Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04000
- Subject:
- XM_024446201.1
- Aligned Length:
- 1342
- Identities:
- 1199
- Gaps:
- 143
Alignment
Query 1 ATGACTGAACTACAGCAAGATGTGGAAGACACAAAGCCTGCGAAAGTGCTCGGGAAGAGGGAGAGCAAACTTGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCAGCCCACTCAGAGGCTGAGAATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------ATGGTGTGGAGGAGAAAAAGAAAGCCTGCAGGTCGCCAACAGCCCAATCCC 51
Query 149 CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATG------------------- 203
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 CTACCCCATCTGTGGAGGCGGACTCCCCAGACCAGAAGAAAATCATTAGCCTATGCCCATATCTTCTCTCCAAA 125
Query 204 ------------------------GTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACT 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 TCTATGCTTCATTCAGGACCAAGAGTCAAAATCCAGTTTTGATGGTGCCTCTTTAGCAAGTGATAAGAACGACT 199
Query 254 GTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAAT 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 GTAAAACAGAAAGCAAAAATGACCCTAAGACTGAAAGAAAAAAGTCTTCATCTTCCAGCCAGTACAAGGCCAAT 273
Query 328 ATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACA 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 ATGCACTTTCACAAGTTGTTTCTTAGTGTCCCAACGGAGGAACCACTGAAGCAAAGCTTTACCTGTGCTCTACA 347
Query 402 GAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAA 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 GAAAGAAATACTATACCAAGGAAAGCTCTTTGTATCAGAAAACTGGATTTGTTTTCATTCCAAAGTCTTTGGAA 421
Query 476 AAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCA 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 AAGACACAAAGATCTCTATTCCAGCTTTCTCGGTAACCCTAATAAAGAAAACCAAAACTGCTCTTCTAGTGCCA 495
Query 550 AACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAA 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 AACGCCCTGATCATAGCAACAGTCACAGACAGGTACATATTTGTCTCCTTACTCTCCAGAGATTCAACTTACAA 569
Query 624 ACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAA 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 ACTACTAAAATCTGTGTGTGGACACTTAGAAAATACAAGTGTTGGTAACAGTCCCAATCCATCTTCTGCTGAAA 643
Query 698 ACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTG 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 ACAGTTTCCGAGCAGACCGCCCTTCATCTCTGCCTCTGGATTTCAATGATGAATTCTCAGATCTGGATGGAGTG 717
Query 772 GTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 GTTCAACAAAGAAGGCAAGACATGGAAGGATATAGCAGTTCTGGTTCTCAAACTCCTGAATCTGAGAACTCTCG 791
Query 846 ---AGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAG 916
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 AGTAGATTTCCATGCGACAGAATCCCAAACAGTTCTGAATGTCTCCAAGGGAGAAGCAAAGCCAACTCGGGCAG 865
Query 917 ATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGA 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 ATGCCCATGTGAACAGAGTACCTGAAGGAAAAGCCAAGAGTCTCCCTGTACAGGGTCTGTCAGAAACTGTTGGA 939
Query 991 ATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTG 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 ATCTTACATAAAGTCAAGTCTCAGAAATGTCCGATGCTTCACCATATTCTTATATTCTATGCAATTGTTGTCTG 1013
Query 1065 TGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCT 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 TGCACTAATCATCTCGACCTTCTACATGAGATACAGAATTAATACTCTGGAGGAGCAGCTGGGGTTACTAACCT 1087
Query 1139 CCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAG 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 CCATTGTGGACACCCATAATACTGAACAGGCAGCACCATCTGGCCTGAGGTCACAAGTACAATTCAATGTGGAG 1161
Query 1213 GTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGA 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 GTTCTCTGTCAAGAGCTTACAGCTAACATAGTGAAATTAGAAAAGATACAAAATAACTTACAGAAGTTGCTTGA 1235
Query 1287 GAATGGTGAC 1296
||||||||||
Sbjct 1236 GAATGGTGAC 1245