Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04171
• Subject: NM_001291000.1
• Aligned Length: 1082
• Identities: 950
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74
            |...||....|.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGFLLLWFCVLFLLVSRLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74

Query   75  DQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148
            ||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DQVYTVNLNEIPQTEVIPSKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148

Query  149  RLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RLRTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222

Query  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296

Query  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370

Query  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSE  444
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDDTLAFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAIEVDRSAGPYQNYTVIFVGSE  444

Query  445  AGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERY  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  445  AGVVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNPAKCSAESEEDRKVVSLQLDKDHHALYVAFSSCVVRIPLSRCERY  518

Query  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH----------  582
            |||||||||||||||||||||.|.|||.|||             ..|||||||.||||||||||          
Sbjct  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGVCERVTLGML-------------PGGYEQDTEYGNTAHLGDCHESLPPSTTPD  579

Query  583  -------------------------------------------------------------GVRWEVQSGESNQ  595
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  580  YKIFGGPTSDMEVSSSSVTTVASSPEITSKVIDTWRPKLTSSRKFVVQDDPNTSDFTDTISGVRWEVQSGESNQ  653

Query  596  MVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQN  669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  MVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQN  727

Query  670  IDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKET  743
            ||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  728  IDSPKLYSNLLTSRKELPPNTDTKSMAVDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHSHGASRKEH  801

Query  744  PQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTL  817
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  802  PQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQSMDHPLTKSSSKREHRRSVDSRNTL  875

Query  818  NDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGV  891
            |||||||||||||||||.|.|.||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  NDLLKHLNDPNSNPKAILGEIHMAHQTLMLDPVGPMAEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGV  949

Query  892  PMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSR  965
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  PMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAVPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSR  1023

Query  966  QSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1024  QSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTTSVRPLNKYTY  1069