Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04000
• Subject: XM_017009784.1
• Aligned Length: 1299
• Identities: 984
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGGTCAAAATCCAGTTTTGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACTGTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAAC  370
                  ||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------AT----------GTACAAGGCCAATATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAAC  58

Query  371  CACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  CACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACAGAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAAC  132

Query  445  TGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  TGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAAAAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAAT  206

Query  519  AAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  AAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCAAACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTG  280

Query  593  TCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  TCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAAACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTT  354

Query  667  GGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  GGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAAACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTT  428

Query  741  CAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  CAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTGGTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTG  502

Query  815  GTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG---AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTC  885
            |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  GTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCGAGTAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTC  576

Query  886  TCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCT  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  TCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAGATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCT  650

Query  960  CCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGAATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACC  724

Query 1034  ATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAAT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  ATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTGTGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAAT  798

Query 1108  ACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  ACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCTCCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGG  872

Query 1182  CCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  CCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAGGTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAA  946

Query 1256  AGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  1296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  AGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGAGAATGGTGAC  987