Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04000
- Subject:
- NM_001146321.2
- Aligned Length:
- 1339
- Identities:
- 1277
- Gaps:
- 62
Alignment
Query 1 ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------ATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG 55
Query 75 CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC 129
Query 149 CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATG------------------- 203
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGCCCATATCTTCTCTCCAAA 203
Query 204 ------------------------GTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACT 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TCTATGCTTCATTCAGGACCAAGAGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACT 277
Query 254 GTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAAT 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 GTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAAT 351
Query 328 ATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACA 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 ATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACA 425
Query 402 GAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAA 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 GAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAA 499
Query 476 AAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCA 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 AAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCA 573
Query 550 AACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAA 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 AACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAA 647
Query 624 ACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAA 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 ACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAA 721
Query 698 ACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTG 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 ACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTG 795
Query 772 GTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 GTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG 869
Query 846 AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATG 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATG 943
Query 920 CCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATC 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 CCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATC 1017
Query 994 TTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGC 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGC 1091
Query 1068 ACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCA 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 ACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCA 1165
Query 1142 TTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTT 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTT 1239
Query 1216 CTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAA 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 CTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAA 1313
Query 1290 TGGTGAC 1296
|||||||
Sbjct 1314 TGGTGAC 1320