Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04085
Subject:
NM_024539.3
Aligned Length:
429
Identities:
317
Gaps:
28

Alignment

Query   1  MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLA-WCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEEGVYGQ  73
                   ........|..||. ..|||...        |.....||..|...  ....|.|..|..|.||||.
Sbjct   1  --------MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKIT--------ASFSMSAYVTVTYY--NETSNYTAIETCECGVYGL  56

Query  74  DSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFN  147
           .||.....||...|.. ....||...|.|       |.....|.|||.| |.|||..||..|..|.|...||.|
Sbjct  57  ASPVANAMGVVGIPKN-NNYQACDHNTEF-------SNTKKPWIALIER-GNCTFSEKIQTAGRRNADAVVIYN  121

Query 148  FPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAA  221
           .|.|.|..|.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122  APETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAA  195

Query 222  TVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTC  295
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196  TVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTC  269

Query 296  NHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASV  369
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270  NHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASV  343

Query 370  QGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS  428
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344  QGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS  402