTGTCAATGGGGACAACAAGCCCATCTGGATGCACGCAGAGGAGCGGGAGG 1258
Query 1259 AAAGCAAGGATAAGCGCCGGGACAGCGCCCCCTATGGGGAATACGGCAGCTGGTACAAGGCCTGTAAAGTAGAC 1332
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Sbjct 1259 AAAGCAAGGATAAGCGCCGGGACAGCGCCCCCTATGGGGAATACGGCAGCTGGTACAAGGCCTGTAAAGTAGAC 1332
Query 1333 AGCCCCACAGTCAACACCACCCTGCGCAGCTTGGGGGCCCTATACCGGCGCCAGGGCAAGCTGGAAGCCGCGCA 1406
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Sbjct 1333 AGCCCCACAGTCAACACCACCCTGCGCAGCTTGGGGGCCCTATACCGGCGCCAGGGCAAGCTGGAAGCCGCGCA 1406
Query 1407 CACACTAGAGGACTGTGCCAGCCGTAACCGCAAGCAGGGTTTGGACCCCGCAAGCCAGACCAAGGTGGTAGAAC 1480
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Sbjct 1407 CACACTAGAGGACTGTGCCAGCCGTAACCGCAAGCAGGGTTTGGACCCCGCAAGCCAGACCAAGGTGGTAGAAC 1480
Query 1481 TGCTGAAAGATGGCAGTGGCAGGCGGGGAGACCGCCGCAGCAGCCGAGACATGGCTGGGGGTGCCGGGCCTCGG 1554
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Sbjct 1481 TGCTGAAAGATGGCAGTGGCAGGCGGGGAGACCGCCGCAGCAGCCGAGACATGGCTGGGGGTGCCGGGCCTCGG 1554
Query 1555 TCTGAGTCTGACCTCGAGGACGTGGGACCTACAGCTGAGTGGAATGGGGATGGCAGTGGCTCCTTGAGGCGCAG 1628
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Sbjct 1555 TCTGAGTCTGACCTCGAGGACGTGGGACCTACAGCTGAGTGGAATGGGGATGGCAGTGGCTCCTTGAGGCGCAG 1628
Query 1629 CGGTTCCTTTGGGAAACTCCGGGATGCCCTGAGGCGCAGCAGTGAGATGCTGGTAAAGAAGCTGCAGGGGGGCA 1702
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Sbjct 1629 CGGTTCCTTTGGGAAACTCCGGGATGCCCTGAGGCGCAGCAGTGAGATGCTGGTAAAGAAGCTGCAGGGGGGCA 1702
Query 1703 CCCCCCAGGAGCCCCCTAACCCCAGGATGAAGCGGGCCAGTTCCCTCAACTTCCTCAACAAGAGCGTGGAAGAG 1776
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Sbjct 1703 CCCCCCAGGAGCCCCCTAACCCCAGGATGAAGCGGGCCAGTTCCCTCAACTTCCTCAACAAGAGCGTGGAAGAG 1776
Query 1777 CCGACCCAGCCTGGAGGCACAGGTCTCTCTGACAGCCGCACTCTCAGCTCCAGCTCCATGGACCTCTCCCGACG 1850
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Sbjct 1777 CCGACCCAG----------CAGGGCCCTCT-----------TCCC----------------------------- 1800
Query 1851 AAGCTCCCTGGTGGGC 1866
Sbjct 1801 ---------------- 1800