Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: NM_001349541.2
• Aligned Length: 1299
• Identities: 1296
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG  74

Query   75  CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC  148

Query  149  CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGAT  222

Query  223  GGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAA  296

Query  297  GTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAAC  370

Query  371  CACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAAC  444

Query  445  TGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAAT  518

Query  519  AAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTG  592

Query  593  TCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTT  666

Query  667  GGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTT  740

Query  741  CAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTG  814

Query  815  GTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG---AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTC  885
            |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCGAGTAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTC  888

Query  886  TCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCT  962

Query  960  CCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACC  1036

Query 1034  ATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAAT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAAT  1110

Query 1108  ACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGG  1184

Query 1182  CCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAA  1258

Query 1256  AGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  1296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  1299