Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04145
• Subject: XM_024449713.1
• Aligned Length: 1238
• Identities: 905
• Gaps: 322

Alignment

Query    1  ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC  74

Query   75  CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA  148

Query  149  TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG  222

Query  223  TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATTCAACAACATATGAATGCAACAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATTCAACAACATATGAATGCAACAG  296

Query  297  ACAGTTTGAAGATCAAGAAGAAGATACTGAATCACAGTCAAGAACTACTGATGTAAAAATAATCGGCTTCCTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGTTTGAAGATCAAGAAGAAGATACTGAATCACAGTCAAGAACTACTGATGTAAAAATAATCGGCTTCCTTA  370

Query  371  GAAACGTTGAGAAA--------------GGAACTCAA---------CAGAGGCAA------TTATT--------  407
            ||||||||||||||              |||| ||.|         ||||..|||      |||||        
Sbjct  371  GAAACGTTGAGAAAGATTACTATGACATGGAA-TCCATGGTCCATGCAGACACAAGATCATTTATTCTGAAGAA  443

Query  408  -------------------------------------------------ATCCCGACTGCAAAT----------  422
                                                             ||...|||||||.||          
Sbjct  444  GCCAAAGCTGTCTGAGGAAGTAGTAGTGGCACCAAACCAAGAGTCGGGGATGAAGACTGCAGATTCCCTTCGGG  517

Query  423  --------------------------CGA---------------------------------------------  425
                                      |||                                             
Sbjct  518  TACTTTCAGGACACCTTATGCAGACACGAGATCTTGTACAACCAGATAAACCTGCAAGTCCCAAGTTTATAGTG  591

Query  426  -----------------------CCCAGTA---ATGGCAG----------------------------------  439
                                   |||||.|   |||.|||                                  
Sbjct  592  ACGCTGGATGGTGTCCCCAGCCCCCCAGGATACATGTCAGATCAAGAGGAGGACATGTGCTTTGAAGGAATGAA  665

Query  440  -----------AAACT------------------CTGCAGA-------------------------------TG  453
                       |||||                  || ||||                               ||
Sbjct  666  ACCCGTAAACCAAACTGCAGCCTCAAACAAGGGACT-CAGAGGTCTCCTCCACCCACAGCAGTTGCACTTGCTG  738

Query  454  AG---------------------------------TCAAGCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACC  494
            ||                                 |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  AGCAGGCAGCTTGAGGACCCAAATGGTAGCTTTTCTAACGCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACC  812

Query  495  AGAAAAACTTTTGGAGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCA  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AGAAAAACTTTTGGAGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCA  886

Query  569  TCTCACCCTGCAAAGCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATAT  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TCTCACCCTGCAAAGCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATAT  960

Query  643  GATGCAAAGTGTACTAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGAATTCCAGTACTGTCTCCAAAACC  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GATGCAAAGTGTACTAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGAATTCCAGTACTGTCTCCAAAACC  1034

Query  717  AGTTGCACCACCAGCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAATGTC  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  AGTTGCACCACCAGCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAATGTC  1108

Query  791  CCTTCTATCATCCAAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCCACC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CCTTCTATCATCCAAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCCACC  1182

Query  865  ATTAATGTCCCACCACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  ATTAATGTCCCACCACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA  1236