Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04050
- Subject:
- NM_001003678.3
- Aligned Length:
- 1053
- Identities:
- 912
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA 74
Query 75 GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT 148
Query 149 ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT 222
Query 223 AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA 296
Query 297 AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG 370
Query 371 TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC 444
Query 445 TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT 518
Query 519 TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG 592
Query 593 AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT 666
Query 667 GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG 740
Query 741 AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG 814
Query 815 AACGGCTGCTTCTTCCCTTCTTCAGGCTGGCCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCGG---TCACAGCCAGTCCA 885
||||||||.| |.|| |||||..|| |||..| ||| |||| |.|||..||
Sbjct 815 AACGGCTGGT---------------GGTG----AGGTCGAAG--CTGCAC----CGGACCTCAC-GGCAGCACA 862
Query 886 GAG-------GCCAGTTGCCTGCCTTCCCGGACCCCTCCCCGGGTTGGCTCTCCCTGGAGACCTCTCCATCATT 952
||| |||||..|||| ||||||.||...|.|||
Sbjct 863 GAGCCAAGGAGCCAGGGGCCT-----------------------TTGGCTTTCAGAGAAGA------------- 900
Query 953 CCCGAAAAG-TGGA-----TGGAGAGAGTGATGGCTCCACTGAAGAG-------ACAGACG------------- 1000
||.||| .||| ||||||||||| |||.| || ||.||||
Sbjct 901 ---GAGAAGCAGGAGGCCCTGGAGAGAGTG-----TCCTC-----AGCTTCGGTACCGACGCCCTACCATTACC 961
Query 1001 AGTCGGAGACT------ 1011
.||.||||.|.
Sbjct 962 GGTGGGAGCCCAGAGAG 978