Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04024
• Subject: XM_024448162.1
• Aligned Length: 2211
• Identities: 2015
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGAAACTCCTCTGGGGGGACATTATGGAGCTGGAAGCACCCTTGGAGGAGTCCGAGAGCCAGAAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGAGGCAAAAGAGTGACAGAAGGAAGTCAAGGCACCATTATGACTCGGATGAGAAATCAGAAACAAGAGAAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGTGTTACAGATGACCTGGATGCTCCCAAGGCCAAAAAATCTAAAATGAAAGAGAAGCTAAATGGAGACACT  222
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------ATGAAAGAGAAGCTAAATGGAGACACT  27

Query  223  GAAGAAGGATTTAATAGACTTTCAGATGAATTCTCCAAATCTCATAAGTCAAGAAGAAAAGATCTACCAAATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   28  GAAGAAGGATTTAATAGACTTTCAGATGAATTCTCCAAATCTCATAAGTCAAGAAGAAAAGATCTACCAAATGG  101

Query  297  AGATATAGATGAATATGAAAAAAAATCAAAGCGAGTATCATCTTTAGATACTTCTACTCATAAATCAAGTGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  AGATATAGATGAATATGAAAAAAAATCAAAGCGAGTATCATCTTTAGATACTTCTACTCATAAATCAAGTGATA  175

Query  371  ATAAACTAGAGGAGACCTTAACACGTGAACAGAAAGAAGGAGCCTTCTCCAATTTTCCTATTTCTGAAGAGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  176  ATAAACTAGAGGAGACCTTAACACGTGAACAGAAAGAAGGAGCCTTCTCCAATTTTCCTATTTCTGAAGAGACT  249

Query  445  ATAAAGCTTCTGAAAGGTCGAGGGGTAACATATCTCTTTCCTATTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTGTATATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  ATAAAGCTTCTGAAAGGTCGAGGGGTAACATATCTCTTTCCTATTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTGTATATGA  323

Query  519  AGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACGGACAGGAACAGGAAAGACATTCTCTTTTGCCATCCCCTTAATTGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  AGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACGGACAGGAACAGGAAAGACATTCTCTTTTGCCATCCCCTTAATTGAAA  397

Query  593  GACTCCAAAGAAATCAAGAAACAATTAAAAAAAGCCGCTCACCAAAGGTACTTGTTTTGGCTCCAACAAGGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  GACTCCAAAGAAATCAAGAAACAATTAAAAAAAGCCGCTCACCAAAGGTACTTGTTTTGGCTCCAACAAGGGAA  471

Query  667  CTGGCAAACCAAGTAGCCAAAGACTTCAAAGATATAACTAGGAAACTCAGCGTGGCGTGTTTTTATGGTGGAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  CTGGCAAACCAAGTAGCCAAAGACTTCAAAGATATAACTAGGAAACTCAGCGTGGCGTGTTTTTATGGTGGAAC  545

Query  741  ATCATATCAAAGCCAAATTAATCATATTCGAAATGGTATTGACATCTTGGTTGGAACACCTGGTCGTATCAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  ATCATATCAAAGCCAAATTAATCATATTCGAAATGGTATTGACATCTTGGTTGGAACACCTGGTCGTATCAAAG  619

Query  815  ACCATCTGCAGAGTGGCCGATTGGATCTTTCTAAACTGCGACATGTTGTGCTTGATGAAGTGGATCAGATGTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  ACCATCTGCAGAGTGGCCGATTGGATCTTTCTAAACTGCGACATGTTGTGCTTGATGAAGTGGATCAGATGTTA  693

Query  889  GATTTAGGTTTCGCTGAACAAGTTGAAGATATTATTCATGAATCCTACAAAACTGATTCTGAAGACAATCCTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  GATTTAGGTTTCGCTGAACAAGTTGAAGATATTATTCATGAATCCTACAAAACTGATTCTGAAGACAATCCTCA  767

Query  963  GACTTTACTTTTTTCTGCAACTTGCCCACAGTGGGTATACAAAGTTGCAAAAAAATACATGAAATCCAGATATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  GACTTTACTTTTTTCTGCAACTTGCCCACAGTGGGTATACAAAGTTGCAAAAAAATACATGAAATCCAGATATG  841

Query 1037  AACAGGTTGACCTTGTTGGAAAAATGACTCAAAAGGCTGCAACTACTGTGGAACATTTGGCCATCCAGTGTCAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  AACAGGTTGACCTTGTTGGAAAAATGACTCAAAAGGCTGCAACTACTGTGGAACATTTGGCCATCCAGTGTCAT  915

Query 1111  TGGTCTCAGAGGCCAGCAGTTATTGGAGATGTCCTTCAAGTCTACAGTGGGTCTGAAGGGAGGGCTATTATTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  TGGTCTCAGAGGCCAGCAGTTATTGGAGATGTCCTTCAAGTCTACAGTGGGTCTGAAGGGAGGGCTATTATTTT  989

Query 1185  CTGTGAGACCAAGAAGAATGTAACTGAAATGGCCATGAATCCACACATAAAACAGAATGCCCAGTGTTTACATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  CTGTGAGACCAAGAAGAATGTAACTGAAATGGCCATGAATCCACACATAAAACAGAATGCCCAGTGTTTACATG  1063

Query 1259  GGGACATTGCACAGTCACAAAGAGAAATTACACTAAAAGGCTTCAGAGAAGGTAGTTTTAAAGTTTTGGTGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064  GGGACATTGCACAGTCACAAAGAGAAATTACACTAAAAGGCTTCAGAGAAGGTAGTTTTAAAGTTTTGGTGGCA  1137

Query 1333  ACCAATGTGGCTGCCCGTGGTTTGGACATTCCTGAAGTTGACCTGGTGATTCAAAGTTCTCCTCCTCAGGATGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  ACCAATGTGGCTGCCCGTGGTTTGGACATTCCTGAAGTTGACCTGGTGATTCAAAGTTCTCCTCCTCAGGATGT  1211

Query 1407  TGAGTCCTATATCCATCGCTCTGGACGCACAGGTAGAGCTGGACGGACAGGGATTTGTATATGTTTTTATCAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212  TGAGTCCTATATCCATCGCTCTGGACGCACAGGTAGAGCTGGACGGACAGGGATTTGTATATGTTTTTATCAAC  1285

Query 1481  CAAGAGAAAGAGGTCAACTAAGATATGTGGAACAAAAAGCAGGAATTACTTTTAAACGTGTAGGTGTTCCTTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286  CAAGAGAAAGAGGTCAACTAAGATATGTGGAACAAAAAGCAGGAATTACTTTTAAACGTGTAGGTGTTCCTTCT  1359

Query 1555  ACAATGGATTTAGTTAAATCTAAAAGCATGGATGCCATCAGGTCTCTGGCTTCCGTTTCTTATGCTGCTGTTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1360  ACAATGGATTTAGTTAAATCTAAAAGCATGGATGCCATCAGGTCTCTGGCTTCCGTTTCTTACGCTGCTGTTGA  1433

Query 1629  TTTTTTCCGACCATCAGCTCAGAGACTGATAGAAGAGAAAGGTGCAGTGGATGCATTGGCTGCAGCTTTAGCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434  TTTTTTCCGACCATCAGCTCAGAGACTGATAGAAGAGAAAGGTGCAGTGGATGCATTGGCTGCAGCTTTAGCCC  1507

Query 1703  ACATTTCTGGTGCATCAAGCTTTGAACCACGATCTTTGATCACCTCTGATAAGGGGTTTGTGACCATGACTCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508  ACATTTCTGGTGCATCAAGCTTTGAACCACGATCTTTGATCACCTCTGATAAGGGGTTTGTGACCATGACTCTG  1581

Query 1777  GAAAGCCTAGAGGAAATACAGGATGTCAGCTGTGCTTGGAAAGAACTTAACAGAAAGCTGAGTAGTAATGCAGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582  GAAAGCCTAGAGGAAATACAGGATGTCAGCTGTGCTTGGAAAGAACTTAACAGAAAGCTGAGTAGTAATGCAGT  1655

Query 1851  GTCTCAGATTACCAGAATGTGCCTCCTGAAAGGAAATATGGGTGTTTGCTTTGATGTTCCTACAACTGAGTCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656  GTCTCAGATTACCAGAATGTGCCTCCTGAAAGGAAATATGGGTGTTTGCTTTGATGTTCCTACAACTGAGTCAG  1729

Query 1925  AAAGGTTACAGGCAGAGTGGCATGATTCCGACTGGATACTCTCAGTGCCAGCCAAATTACCTGAAATTGAAGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730  AAAGGTTACAGGCAGAGTGGCATGATTCCGACTGGATACTCTCAGTGCCAGCCAAATTACCTGAAATTGAAGAA  1803

Query 1999  TATTATGATGGAAACACATCTTCTAATTCCAGACAGAGGAGTGGCTGGTCAAGTGGTCGATCAGGCCGGTCAGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804  TATTATGATGGAAACACATCTTCTAATTCCAGACAGAGGAGTGGCTGGTCAAGTGGTCGATCAGGCCGGTCAGG  1877

Query 2073  CCGGTCAGGTGGTCGATCTGGCGGCCGGTCAGGTAGACAGAGTCGACAAGGAAGTCGCTCAGGAAGTCGACAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878  CCGGTCAGGTGGTCGATCTGGCGGCCGGTCAGGTAGACAGAGTCGACAAGGAAGTCGCTCAGGAAGTCGACAAG  1951

Query 2147  ATGGTAGAAGACGAAGTGGGAATAGAAATCGATCAAGAAGTGGGGGCCACAAACGGAGTTTTGAC  2211
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1952  ATGGTAGAAGACGAAGTGGGAATAGAAATCGATCAAGAAGTGGGGGCCACAAACGGAGTTTTGAC  2016