Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04153
• Subject: XM_017008627.1
• Aligned Length: 1591
• Identities: 1519
• Gaps: 68

Alignment

Query    1  ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGATTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCA  74

Query   75  GAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCTCCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGA  148

Query  149  CAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCCTACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGAT  222

Query  223  CCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGTGCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAG  296

Query  297  GGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCAGGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTC  370

Query  371  CCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCTGACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCT  444

Query  445  GCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGAGATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAG  518

Query  519  GGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACAATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGA  592

Query  593  TCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGCCAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTC  666

Query  667  TGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTGTTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTG  740

Query  741  CCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTCTGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCC  814

Query  815  GTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCTCTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAG  888

Query  889  ATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAGCAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAA  962

Query  963  GTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACTGCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGG  1036

Query 1037  GCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGATGAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCA  1110

Query 1111  CATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGCTGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAA  1184

Query 1185  TCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACCGGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGC  1258

Query 1259  TGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTCAACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAG  1332

Query 1333  GAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTTGAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCC  1406

Query 1407  AAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGGAGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGC  1480

Query 1481  ACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGT-------------------------------AA----------TGATTG  1513
            |||||||||||||||||||||||||                               ||          ||.||.
Sbjct 1481  ACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGTGTGCCTTCTTCCTGCTCCTCCTCCTCACTGGAAAACATGCTTTTGTTTA  1554

Query 1514  ACACTGACACCTTA-----------------------  1527
            |||.|    ||||.                       
Sbjct 1555  ACAGT----CCTTCTGTTGGCCCTGATGCTCCCAAGA  1587