Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04000
- Subject:
- XM_005272057.4
- Aligned Length:
- 1364
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGC--------GAAA--GTGCT-------------- 50
|||..||||| ||||.|||| ||.| |||.|
Sbjct 1 -------------------ATGGTGAAGA---AAAGGCTGCCTTCTAGTGACACGGTGTTCCGGTTTGAGACTC 52
Query 51 CGGGAAG----AGGGAGAGCAAACTTGG----CT----------------CAGCCC-----------------A 83
||||.|| |||.|| ||.|||.||| || |||||| .
Sbjct 53 CGGGCAGCCCAAGGAAG-GCCAACGTGGAGGCCTCACGCAGCTCCACAGACAGCCCCAGCTCGGTGTTCCTCAG 125
Query 84 CTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCAT 157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 CTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCAT 199
Query 158 CTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCT 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 CTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCT 273
Query 232 TTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATC 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 TTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATC 347
Query 306 TTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGC 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 TTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGC 421
Query 380 AAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGT 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 AAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGT 495
Query 454 TTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAAC 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 TTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAAC 569
Query 528 CAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTAC 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 CAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTAC 643
Query 602 TCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGT 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 TCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGT 717
Query 676 CCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGA 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGA 791
Query 750 ATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAA 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 ATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAA 865
Query 824 CTCCTGAATCTGAGAACTCTCG---AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGA 894
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 CTCCTGAATCTGAGAACTCTCGAGTAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGA 939
Query 895 GAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACA 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 GAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACA 1013
Query 969 GGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 GGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTA 1087
Query 1043 TATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAG 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 TATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAG 1161
Query 1117 GAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTC 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 GAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTC 1235
Query 1191 ACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAA 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 ACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAA 1309
Query 1265 ATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 ATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC 1341