Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03979
• Subject: NM_181732.4
• Aligned Length: 918
• Identities: 859
• Gaps: 3

Alignment

Query   1  ATGTCGGAGGTGACCCGGAGTCTGCTGCAGCGCTGGGGCGCCAGTTTTAGGAGAGGCGCCGACTTCGACTCTTG  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCGGAGGTGACCCGGAGTCTGCTGCAGCGCTGGGGCGCCAGTCTTAGGAGAGGCGCCGACTTCGACTCTTG  74

Query  75  GGGCCAGCTGGTGGAGGCGATAGACGAGTATCAGATATTAGCAAGACATCTACAAAAGGAGGCCCAAGCTCAAC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  75  GGGCCAGCTGGTGGAGGCGATAGACGAGTATCAGATATTAGCAAGACACTTACAGAAGGAGGCCCAAGCTCAAC  148

Query 149  ACAATAATTCTGAATTCACAGAAGAACAAAAGAAAACCATAGGCAAAATTGCAACATGCTTGGAATTGCGAAGT  222
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 149  ACAATAATTCTGAATTTACAGAAGAACAAAAGAAAACCATAGGCAAAATTGCGACATGTTTGGAATTGCGAAGT  222

Query 223  GCAGCTTTACAGTCCACACAGTCTCAAGAAGAATTTAAACTGGAGGACCTGAAGAAGCTAGAACCAATCCTAAA  296
           |||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223  GCAGCATTACAGTCCACACAGTCCCAAGAAGAGTTTAAACTGGAGGACCTGAAGAAGCTAGAACCAATCCTGAA  296

Query 297  GAATATTCTTACATATAATAAAGAATTCCCATTTGATGTTCAGCCTGTCCCATTAAGAAGAATTTTGGCACCTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 297  GAATATTCTTACATATAATAAAGAATTCCCATTTGATGTTCAGCCTATTCCATTAAGACGTATTTTAGCACCTG  370

Query 371  GTGAAGAAGAGAATTTGGAATTTGAAGAAGATGAAGAAGAGGGTGGTGCTGGAGCAGGGTCTCCTGATTCTTTT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 371  GTGAAGAAGAGAATTTGGAATTTGAAGAAGATGAAGAA---GGTGGTGCTGGAGCAGGGCCTCCTGATTCTTTC  441

Query 445  CCTGCTAGAGTTCCCGGTACTTTATTACCAAGGTTGCCATCGGAACCAGGAATGACATTACTCACTATCAGAAT  518
           .|||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 442  TCTGCTAGAGTTCCTGGTACTTTATTGCCACGGTTGCCATCGGAACCAGGGATGACGTTACTCACCATCAGGAT  515

Query 519  TGAGAAAATTGGTTTGAAAGATGCTGGGCAGTGCATCGATCCCTATATTACAGTTAGTGTAAAGGATCTGAATG  592
           ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||.||||||
Sbjct 516  TGAGAAAATTGGTTTGAAAGATGCGGGGCAGTGCATCGATCCCTACATCACAGTCAGCGTGAAAGATTTGAATG  589

Query 593  GCATAGACTTAACTCCTGTGCAAGATACTCCTGTGGCTTCAAGAAAAGAAGATACATATGTTCATTTTAATGTG  666
           |||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 590  GCATAGATTTAACTCCCGTACAAGACACTCCTGTGGCTTCAAGGAAAGAAGATACTTACGTTCACTTTAATGTG  663

Query 667  GACATTGAGCTCCAGAAGCATGTTGAAAAATTAACCAAAGGTGCAGCTATCTTCTTTGAATTCAAACACTACAA  740
           |||||||||||||||||.||.|||||||..||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 664  GACATTGAGCTCCAGAAACACGTTGAAAGGTTAACCAAAGGTGCGGCCATTTTCTTTGAATTCAAACATTACAA  737

Query 741  GCCTAAAAAAAGGTTTACCAGCACCAAGTGTTTTGCTTTCATGGAGATGGATGAAATTAAACCTGGGCCAATTG  814
           |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 738  GCCTAAAAAGAGGTTTACCAGCACTAAGTGTTTTGCCTTCATGGAGATGGATGAAATTAAACCTGGGCCAATCG  811

Query 815  TAATAGAACTATACAAGAAACCCACTGACTTTAAAAGAAAGAAATTGCAATTATTGACCAAGAAACCACTTTAT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 812  TAATAGAACTATACAAGAAACCCACTGACTTTAAAAGAAAGAAATTGCAATTGTTGACCAAGAAACCACTTTAT  885

Query 889  CTTCATCTACATCAAACTTTGCACAAGGAA  918
           ||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 886  CTTCATCTACATCAAAGTTTGCACAAGGAA  915