Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: XM_006525494.1
• Aligned Length: 1347
• Identities: 1103
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGACTGAA------------CTACAG---CAAGATGTGGA------AGACACAAAGC--CTGCGAA----AGT  47
            ||| .||||            ||.|||   |||..|||..|      |||..|..|||  || ||||    |||
Sbjct    1  ATG-GTGAAGAAACGGCTTTCCTCCAGTGACAATGTGTTCAAGTTCGAGATCCCCAGCAACT-CGAAGACCAGT  72

Query   48  GCTCGGGAAGAGG-----------------GAGAG--CAAACT-----TGGCTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGA  97
            |||      ||||                 ||.||  |||.||     |..|||||    ||||||||||||||
Sbjct   73  GCT------GAGGCCCCACACAGCTCCACTGACAGCCCAAGCTCCGTGTTTCTCAG----CTCAGAGGCTGAGA  136

Query   98  ATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCCCTACCCCATCTGTGGAGGCGGAC  171
            ||||||.||||||.|.||.||..|.|.|||.||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct  137  ATGGTGCGGAGGACAGAAGGAGGGTCAGCAAGTCGCCAACAGCCCAATCTCCTACCTCATCTGTGGAGGCCGAG  210

Query  172  TCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAA  245
            |||||.||||||||||..|.|.||.||||.||||||||||||||||||||||||.||..|||....||||||||
Sbjct  211  TCCCCGGACCAGAAGAGGAGCCTTGGCCTGTGGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTTCCAGTTTGTTGAGTGATAA  284

Query  246  GAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACA  319
            |||.|||||||||||.||||||||.|.||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  285  GAATGACTGTAAAACTGAAAGCAAGACTGACTCTAAGACCGAAAGAAAAAAGTCTTCATCGTCTAGTCAGTACA  358

Query  320  AGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGT  393
            ||||.||.|||||||||||||||||.||.||...|||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct  359  AGGCGAACATGCACTTTCACAAGTTATTCCTGGATGTCCCAACTGAGGAGCCACTGAGGCAAAGCTTTACCTGT  432

Query  394  GCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGT  467
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  433  GCTCTTCAGAAAGAAATTCTGTACCAAGGAAAGCTCTTTGTGTCGGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAGGT  506

Query  468  CTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTC  541
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  507  CTTTGGAAAAGACACTAAGATCTCCATTCCAGCTTTCTCGGTAACCTTGATCAAGAAAACCAAAACTGCCCTTC  580

Query  542  TAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCA  615
            |.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct  581  TGGTGCCAAACGCCCTGATCATCGCGACGGTCACAGACAGGTACATATTCGTTTCCTTGCTGTCCAGAGACTCA  654

Query  616  ACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTC  689
            ||.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  655  ACCTACAAACTGATAAAATCTGTGTGCGGACACTTAGAGAACACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAACCCATCTTC  728

Query  690  TGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGG  763
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  729  TGCTGAAAACAGTTTCCGGGCAGATCGCCCTTCGTCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGACCTGG  802

Query  764  ATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAG  837
            |.||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  803  ACGGAGTGGTTCGACAACGAAGGCAAGACTTGGAAGGATACAGCAGCTCAGGATCCCAGACTCCGGAATCTGAG  876

Query  838  AACTCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCG  911
            |||||.|||||.|||||.|.|||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||.||||.|||.||||
Sbjct  877  AACTCCCGAGACTTCCACGTGACCGAATCTCAGACAGTTCTGAATGTCACAAAGGGAGAAACAAAACCACCTCG  950

Query  912  GGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTG  985
            |.||||||||||.|.||.|||||.||||||.|||||||||||||..||.||||..||.||||..|||||||||.
Sbjct  951  GACAGATGCCCACGGGAGCAGAGCACCTGATGGAAAAGCCAAGATCCTGCCTGCCCATGGTCAATCAGAAACTA  1024

Query  986  TTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTT  1059
            |||||||.|||||||||.|..||||||.|||.||.||||..||.||.||.||.||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 1025  TTGGAATTTTACATAAAATGGAGTCTCGGAAGTGCCCGACTCTCCATCACATCCTGATAGTCTATGCAATTATT  1098

Query 1060  GTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACT  1133
            ||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||..||||||...||
Sbjct 1099  GTCTGTGCCCTGATCATCTCCACCTTCTACATGAGATACAGGATTAACACTCTGGAGGAGCGCCTGGGGACCCT  1172

Query 1134  AACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATG  1207
            .||.|||||..||||..||||.|.||||||.|||.||||.|||||.||||||.|.||||||.|.||.||.||||
Sbjct 1173  GACGTCCATCATGGATCCCCACAGTACTGAGCAGACAGCCCCATCCGGCCTGGGATCACAAATGCAGTTAAATG  1246

Query 1208  TGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTG  1281
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||.||
Sbjct 1247  TGGAGGTCCTCTGCCAAGAACTTACAGCTAACATAGTGAAATTGGAAAAGATACAAAACAACTTACAAAAGCTG  1320

Query 1282  CTTGAGAATGGTGAC  1296
            |||||||||||||||
Sbjct 1321  CTTGAGAATGGTGAC  1335