Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: XM_017009782.1
• Aligned Length: 1339
• Identities: 1199
• Gaps: 140

Alignment

Query    1  ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC  148
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------ATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC  51

Query  149  CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATG-------------------  203
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct   52  CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGCCCATATCTTCTCTCCAAA  125

Query  204  ------------------------GTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACT  253
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  TCTATGCTTCATTCAGGACCAAGAGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACT  199

Query  254  GTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAAT  327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  GTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAAT  273

Query  328  ATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACA  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  ATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACA  347

Query  402  GAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAA  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  GAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAA  421

Query  476  AAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCA  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  AAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCA  495

Query  550  AACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAA  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  AACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAA  569

Query  624  ACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAA  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  ACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAA  643

Query  698  ACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTG  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  ACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTG  717

Query  772  GTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  GTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG  791

Query  846  AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATG  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATG  865

Query  920  CCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  CCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATC  939

Query  994  TTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGC  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  TTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGC  1013

Query 1068  ACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCA  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  ACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCA  1087

Query 1142  TTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTT  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTT  1161

Query 1216  CTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAA  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  CTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAA  1235

Query 1290  TGGTGAC  1296
            |||||||
Sbjct 1236  TGGTGAC  1242