Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04171
Subject:
NM_199241.3
Aligned Length:
1086
Identities:
950
Gaps:
88

Alignment

Query    1  MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74
            |...||....|.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGFLLLWFCVLFLLVSRLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGR  74

Query   75  DQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148
            ||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DQVYTVNLNEIPQTEVIPSKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYY  148

Query  149  RLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RLRTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPH  222

Query  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  FLHAIEYGNYVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDV  296

Query  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVPKPRPGCC  370

Query  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSE  444
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  371  AKHGLAEAYKTSIDFPDDTLAFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTAIEVDRSAGPYQNYTVIFVGSE  444

Query  445  AGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERY  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  445  AGVVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNPAKCSAESEEDRKVVSLQLDKDHHALYVAFSSCVVRIPLSRCERY  518

Query  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH----------  582
            |||||||||||||||||||||.|.|||.|||             ..|||||||.||||||||||          
Sbjct  519  GSCKKSCIASRDPYCGWLSQGVCERVTLGML-------------PGGYEQDTEYGNTAHLGDCHESLPPSTTPD  579

Query  583  -----------------------------------------------------------------GVRWEVQSG  591
                                                                             |||||||||
Sbjct  580  YKIFGGPTSDMEVSSSSVTTVASSPEITSKVIDTWRPKLTSSRKFVVQDDPNTSDFTDTISGIPKGVRWEVQSG  653

Query  592  ESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKE  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  ESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKE  727

Query  666  YQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGAS  739
            ||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  728  YQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNTDTKSMAVDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHSHGAS  801

Query  740  RKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDS  813
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||
Sbjct  802  RKEHPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQSMDHPLTKSSSKREHRRSVDS  875

Query  814  RNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPT  887
            |||||||||||||||||||||.|.|.||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  RNTLNDLLKHLNDPNSNPKAILGEIHMAHQTLMLDPVGPMAEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPT  949

Query  888  TPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQP  961
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  TPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAVPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQP  1023

Query  962  SLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1024  SLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTTSVRPLNKYTY  1073