Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: NM_001146319.3
• Aligned Length: 1346
• Identities: 1274
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGACTGAA--CTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAG------CCTGCGA-------AAG---------TGCT  50
            |||||  ||  ..||||||||...|..||| ||.||||      .|.||.|       |||         |||.
Sbjct    1  ATGAC--AAGGAGACAGCAAGTCCTACAAG-CAAAAAGGAGCATTCAGCAAACATTCCAAGCACAGCTTATGCC  71

Query   51  CGGGAAGA-----------GGGAGAGCAAACT--------TGGCTCAG--CC-----CACTCAGAGGCTGAGAA  98
            |.||||||           |||||||  ||.|        |||.||.|  ||     |.|||||||||||||||
Sbjct   72  CTGGAAGAGTATGTTCCACGGGAGAG--AAGTGAAGCCAGTGGGTCCGGACCTGGAACTCTCAGAGGCTGAGAA  143

Query   99  TGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCATCTGTGGAGGCGGACT  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  TGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCATCTGTGGAGGCGGACT  217

Query  173  CCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAG  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  CCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAG  291

Query  247  AACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAA  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  AACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAA  365

Query  321  GGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTG  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  GGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTG  439

Query  395  CTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTC  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  CTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTC  513

Query  469  TTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCT  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  TTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCT  587

Query  543  AGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAA  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  AGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAA  661

Query  617  CTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCT  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  CTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCT  735

Query  691  GCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGA  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  GCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGA  809

Query  765  TGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGA  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  TGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGA  883

Query  839  ACTCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGG  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  ACTCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGG  957

Query  913  GCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGT  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  GCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGT  1031

Query  987  TGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTG  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  TGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTG  1105

Query 1061  TCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTA  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  TCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTA  1179

Query 1135  ACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGT  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  ACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGT  1253

Query 1209  GGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGC  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  GGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGC  1327

Query 1283  TTGAGAATGGTGAC  1296
            ||||||||||||||
Sbjct 1328  TTGAGAATGGTGAC  1341