Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: NM_026240.2
• Aligned Length: 1296
• Identities: 1111
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG  74
            |||||.||.||.||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||||||...|||||.||..|||||.||||
Sbjct    1  ATGACCGAGCTCCAGCAAGAGGTGGAGGACGCCAAGCCAGCCAAAGTGCTCACCAAGAGAGAAGGCAAAGTTGG  74

Query   75  CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC  148
            |.|.|||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||..|.|.|||.||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCCGGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGCGGAGGACAGAAGGAGGGTCAGCAAGTCGCCAACAGCCCAATCTC  148

Query  149  CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGAT  222
            |||||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||||..|.|.||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTACCTCATCTGTGGAGGCCGAGTCCCCGGACCAGAAGAGGAGCCTTGGCCTGTGGTCAAAATCCAGTTTTGAT  222

Query  223  GGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAA  296
            |||.||..|||....|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|.||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  223  GGTTCCAGTTTGTTGAGTGATAAGAATGACTGTAAAACTGAAAGCAAGACTGACTCTAAGACCGAAAGAAAAAA  296

Query  297  GTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAAC  370
            |||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||...|||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GTCTTCATCGTCTAGTCAGTACAAGGCGAACATGCACTTTCACAAGTTATTCCTGGATGTCCCAACTGAGGAGC  370

Query  371  CACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAAC  444
            ||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  371  CACTGAGGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTTCAGAAAGAAATTCTGTACCAAGGAAAGCTCTTTGTGTCGGAAAAC  444

Query  445  TGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  445  TGGATTTGTTTTCATTCCAAGGTCTTTGGAAAAGACACTAAGATCTCCATTCCAGCTTTCTCGGTAACCTTGAT  518

Query  519  AAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTG  592
            .|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CAAGAAAACCAAAACTGCCCTTCTGGTGCCAAACGCCCTGATCATCGCGACGGTCACAGACAGGTACATATTCG  592

Query  593  TCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTT  666
            |.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  TTTCCTTGCTGTCCAGAGACTCAACCTACAAACTGATAAAATCTGTGTGCGGACACTTAGAGAACACAAGTGTT  666

Query  667  GGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTT  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTAACAGTCCCAACCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGGGCAGATCGCCCTTCGTCTCTGCCTCTGGATTT  740

Query  741  CAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTG  814
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  CAATGATGAATTCTCAGACCTGGACGGAGTGGTTCGACAACGAAGGCAAGACTTGGAAGGATACAGCAGCTCAG  814

Query  815  GTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCC  888
            |.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|.|||.|||||.||.|||||||||||||||.|.
Sbjct  815  GATCCCAGACTCCGGAATCTGAGAACTCCCGAGACTTCCACGTGACCGAATCTCAGACAGTTCTGAATGTCACA  888

Query  889  AAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCC  962
            |||||||||.||||.|||.|||||.||||||||||.|.||.|||||.||||||.|||||||||||||..||.||
Sbjct  889  AAGGGAGAAACAAAACCACCTCGGACAGATGCCCACGGGAGCAGAGCACCTGATGGAAAAGCCAAGATCCTGCC  962

Query  963  TGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATA  1036
            ||..||.||||..|||||||||.|||||||.|||||||||.|..||||||.|||.||.||||..||.||.||.|
Sbjct  963  TGCCCATGGTCAATCAGAAACTATTGGAATTTTACATAAAATGGAGTCTCGGAAGTGCCCGACTCTCCATCACA  1036

Query 1037  TTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACT  1110
            |.||.|||.|||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1037  TCCTGATAGTCTATGCAATTATTGTCTGTGCCCTGATCATCTCCACCTTCTACATGAGATACAGGATTAACACT  1110

Query 1111  CTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCT  1184
            ||||||||||..||||||...||.||.|||||..||||..||||.|.||||||.|||.||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  CTGGAGGAGCGCCTGGGGACCCTGACGTCCATCATGGATCCCCACAGTACTGAGCAGACAGCCCCATCCGGCCT  1184

Query 1185  GAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGA  1258
            |.|.||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  GGGATCACAAATGCAGTTAAATGTGGAGGTCCTCTGCCAAGAACTTACAGCTAACATAGTGAAATTGGAAAAGA  1258

Query 1259  TACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  1296
            |||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACAAAACAACTTACAAAAGCTGCTTGAGAATGGTGAC  1296