Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04085
• Subject: NM_023270.5
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1175
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGGCCGCCGCCTGGGGCCGGGGTCTCCTGCCGCGGTGGCTGCGGCTTTTCCAGATTGCTGGCATGGTGCTT  74
            ||||||||||||||.|||..||||||||.|||||||||.||||||||...|.||.|..|.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCGCCGCCCGGGATCGGGGTCTACTGCCGCGGCGGCTGCGGAGCTGCCCGGCTACTGGCTTGGTGCTT  74

Query   75  CCTGCTGGCCCTGAGTCCGCAGGCACCCGGTTCCCGGGGGGCTGAAGCAGTGTGGACCGCGTACCTCAACGTGT  148
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTTCTGGCTCTGAGTCCGCACGCGCCCGGTTCCCGGGGAGCCGAAGCCGTGTGGACCGCGTACCTCAACGTGT  148

Query  149  CCTGGCGGGTTCCGCACACGGGAGTGAACCGTACGGTGTGGGAGCTGAGCGAGGAGGGCGTGTACGGCCAGGAC  222
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGGGTTCCGCACACCGGAGTGAACCGCACGGTGTGGGAGCTGAGCGAGGAGGGCGTGTACGGCCAGGAC  222

Query  223  TCGCCGCTGGAGCCTGTGGCTGGGGTCCTGGTACCGCCCGACGGGCCCGGGGCGCTTAACGCCTGTAACCCGCA  296
            ||||||||||||||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGCCGCTGGAGCCCGTCTCCGGGGTCCTGGTACCGCCCGACGGGCCCGGGGCGCTCAACGCCTGTAACCCGCA  296

Query  297  CACGAATTTCACGGTGCCCACGGTTTGGGGAAGCACCGTGCAAGTCTCTTGGTTGGCCCTCATCCAACGCGGCG  370
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CACCAATTTCACGGTGCCCACGGTTTGGGGGAGCACGGTGCAAGTATCTTGGTTGGCCCTCATCCAACGCGGTG  370

Query  371  GGGGCTGCACCTTCGCAGACAAGATCCATCTGGCTTATGAGAGAGGGGCGTCTGGAGCCGTCATCTTTAACTTC  444
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  GAGGCTGCACCTTCGCGGACAAGATCCATCTGGCTTCAGAGAGAGGGGCTTCTGGAGCGGTCATCTTTAACTTC  444

Query  445  CCCGGGACCCGCAATGAGGTCATCCCCATGTCTCACCCGGGTGCAGTAGACATTGTTGCAATCATGATCGGCAA  518
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CCTGGGACCCGCAATGAGGTCATCCCCATGTCTCACCCGGGTGCTGGGGACATTGTTGCAATCATGATTGGCAA  518

Query  519  TCTGAAAGGCACAAAAATTCTGCAATCTATTCAAAGAGGCATACAAGTGACAATGGTCATAGAAGTAGGGAAAA  592
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  TCTGAAAGGAACAAAAATTCTGCAGTCTATTCAAAGAGGCATCCAAGTCACAATGGTCATCGAAGTAGGGAAAA  592

Query  593  AACATGGCCCTTGGGTGAATCACTATTCAATTTTTTTCGTTTCTGTGTCCTTTTTTATTATTACGGCGGCAACT  666
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct  593  AACATGGCCCTTGGGTGAATCATTATTCAATTTTCTTCGTTTCTGTGTCCTTTTTCATAATTACGGCAGCAACC  666

Query  667  GTGGGCTATTTTATCTTTTATTCTGCTCGAAGGCTACGGAATGCAAGAGCTCAAAGCAGGAAGCAGAGGCAATT  740
            |||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GTGGGCTATTTCATCTTTTATTCTGCTCGAAGATTACGAAATGCAAGAGCTCAAAGCAGGAAGCAGAGGCAGTT  740

Query  741  AAAGGCAGATGCTAAAAAAGCTATTGGAAGGCTTCAACTACGCACACTGAAACAAGGAGACAAGGAAATTGGCC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAGGCAGATGCTAAAAAAGCTATTGGAAAGCTTCAGCTGCGCACCTTGAAACAAGGAGACAAGGAAATTGGCC  814

Query  815  CTGATGGAGATAGTTGTGCTGTGTGCATTGAATTGTATAAACCAAATGATTTGGTACGCATCTTAACGTGCAAC  888
            |||||||||||||.|||||||||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||.||||.|||||.
Sbjct  815  CTGATGGAGATAGCTGTGCTGTGTGCATTGAGCTCTATAAGCCAAATGATTTGGTGCGCATCCTAACCTGCAAT  888

Query  889  CATATTTTCCATAAGACATGTGTTGACCCATGGCTGTTAGAACACAGGACTTGCCCCATGTGCAAATGTGACAT  962
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  CATATTTTCCATAAGACATGTGTGGACCCGTGGCTTTTAGAACACAGGACTTGCCCCATGTGCAAGTGTGACAT  962

Query  963  ACTCAAAGCTTTGGGAATTGAGGTGGATGTTGAAGATGGATCAGTGTCTTTACAAGTCCCTGTATCCAATGAAA  1036
            .|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.
Sbjct  963  TCTCAAAGCTCTGGGAATTGAGGTGGATGTTGAAGATGGATCAGTGTCTTTACAAGTTCCTGTTTCTAATGAAG  1036

Query 1037  TATCTAATAGTGCCTCCTCCCATGAAGAGGATAATCGCAGCGAGACCGCATCATCTGGATATGCTTCAGTACAG  1110
            .||||||||.||||||..|||||||||||||.|.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  CATCTAATACTGCCTCTCCCCATGAAGAGGACAGTCGCAGTGAGACTGCATCATCTGGATATGCTTCAGTACAA  1110

Query 1111  GGAACAGATGAACCGCCTCTGGAGGAACACGTGCAGTCAACAAATGAAAGTCTACAGCTGGTAAACCATGAAGC  1184
            |||.|||||||.||.||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAGCAGATGAGCCACCTCTGGAGGAACATGCGCAGTCAGCAAATGAAAATCTACAGCTGGTAAACCATGAAGC  1184

Query 1185  AAATTCTGTGGCAGTGGATGTTATTCCTCATGTTGACAACCCAACCTTTGAAGAAGACGAAACTCCTAATCAAG  1258
            ||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1185  AAATTCTGTGGCCGTGGATGTTGTTCCCCATGTTGACAACCCAACCTTTGAAGAAGATGAAACTCCTGATCAAG  1258

Query 1259  AGACTGCTGTTCGAGAAATTAAATCT  1284
            ||.|.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1259  AGGCAGCTGTTCGGGAGATTAAATCT  1284