Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04000
- Subject:
- XM_011543592.3
- Aligned Length:
- 1492
- Identities:
- 1265
- Gaps:
- 218
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAAACAAAAGGGGTGGGGGTTCCCAGCAGGAAGGCTCACACCTGCAGGAGGCCACACGTGAGCGTGTGTAC 74
Query 1 ----------------------------------------ATGA----CTGAACTACAGCA-AG---ATGTGGA 26
.||| ||| |..||||| || |||
Sbjct 75 ATGTGCGTGTGTGCTTGTGCAGGGCGCTCCCAGCCTCCAGGTGATCTGCTG--CCCCAGCACAGCCCATG---- 142
Query 27 AGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGA----AGA---GGGAG--AGCAA----AC-----TTGGC------- 75
||.||| ||.|||.||.| ||| ||||| ||||| || .||||
Sbjct 143 -----CAGAGC-------AGAGCTGGGCAGCACAGACCTGGGAGCCAGCAAGTCCACACAGTCTGGCATTTACA 204
Query 76 ------TCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCA 143
.||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 AGTGAAACAG----CTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCA 274
Query 144 ATCCCCTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATG-------------- 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 ATCCCCTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGCCCATATCTTCTCT 348
Query 204 -----------------------------GTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAA 248
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CCAAATCTATGCTTCATTCAGGACCAAGAGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAA 422
Query 249 CGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGG 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 CGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGG 496
Query 323 CCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCT 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCT 570
Query 397 CTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTT 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 CTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTT 644
Query 471 TGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAG 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 TGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAG 718
Query 545 TGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACT 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACT 792
Query 619 TACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGC 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGC 866
Query 693 TGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATG 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 TGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATG 940
Query 767 GAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAAC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 GAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAAC 1014
Query 841 TCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGC 914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 TCTCGAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGC 1088
Query 915 AGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTG 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 AGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTG 1162
Query 989 GAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTC 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 GAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTC 1236
Query 1063 TGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAAC 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 TGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAAC 1310
Query 1137 CTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGG 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGG 1384
Query 1211 AGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTT 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 AGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTT 1458
Query 1285 GAGAATGGTGAC 1296
||||||||||||
Sbjct 1459 GAGAATGGTGAC 1470