Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04153
• Subject: XM_024454219.1
• Aligned Length: 2566
• Identities: 1522
• Gaps: 1040

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGA  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGGTTTTCAGGCTGCCTGCTGTTTCCCGGGGAGATCATGAAACGAGGTCGCCTTCCCAGCAGCAGTGAGGA  74

Query   36  TTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCAGAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCT  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCTGACGACAATGGCAGCCTGTCAACTACTTGGTCCCAGAATTCCCGATCCCAGCATAGGAGAAGCTCCTGCT  148

Query  110  CCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGACAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCC  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGACATGAAGATCGAAAGCCTTCAGAGGTGTTTAGGACAGACCTGATCACTGCCATGAAGTTGCATGACTCC  222

Query  184  TACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGATCCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGT  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCAGCTGAATCCGGATGAGTACTATGTGTTGGCAGATCCCTGGAGACAGGAATGGGAGAAAGGGGTCCAGGT  296

Query  258  GCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAGGGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTGTGAGCCCGGGGACCATCCCTCAGCCTGTGGCCAGGGTTGTGTCTGAAGAGAAATCCCTCATGTTCATCA  370

Query  332  GGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTCCCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCT  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCCCAAGAAGTACATCGTGTCATCAGGCTCTGAGCCTCCCGAGTTGGGCTATGTGGACATCCGGACGCTGGCT  444

Query  406  GACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCTGCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACAGCGTGTGTCGCTATGACCTCAATGACATGGATGCTGCATGGCTGGAACTGACCAATGAAGAATTTAAGGA  518

Query  480  GATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAGGGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACA  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATGGGAATGCCTGAACTAGATGAATACACCATGGAGAGGGTCCTAGAGGAATTTGAGCAGCGATGCTACGACA  592

Query  554  ATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGATCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGC  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATATGAATCATGCCATAGAGACTGAGGAAGGCCTGGGGATCGAATATGATGAAGATGTTGTCTGTGATGTCTGC  666

Query  628  CAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTCTGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTG  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTCTCCTGATGGTGAGGACGGCAATGAGATGGTGTTCTGTGACAAATGCAACATCTGTGTGCACCAGGCCTG  740

Query  702  TTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTGCCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTC  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTATGGAATCCTCAAGGTACCAGAGGGCAGCTGGCTGTGCCGGACATGTGCCCTGGGGGTTCAGCCAAAATGTC  814

Query  776  TGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCCGTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCT  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTGTGTCCGAAGAAGGGTGGAGCTATGAAGCCCACCCGTAGCGGAACCAAGTGGGTCCACGTTAGCTGTGCT  888

Query  850  CTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAGATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAG  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTGGATCCCTGAGGTGAGCATTGGCAGCCCAGAGAAGATGGAGCCCATCACCAAGGTGTCACACATTCCCAG  962

Query  924  CAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAAGTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACT  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCCGGTGGGCGCTAGTGTGCAGCCTCTGCAATGAGAAGTTTGGGGCCTCTATACAGTGCTCTGTGAAGAACT  1036

Query  998  GCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGGGCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGAT  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCGCACAGCCTTCCATGTGACCTGTGCTTTTGACCGGGGCCTGGAGATGAAGACCATCTTAGCAGAGAATGAT  1110

Query 1072  GAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCACATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGC  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGTCAAGTTCAAGTCCTATTGCCCAAAGCACAGCTCACATAGGAAACCCGAGGAGAGTCTTGGCAAGGGGGC  1184

Query 1146  TGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAATCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACC  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCACAGGAGAATGGGGCCCCTGAGTGTTCCCCCCGGAATCCGCTGGAGCCCTTTGCCAGCCTTGAGCAGAACC  1258

Query 1220  GGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGCTGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTC  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGAGGAGGCCCACCGGGTGAGTGTCCGTAAGCAGAAGCTGCAGCAGTTGGAGGATGAGTTCTACACCTTCGTC  1332

Query 1294  AACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAGGAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTT  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACCTGCTGGATGTTGCCAGGGCTCTGCGGCTGCCTGAGGAAGTAGTGGATTTCCTGTACCAGTACTGGAAGTT  1406

Query 1368  GAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCCAAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGG  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAGAGGAAGGTCAACTTCAACAAGCCCCTGATCACCCCAAAGAAAGATGAAGAGGACAATCTAGCCAAGCGGG  1480

Query 1442  AGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGCACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGT----AA--TG  1509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  |.
Sbjct 1481  AGCAGGATGTCTTATTTAGGAGGCTGCAGCTGTTCACGCACCTGCGGCAGGACCTGGAGAGGGTTCGGAACCTC  1554

Query 1510  ATTGACA--CTGACACC------------TTA------------------------------------------  1527
            |.|.|||  .|||| ||            |||                                          
Sbjct 1555  ACTTACATGGTGAC-CCGCAGGGAAAAGATTAAACGGTCTGTGTGCAAAGTCCAGGAACAGATATTCAATCTTT  1627

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1628  ACACTAAGCTTTTGGAGCAAGAAAGAGTTTCAGGTGTGCCTTCTTCCTGCTCCTCCTCCTCACTGGAAAACATG  1701

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1702  CTTTTGTTTAACAGTCCTTCTGTTGGCCCTGATGCTCCCAAGATAGAGGACTTGAAGTGGCATTCTGCATTCTT  1775

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1776  CAGAAAACAAATGGGTACTTCCTTGGTTCATTCGCTGAAAAAGCCCCATAAGCGAGATCCTTTGCAGAATAGCC  1849

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1850  CTGGAAGTGAAGGCAAAACCCTGCTGAAGCAGCCAGACCTGTGTGGTAGAAGGGAGGGGATGGTGGTCCCAGAG  1923

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1924  AGCTTTTTGGGTTTAGAAAAGACCTTTGCAGAAGCACGTCTCATATCAGCACAACAGAAAAATGGTGTGGTGAT  1997

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 1998  GCCAGACCATGGGAAAAGAAGAGACAATCGTTTTCATTGTGATCTCATTAAAGGAGACTTAAAGGACAAATCTT  2071

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2072  TTAAACAGAGTCACAAGCCTCTCAGGTCCACAGATGTGTCCCAGAGGCATCTGGACAACACAAGAGCTGCCACC  2145

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2146  TCCCCTGGAGTGGGGCAGTCAGCACCTGGCACAAGGAAGGAGATAGTGCCCAAGTGCAATGGCTCCCTAATCAA  2219

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2220  AGTAAACTATAATCAGACTGCAGTCAAAGTGCCTACAACACCTGCCAGCCCAGTGAAAAACTGGGGAGGATTCC  2293

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2294  GGATTCCAAAGAAGGGGGAACGGCAGCAGCAGGGAGAGGCCCACGATGGGGCCTGCCACCAGCACTCAGACTAC  2367

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2368  CCATATTTGGGCTTAGGCCGAGTTCCAGCCAAGGAAAGGGCAAAAAGCAAATTAAAATCCGACAATGAGAATGA  2441

Query 1528  --------------------------------------------------------------------------  1527
                                                                                      
Sbjct 2442  CGGGTATGTCCCCGATGTGGAAATGAGTGACTCAGAGAGTGAGGCATCAGAAAAGAAATGTATACACACCAGCA  2515

Query 1528  --------------------------------------------------  1527
                                                              
Sbjct 2516  GCACTATCAGCAGAAGGACAGACATTATCAGGAGAAGCATCTTGGCTTCT  2565