Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04145
- Subject:
- XM_006720257.3
- Aligned Length:
- 1241
- Identities:
- 905
- Gaps:
- 325
Alignment
Query 1 ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC 74
Query 75 CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA 148
Query 149 TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG 222
Query 223 TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATTCAACAACATATGAATGCAACAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATTCAACAACATATGAATGCAACAG 296
Query 297 ACAGTTTGAAGATCAAGAAGAAGATACTGAATCACAGTCAAGAACTACTGATGTAAAAATAATCGGCTTCCTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACAGTTTGAAGATCAAGAAGAAGATACTGAATCACAGTCAAGAACTACTGATGTAAAAATAATCGGCTTCCTTA 370
Query 371 GAAACGTTGAGAAA--------------GGAACTCAA---------CAGAGGCAA------TTATT-------- 407
|||||||||||||| |||| ||.| ||||..||| |||||
Sbjct 371 GAAACGTTGAGAAAGATTACTATGACATGGAA-TCCATGGTCCATGCAGACACAAGATCATTTATTCTGAAGAA 443
Query 408 -------------------------------------------------ATCCCGACTGCAAAT---------- 422
||...|||||||.||
Sbjct 444 GCCAAAGCTGTCTGAGGAAGTAGTAGTGGCACCAAACCAAGAGTCGGGGATGAAGACTGCAGATTCCCTTCGGG 517
Query 423 --------------------------CGA--------------------------------------------- 425
|||
Sbjct 518 TACTTTCAGGACACCTTATGCAGACACGAGATCTTGTACAACCAGATAAACCTGCAAGTCCCAAGTTTATAGTG 591
Query 426 -----------------------CCCAGTA---ATGGCAG---------------------------------- 439
|||||.| |||.|||
Sbjct 592 ACGCTGGATGGTGTCCCCAGCCCCCCAGGATACATGTCAGATCAAGAGGAGGACATGTGCTTTGAAGGAATGAA 665
Query 440 -----------AAACT------------------CTGCAGA-------------------------------TG 453
||||| || |||| ||
Sbjct 666 ACCCGTAAACCAAACTGCAGCCTCAAACAAGGGACT-CAGAGGTCTCCTCCACCCACAGCAGTTGCACTTGCTG 738
Query 454 AG---------------------------------TCAAGCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACC 494
|| |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 AGCAGGCAGCTTGAGGACCCAAATGGTAGCTTTTCTAACGCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACC 812
Query 495 AGAAAAACTTTTGGAGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCA 568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 AGAAAAACTTTTGGAGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCA 886
Query 569 TCTCACCCTGCAAAGCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATAT 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TCTCACCCTGCAAAGCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATAT 960
Query 643 GATGCAAAGTGTACTAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGAATTCCAGTACTGTCTCCAAAAC- 715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GATGCAAAGTGTACTAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGAATTCCAGTACTGTCTCCAAAACC 1034
Query 716 --CAGTTGCACCACCAGCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAAT 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 AGCAGTTGCACCACCAGCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAAT 1108
Query 788 GTCCCTTCTATCATCCAAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCC 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 GTCCCTTCTATCATCCAAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCC 1182
Query 862 ACCATTAATGTCCCACCACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA 918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 ACCATTAATGTCCCACCACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA 1239