Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04142
• Subject: NM_001320210.1
• Aligned Length: 1212
• Identities: 1044
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGTCTGTGGAGCGCCTGCAGCAGCGGGTCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTTGCCCAGGAGAGGAGTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAGGTCCCGAGGAGCGGCGACGGAGGGGGCGGCCGGGTCCGCATCGAGAAGATGAGCTCAGAGGTGGTGGATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGAATCCCTACAGCCGCTTGATGGCATTGAAACGAATGGGAATTGTAAGCGACTATGAGAAAATCCGTACCTTT  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGGCATTGAAACGAATGGGAATTGTAAGCGACTATGAGAAAATCCGTACCTTT  54

Query  223  GCCGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTAGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCATTGGTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  GCCGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTAGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCATTGGTAA  128

Query  297  GTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCAG  202

Query  371  GATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAAC  276

Query  445  TATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  TATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAAA  350

Query  519  ACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  ACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAAC  424

Query  593  TTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  TTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGGA  498

Query  667  GAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  GAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAGA  572

Query  741  AGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  AGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAGT  646

Query  815  TTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  TTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTCC  720

Query  889  ATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  ATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAGC  794

Query  963  ACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGAGCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  ACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGAGCTGG  868

Query 1037  TATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTACAGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  TATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTACAGTG  942

Query 1111  GCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGCTTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  GCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGCTTGGA  1016

Query 1185  AGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  AGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  1044