Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04142
- Subject:
- NM_001321239.1
- Aligned Length:
- 1212
- Identities:
- 876
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 ATGGCGGAGTCTGTGGAGCGCCTGCAGCAGCGGGTCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTTGCCCAGGAGAGGAGTCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCAGGTCCCGAGGAGCGGCGACGGAGGGGGCGGCCGGGTCCGCATCGAGAAGATGAGCTCAGAGGTGGTGGATT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CGAATCCCTACAGCCGCTTGATGGCATTGAAACGAATGGGAATTGTAAGCGACTATGAGAAAATCCGTACCTTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GCCGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTAGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCATTGGTAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCAG 34
Query 371 GATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 GATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAAC 108
Query 445 TATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAAA 182
Query 519 ACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 ACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAAC 256
Query 593 TTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 TTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGGA 330
Query 667 GAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 GAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAGA 404
Query 741 AGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 AGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAGT 478
Query 815 TTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTCC 552
Query 889 ATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 ATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAGC 626
Query 963 ACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGAGCTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 ACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGAGCTGG 700
Query 1037 TATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTACAGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 TATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTACAGTG 774
Query 1111 GCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGCTTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGCTTGGA 848
Query 1185 AGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG 1212
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 AGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG 876