Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04049
- Subject:
- NM_175123.4
- Aligned Length:
- 993
- Identities:
- 725
- Gaps:
- 171
Alignment
Query 1 ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA 74
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGCTGAGTCCCGAGCGCCTAGCTCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGAGACATGTCCTCACGTACATGGA 74
Query 75 GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT 148
|||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 75 GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTGGAGAACAGGGAGGATATTAGCCAGTATGGCATTGCCCGGTTCTTCACTGACT 148
Query 149 ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT 222
||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||
Sbjct 149 ATTTTAACAGCGTATGCCAAGGAACTCACATTCTCTTCCGGGAATTCAGCTTTATACAAGCCACACCTCATAAT 222
Query 223 AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA 296
||.|.||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..||||||||||||.
Sbjct 223 AGAGCATCATTCCTTCGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTAGGGAAAAATGGTGACCTGCTGACCATGAG 296
Query 297 AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG 370
.||.||.||||||.|||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 GGAGTACCACTGTCTGCTGCAGTTATTGTGCCCAGACTTCCCGCTGGAGCTTACTCAGAAAGCCGCCAGGATTG 370
Query 371 TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC 444
||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 TGCTCATGGATGATGCCATGGACTGCCTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTTTTCGCCTTCCAGATCCAGTTTTAT 444
Query 445 TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 445 TACTCAGAATTCCTGGAGAGTGTGGCTGCCATCTATCAGGACTTGCTATCTGGGAAAAACCCCAATACAGTGAT 518
Query 519 TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG 592
|||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.|.||||||.||.||||
Sbjct 519 TGTCCCAACATCATCCAGTGGGCAACACCGCCAACGACCTGCCTTGGGTGATGCCGGTATGCTGGATGGAGTGG 592
Query 593 AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT 666
|.||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 593 AAGCATCACTGTTCTATCAGCGCCTGGAAAACCTGTGTGACCGGCACAAGTACAGCTGTCCACCACCAGCGCTT 666
Query 667 GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG 740
|||||||||..|||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|.|||
Sbjct 667 GTCAAAGAGATCCTGAGCAATGTCCAGAGGCTGACTTTCTATGGATTCCTTGTGGCCCTCTCAAAGCATCATGG 740
Query 741 AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG 814
.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GATCAACCAAGCCCTGGGAGCTTTGCCAGACAAAGGAGACCTGATGCACGACCCAGCCATGGATGAAGAGCTGG 814
Query 815 AACGGCTG------------------------------------------------------------------ 822
||||||||
Sbjct 815 AACGGCTGCTGGTCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCCATCACTGCCACTTCTGAGGCCAGCTGCCTGCCTTCC 888
Query 823 -------------------------------------------------------------------------- 822
Sbjct 889 CGAACCCCTCCCCGGGTTGGTTCCCCGTGGAAACCCCTCCATCGCTCCCGCAAATTGGATGCAGAGAGCGATGG 962
Query 823 ------------------------------- 822
Sbjct 963 CTCCACTGAAGAGACAGATGAGTCTGAGACT 993