Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: XM_005272058.4
• Aligned Length: 1361
• Identities: 1263
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGC--------GAAA--GTGCT--------------  50
                               |||..|||||   ||||.||||        ||.|  |||.|              
Sbjct    1  -------------------ATGGTGAAGA---AAAGGCTGCCTTCTAGTGACACGGTGTTCCGGTTTGAGACTC  52

Query   51  CGGGAAG----AGGGAGAGCAAACTTGG----CT----------------CAGCCC-----------------A  83
            ||||.||    |||.|| ||.|||.|||    ||                ||||||                 .
Sbjct   53  CGGGCAGCCCAAGGAAG-GCCAACGTGGAGGCCTCACGCAGCTCCACAGACAGCCCCAGCTCGGTGTTCCTCAG  125

Query   84  CTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCAT  157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  CTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCAT  199

Query  158  CTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCT  231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  CTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCT  273

Query  232  TTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATC  305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  TTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATC  347

Query  306  TTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGC  379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  TTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGC  421

Query  380  AAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGT  453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  AAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGT  495

Query  454  TTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAAC  527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  TTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAAC  569

Query  528  CAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTAC  601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  CAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTAC  643

Query  602  TCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGT  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  TCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGT  717

Query  676  CCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGA  749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  CCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGA  791

Query  750  ATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAA  823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  ATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAA  865

Query  824  CTCCTGAATCTGAGAACTCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAA  897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  CTCCTGAATCTGAGAACTCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAA  939

Query  898  GCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGG  971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  GCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGG  1013

Query  972  TCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATAT  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  TCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATAT  1087

Query 1046  TCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAG  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAG  1161

Query 1120  CAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACA  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  CAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACA  1235

Query 1194  AGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATA  1267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  AGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATA  1309

Query 1268  ACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  1296
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310  ACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  1338