Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04171
Subject:
NM_199239.3
Aligned Length:
3091
Identities:
2689
Gaps:
59

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA  74
            |||.||.||.|.||||||||...||.|.|.|||.|.||..||||.|||..|||..||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGGGTTCCTTCTGCTTTGGTTCTGCGTGCTGTTCCTTCTGGTCTCCAGGTTACGGGCGGTCAGCTTCCCAGA  74

Query   75  AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148
            |||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACGATGAGCCCCTCAACACGGTTGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148

Query  149  GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAACGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222

Query  223  GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||.|||||.|||.|
Sbjct  223  GATCAAGTCTATACAGTGAACTTAAATGAAATCCCCCAAACAGAGGTGATACCAAGCAAGAAGCTGACGTGGAG  296

Query  297  ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG  370
            .||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GTCCAGACAGCAGGATCGAGAAAATTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTCATCAAAG  370

Query  371  TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC  444
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGTCCCAAGAAATGATGAGATGGTTTTTGTCTGTGGTACCAATGCTTTCAACCCGATGTGCAGATACTAT  444

Query  445  AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC  518
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  445  AGGTTGAGAACGTTAGAGTATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCACGATGCCCGTTTGATGCCCGACAAAC  518

Query  519  CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA  592
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  CAATGTCGCCCTCTTTGCTGATGGAAAACTCTATTCTGCCACAGTGGCTGATTTCCTGGCCAGTGATGCTGTCA  592

Query  593  TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC  666
            ||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  TTTACAGAAGCATGGGAGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATACGATTCCAAGTGGATCAAAGAACCACAC  666

Query  667  TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TTCCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTCAGAGAAATCGCCGTGGAACATAATAACTT  740

Query  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCTCGCATTTGTAAAAACGACATGGGTGGCTCACAGCGGGTCCTGGAGA  814

Query  815  AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT  888
            |||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  815  AACACTGGACTTCCTTCCTTAAGGCTCGGCTGAACTGCTCCGTTCCTGGAGATTCCTTTTTCTACTTCGACGTC  888

Query  889  CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA  962
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CTGCAGTCTATAACAGACATAATCCAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTTGGGGTCTTCACCACACAGCTCAA  962

Query  963  TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG  1036
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CAGCATTCCTGGTTCTGCAGTCTGTGCCTTTAGCATGGACGACATTGAGAAAGTGTTCAAAGGGCGGTTCAAAG  1036

Query 1037  AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGAAAACCCCAGACTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTACCAAAACCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110

Query 1111  GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC  1184
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||||||||.||
Sbjct 1111  GCCAAACACGGCCTCGCAGAAGCTTACAAGACCTCCATCGACTTTCCAGATGACACCCTGGCTTTCATCAAGTC  1184

Query 1185  TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA  1258
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCCGCTGATGGACTCTGCCGTCCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACACGGGTCAGGTACA  1258

Query 1259  GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332
            |..||||.||||||..||||||||.||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTGACAGCCATCGAAGTGGACCGTTCAGCAGGGCCATACCAAAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332

Query 1333  GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT  1406
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GCTGGCGTGGTACTTAAAGTTTTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTCTGAATGACAGTGTATTACTCGAAGAGAT  1406

Query 1407  TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA  1480
            ||||||.||.||||..||.||||||||.||.||||.||||||.||||.||||||..|||||||||||.||||.|
Sbjct 1407  TGAAGCTTATAACCCAGCCAAGTGCAGCGCCGAGAGTGAGGAGGACAGAAAGGTGGTCTCATTACAGCTGGACA  1480

Query 1481  AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT  1554
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1481  AGGATCACCATGCTTTATACGTGGCCTTCTCTAGCTGCGTGGTCCGCATCCCCCTCAGCCGCTGTGAGCGCTAC  1554

Query 1555  GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG  1628
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||...||||..||
Sbjct 1555  GGATCGTGTAAAAAGTCTTGCATTGCATCACGTGACCCGTACTGTGGTTGGTTAAGCCAGGGAGTTTGTGAGAG  1628

Query 1629  AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC  1702
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||||.|
Sbjct 1629  AGTGACCCTAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGCCCTGGAGGATATGAGC  1702

Query 1703  AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCCA-------------------------------  1745
            |.|||||.||.|.||||||||||||.||.||||||||||||||                               
Sbjct 1703  AGGACACGGAGTACGGCAACACAGCCCACCTAGGGGACTGCCACGAAAGTTTGCCTCCTTCAACTACACCAGAT  1776

Query 1746  --------------------------TGGTGTACGATGGGAAGTCCAGTCTGGAGAGTCCAACCAGATGGTCCA  1793
                                      |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1777  TACAAAATATTTGGCGGTCCAACATCTGGTGTACGGTGGGAAGTCCAGTCTGGAGAATCCAATCAGATGGTCCA  1850

Query 1794  CATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCATTGCAGGTGTGGCAGTATACT  1867
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1851  CATGAATGTCCTCATCACCTGCGTGTTTGCCGCTTTTGTCTTGGGCGCGTTCATCGCAGGAGTGGCCGTGTACT  1924

Query 1868  GCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATGCAGAGTCCGCCCAGTCATGCACAGAC  1941
            ||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  GCTACCGTGACATGTTCGTTCGGAAGAACAGAAAGATCCATAAAGACGCAGAATCCGCCCAGTCGTGCACAGAC  1998

Query 1942  TCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAATACCAACAGAATATTGATTC  2015
            |||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1999  TCCAGCGGAAGCTTCGCCAAGCTGAACGGCCTCTTTGACAGCCCCGTCAAGGAATACCAGCAGAACATTGATTC  2072

Query 2016  TCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCAATGGAGATACTAAATCCATGGTAA  2089
            |||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||....|||||.||.|||||||...
Sbjct 2073  TCCCAAACTCTACAGCAACCTGCTGACCAGTCGGAAGGAACTGCCACCAAACACGGATACAAAGTCCATGGCCG  2146

Query 2090  TGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTACACCCGTGCTTCACCAGAAG  2163
            |||||||..||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 2147  TGGACCACAGAGGCCAGCCTCCCGAGCTGGCTGCTCTCCCCACGCCGGAATCCACACCTGTCCTCCACCAGAAG  2220

Query 2164  ACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTTCAAGGAAAGAA-ACCCCTCAGT  2236
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||.||.||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2221  ACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCTGAGAAGGCCCACAGCCACGGTGCTTCAAGGAAAGAACACCCC-CAGT  2293

Query 2237  TTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAGTCATGGGCATATCCCCAGTGCCATTGTTCTTCCAAAT  2310
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2294  TTTTTCCTTCTAGTCCTCCACCCCATTCCCCATTGAGTCACGGGCATATCCCCAGTGCCATCGTTCTTCCAAAC  2367

Query 2311  GCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAAAAGAAGCTTCAAAACATTGA  2384
            ||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|.|||.||
Sbjct 2368  GCCACTCACGACTACAATACATCCTTCTCCAACTCGAATGCCCACAAAGCCGAAAAGAAGCTTCAGAGCATGGA  2441

Query 2385  TCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCACCGGCGTTCTGTTGATTCCAGAAATACCCTCAATGATC  2458
            |||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 2442  TCACCCTCTTACGAAGTCATCCAGTAAGCGGGAGCACCGGCGGTCTGTGGATTCCAGGAATACTCTCAATGATC  2515

Query 2459  TCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACATCCAGATGGCACACCAGAAC  2532
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||.|.|
Sbjct 2516  TCCTGAAGCATCTAAATGACCCAAACAGTAACCCCAAAGCCATCCTGGGAGAGATCCATATGGCTCATCAAACC  2589

Query 2533  TTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCCCACCTAAAGTCCCTAACCGGGAGGCATCGCTATACTC  2606
            .|.||||||||.||..|||||.|.|||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2590  CTCATGCTGGACCCGGTGGGACCAATGGCTGAGGTCCCACCCAAGGTCCCTAACCGGGAGGCATCTCTATACTC  2663

Query 2607  CCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCACCACTCCTGGAGTCCCAATGA  2680
            ||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2664  CCCTCCCTCCACACTCCCCAGAAATAGTCCAACCAAGAGAGTAGATGTCCCCACCACTCCTGGGGTGCCAATGA  2737

Query 2681  CTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTATATCTGCTATGCCTAAAAAC  2754
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 2738  CTTCTCTGGAAAGACAAAGGGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTATATCTGCCGTGCCTAAAAAC  2811

Query 2755  TTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGAGGATATATGCCCACCCCCAC  2828
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2812  TTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCTAGACAGCCGAGTATGAACCGTGGAGGCTATATGCCCACCCCAAC  2885

Query 2829  TGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTGAGTGTTCATCTGCAGCCTTCCCTCTCCAGACAGAGCA  2902
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2886  AGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGGACACCGGTGAGTGTTCATCTGCAGCCCTCCCTCTCCAGACAGAGCA  2959

Query 2903  GCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCTTAAAACCTGACGTGCCACCA  2976
            ||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2960  GCTATACCAGTAATGGCACCCTCCCCAGGACGGGACTAAAGAGGACACCATCCTTAAAACCTGATGTGCCACCA  3033

Query 2977  AAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCACTGAACAAATACACATAC  3033
            |||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3034  AAGCCTTCCTTTGTTCCGCAAACCACATCTGTCAGACCACTGAACAAGTACACGTAC  3090