Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04127
Subject:
NM_001081236.1
Aligned Length:
616
Identities:
528
Gaps:
2

Alignment

Query   1  ATGGTGAACCTGGCGGCCATGGTGTGGCGCCGGCTTCTGCGGAAGAGGTGGGTGCTCGCCCTGGTCTTCGGGCT  74
           |||.|||||||||||||..||.|||||||||||||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct   1  ATGCTGAACCTGGCGGCGCTGCTGTGGCGCCGGCTCCTGCGCAAGCGCTGGGTGCTCGCCCTGGTTTTCGGCCT  74

Query  75  GTCGCTCGTCTACTTCCTCAGCAGCACCTTCAAGCAGGAGGAGAGGGCAGTGAGAGATAGGAATCTCCTCCAGG  148
           .|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..||||.||||||||||
Sbjct  75  CTCGCTAGTTTACTTCCTCAGCAGCACCTTCAAGCAGGAAGAGAGGGCTGTGAGAGACCGGAACCTCCTCCAGG  148

Query 149  TTCATGACCATAATCAGCCCATCCCGTGGAAAGTGCAGTTTAACTTGGGCAATAGCAGTCGTCCGAGCAATCAG  222
           ||||.||||...|.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 149  TTCAAGACCGGGAACAGCCCATCCCGTGGAAGGTGCAGTTTAACCTAGGCAACAGCAGCCGACCCAGCAACCAG  222

Query 223  TGCCGCAACTCCATTCAAGGGAAGCACCTCATCACGGATGAACTCGGCTACGTTTGCGAGAGGAAGGATTTGCT  296
           |||||.|||||..|.|||||.||.||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||..||||
Sbjct 223  TGCCGGAACTCTGTCCAAGGAAAACACCTCCTCACTGATGAGCTGGGCTATGTCTGCGAGAGGAAGGACCTGCT  296

Query 297  GGTAAATGGCTGCTGTAATGTCAACGTCCCTAGCACGAAGCAGTACTGCTGTGATGGCTG-CTGGCCCAACGGC  369
           ||..||||||||.||..|.||||.||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|| |||| ||||.|||
Sbjct 297  GGCGAATGGCTGTTGCGACGTCAGCGTCCCCAGCACAAAGCAGTACTGCTGTGATGGGTGCCTGG-CCAATGGC  369

Query 370  TGCTGCAGCGCCTATGAGTACTGTGTCTCCTGCTGCCTGCAGCCCAACAAGCAACTTCTCCTGGAGCGCTTCCT  443
           |||||....|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  TGCTGTGAAGCCTACGAGTACTGCGTCTCCTGCTGCCTGCAGCCCAGCAAGCAACTTCTCCTGGAGCGCTTCCT  443

Query 444  CAACCGGGCAGCCGTGGCATTCCAGAACCTCTTCATGGCAGTCGAAGATCACTTTGAGTTGTGCCTGGCCAAAT  517
           ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||..|||||.||||.||||
Sbjct 444  CAACCGGGCAGCTGTGGCCTTCCAGAACCTCTTCATGGCAGTTGAAGACCACTTCGAACTGTGCTTGGCTAAAT  517

Query 518  GCAGGACCTCATCTCAGAGCGTGCAGCATGAGAACACCTACCGGGACCCCATAGCAAAGTATTGCTATGGAGAA  591
           ||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 518  GCAGGACCTCCTCCCAGAGTGTGCAACACGAGAACACGTACCGTGACCCCATAGCCAAGTACTGCTATGGAGAG  591

Query 592  AGCCCGCCCGAGCTCTTCCCCGCT  615
           ||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 592  AGCCCGCCTGAACTCTTCCCGGCG  615