Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04171
• Subject: NM_001290997.1
• Aligned Length: 1011
• Identities: 950
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74
            |...||....|.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGFLLLWFCVLFLLVSRLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74

Query   75  DQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148
            ||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DQVYTVNLNEIPQTEVIPSKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148

Query  149  RLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RLRTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222

Query  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296

Query  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370

Query  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSE  444
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDDTLAFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAIEVDRSAGPYQNYTVIFVGSE  444

Query  445  AGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERY  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  445  AGVVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNPAKCSAESEEDRKVVSLQLDKDHHALYVAFSSCVVRIPLSRCERY  518

Query  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGE  592
            |||||||||||||||||||||.|.|||.|||             ..|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGVCERVTLGML-------------PGGYEQDTEYGNTAHLGDCHGVRWEVQSGE  579

Query  593  SNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEY  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  SNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEY  653

Query  667  QQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASR  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  654  QQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNTDTKSMAVDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHSHGASR  727

Query  741  KETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSR  814
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct  728  KEHPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQSMDHPLTKSSSKREHRRSVDSR  801

Query  815  NTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTT  888
            ||||||||||||||||||||.|.|.||||.|||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  NTLNDLLKHLNDPNSNPKAILGEIHMAHQTLMLDPVGPMAEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTT  875

Query  889  PGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQPS  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  PGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAVPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQPS  949

Query  963  LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  950  LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTTSVRPLNKYTY  998