Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04171
• Subject: NM_199238.3
• Aligned Length: 3034
• Identities: 2650
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA  74
            |||.||.||.|.||||||||...||.|.|.|||.|.||..||||.|||..|||..||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGGGTTCCTTCTGCTTTGGTTCTGCGTGCTGTTCCTTCTGGTCTCCAGGTTACGGGCGGTCAGCTTCCCAGA  74

Query   75  AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148
            |||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACGATGAGCCCCTCAACACGGTTGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148

Query  149  GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAACGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222

Query  223  GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||.|||||.|||.|
Sbjct  223  GATCAAGTCTATACAGTGAACTTAAATGAAATCCCCCAAACAGAGGTGATACCAAGCAAGAAGCTGACGTGGAG  296

Query  297  ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG  370
            .||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GTCCAGACAGCAGGATCGAGAAAATTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTCATCAAAG  370

Query  371  TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC  444
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGTCCCAAGAAATGATGAGATGGTTTTTGTCTGTGGTACCAATGCTTTCAACCCGATGTGCAGATACTAT  444

Query  445  AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC  518
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  445  AGGTTGAGAACGTTAGAGTATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCACGATGCCCGTTTGATGCCCGACAAAC  518

Query  519  CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA  592
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  CAATGTCGCCCTCTTTGCTGATGGAAAACTCTATTCTGCCACAGTGGCTGATTTCCTGGCCAGTGATGCTGTCA  592

Query  593  TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC  666
            ||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  TTTACAGAAGCATGGGAGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATACGATTCCAAGTGGATCAAAGAACCACAC  666

Query  667  TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TTCCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTCAGAGAAATCGCCGTGGAACATAATAACTT  740

Query  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCTCGCATTTGTAAAAACGACATGGGTGGCTCACAGCGGGTCCTGGAGA  814

Query  815  AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT  888
            |||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  815  AACACTGGACTTCCTTCCTTAAGGCTCGGCTGAACTGCTCCGTTCCTGGAGATTCCTTTTTCTACTTCGACGTC  888

Query  889  CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA  962
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CTGCAGTCTATAACAGACATAATCCAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTTGGGGTCTTCACCACACAGCTCAA  962

Query  963  TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG  1036
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CAGCATTCCTGGTTCTGCAGTCTGTGCCTTTAGCATGGACGACATTGAGAAAGTGTTCAAAGGGCGGTTCAAAG  1036

Query 1037  AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGAAAACCCCAGACTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTACCAAAACCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110

Query 1111  GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC  1184
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||||||||.||
Sbjct 1111  GCCAAACACGGCCTCGCAGAAGCTTACAAGACCTCCATCGACTTTCCAGATGACACCCTGGCTTTCATCAAGTC  1184

Query 1185  TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA  1258
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCCGCTGATGGACTCTGCCGTCCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACACGGGTCAGGTACA  1258

Query 1259  GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332
            |..||||.||||||..||||||||.||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTGACAGCCATCGAAGTGGACCGTTCAGCAGGGCCATACCAAAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332

Query 1333  GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT  1406
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GCTGGCGTGGTACTTAAAGTTTTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTCTGAATGACAGTGTATTACTCGAAGAGAT  1406

Query 1407  TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA  1480
            ||||||.||.||||..||.||||||||.||.||||.||||||.||||.||||||..|||||||||||.||||.|
Sbjct 1407  TGAAGCTTATAACCCAGCCAAGTGCAGCGCCGAGAGTGAGGAGGACAGAAAGGTGGTCTCATTACAGCTGGACA  1480

Query 1481  AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT  1554
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1481  AGGATCACCATGCTTTATACGTGGCCTTCTCTAGCTGCGTGGTCCGCATCCCCCTCAGCCGCTGTGAGCGCTAC  1554

Query 1555  GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG  1628
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||...||||..||
Sbjct 1555  GGATCGTGTAAAAAGTCTTGCATTGCATCACGTGACCCGTACTGTGGTTGGTTAAGCCAGGGAGTTTGTGAGAG  1628

Query 1629  AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC  1702
            ||||||||.|||||||||.|                                       |||.|||||||||.|
Sbjct 1629  AGTGACCCTAGGGATGCTCC---------------------------------------CTGGAGGATATGAGC  1663

Query 1703  AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCCATGGTGTACGATGGGAAGTCCAGTCTGGAGAG  1776
            |.|||||.||.|.||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1664  AGGACACGGAGTACGGCAACACAGCCCACCTAGGGGACTGCCACGGTGTACGGTGGGAAGTCCAGTCTGGAGAA  1737

Query 1777  TCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCATTGC  1850
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1738  TCCAATCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGCGTGTTTGCCGCTTTTGTCTTGGGCGCGTTCATCGC  1811

Query 1851  AGGTGTGGCAGTATACTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATGCAGAGTCCG  1924
            |||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1812  AGGAGTGGCCGTGTACTGCTACCGTGACATGTTCGTTCGGAAGAACAGAAAGATCCATAAAGACGCAGAATCCG  1885

Query 1925  CCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAATAC  1998
            |||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1886  CCCAGTCGTGCACAGACTCCAGCGGAAGCTTCGCCAAGCTGAACGGCCTCTTTGACAGCCCCGTCAAGGAATAC  1959

Query 1999  CAACAGAATATTGATTCTCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCAATGGAGA  2072
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||....||
Sbjct 1960  CAGCAGAACATTGATTCTCCCAAACTCTACAGCAACCTGCTGACCAGTCGGAAGGAACTGCCACCAAACACGGA  2033

Query 2073  TACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTACAC  2146
            |||.||.|||||||...|||||||..||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 2034  TACAAAGTCCATGGCCGTGGACCACAGAGGCCAGCCTCCCGAGCTGGCTGCTCTCCCCACGCCGGAATCCACAC  2107

Query 2147  CCGTGCTTCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTTCAAGG  2220
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||.||.|||||||||
Sbjct 2108  CTGTCCTCCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCTGAGAAGGCCCACAGCCACGGTGCTTCAAGG  2181

Query 2221  AAAGAA-ACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAGTCATGGGCATATCCCCAGTG  2293
            |||||| ||||| |||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2182  AAAGAACACCCC-CAGTTTTTTCCTTCTAGTCCTCCACCCCATTCCCCATTGAGTCACGGGCATATCCCCAGTG  2254

Query 2294  CCATTGTTCTTCCAAATGCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAAAAG  2367
            ||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 2255  CCATCGTTCTTCCAAACGCCACTCACGACTACAATACATCCTTCTCCAACTCGAATGCCCACAAAGCCGAAAAG  2328

Query 2368  AAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCACCGGCGTTCTGTTGATTCCAG  2441
            ||||||||.|.|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2329  AAGCTTCAGAGCATGGATCACCCTCTTACGAAGTCATCCAGTAAGCGGGAGCACCGGCGGTCTGTGGATTCCAG  2402

Query 2442  AAATACCCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACATCC  2515
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 2403  GAATACTCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTAAATGACCCAAACAGTAACCCCAAAGCCATCCTGGGAGAGATCC  2476

Query 2516  AGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCCCACCTAAAGTCCCTAACCGG  2589
            |.|||||.||.||.|.|.|.||||||||.||..|||||.|.|||.|||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2477  ATATGGCTCATCAAACCCTCATGCTGGACCCGGTGGGACCAATGGCTGAGGTCCCACCCAAGGTCCCTAACCGG  2550

Query 2590  GAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCACCAC  2663
            ||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 2551  GAGGCATCTCTATACTCCCCTCCCTCCACACTCCCCAGAAATAGTCCAACCAAGAGAGTAGATGTCCCCACCAC  2624

Query 2664  TCCTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTATAT  2737
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2625  TCCTGGGGTGCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGGGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTATAT  2698

Query 2738  CTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGAGGA  2811
            ||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2699  CTGCCGTGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCTAGACAGCCGAGTATGAACCGTGGAGGC  2772

Query 2812  TATATGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTGAGTGTTCATCTGCAGCCTTC  2885
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2773  TATATGCCCACCCCAACAGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGGACACCGGTGAGTGTTCATCTGCAGCCCTC  2846

Query 2886  CCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCTTAA  2959
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2847  CCTCTCCAGACAGAGCAGCTATACCAGTAATGGCACCCTCCCCAGGACGGGACTAAAGAGGACACCATCCTTAA  2920

Query 2960  AACCTGACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCACTGAACAAATACACATAC  3033
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2921  AACCTGATGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCGCAAACCACATCTGTCAGACCACTGAACAAGTACACGTAC  2994