Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04171
Subject:
NM_199239.3
Aligned Length:
1030
Identities:
963
Gaps:
19

Alignment

Query    1  MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74
            |...||....|.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGFLLLWFCVLFLLVSRLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74

Query   75  DQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148
            ||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DQVYTVNLNEIPQTEVIPSKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148

Query  149  RLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RLRTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222

Query  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296

Query  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370

Query  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSE  444
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDDTLAFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAIEVDRSAGPYQNYTVIFVGSE  444

Query  445  AGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERY  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  445  AGVVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNPAKCSAESEEDRKVVSLQLDKDHHALYVAFSSCVVRIPLSRCERY  518

Query  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH----------  582
            |||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||..|||||||.||||||||||          
Sbjct  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGVCERVTLGMLLLTEDFFAFHNHSPGGYEQDTEYGNTAHLGDCHESLPPSTTPD  592

Query  583  ---------GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTD  647
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  YKIFGGPTSGVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTD  666

Query  648  SSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQK  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  SSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNTDTKSMAVDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQK  740

Query  722  TLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNID  795
            |||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  741  TLQAMKSHSEKAHSHGASRKEHPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQSMD  814

Query  796  HPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYS  869
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||.|||||.|.|.|||||||||||||||
Sbjct  815  HPLTKSSSKREHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAILGEIHMAHQTLMLDPVGPMAEVPPKVPNREASLYS  888

Query  870  PPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPT  943
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  PPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAVPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPT  962

Query  944  GAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  GAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTTSVRPLNKYTY  1030