Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04171
Subject:
XM_006499112.3
Aligned Length:
3259
Identities:
2688
Gaps:
227

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA  74
            |||.||.||.|.||||||||...||.|.|.|||.|.||..||||.|||..|||..||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGGGTTCCTTCTGCTTTGGTTCTGCGTGCTGTTCCTTCTGGTCTCCAGGTTACGGGCGGTCAGCTTCCCAGA  74

Query   75  AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148
            |||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACGATGAGCCCCTCAACACGGTTGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148

Query  149  GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAACGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222

Query  223  GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||.|||||.|||.|
Sbjct  223  GATCAAGTCTATACAGTGAACTTAAATGAAATCCCCCAAACAGAGGTGATACCAAGCAAGAAGCTGACGTGGAG  296

Query  297  ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG  370
            .||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GTCCAGACAGCAGGATCGAGAAAATTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTCATCAAAG  370

Query  371  TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC  444
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGTCCCAAGAAATGATGAGATGGTTTTTGTCTGTGGTACCAATGCTTTCAACCCGATGTGCAGATACTAT  444

Query  445  AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC  518
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  445  AGGTTGAGAACGTTAGAGTATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCACGATGCCCGTTTGATGCCCGACAAAC  518

Query  519  CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA  592
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  CAATGTCGCCCTCTTTGCTGATGGAAAACTCTATTCTGCCACAGTGGCTGATTTCCTGGCCAGTGATGCTGTCA  592

Query  593  TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC  666
            ||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  TTTACAGAAGCATGGGAGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATACGATTCCAAGTGGATCAAAGAACCACAC  666

Query  667  TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TTCCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTCAGAGAAATCGCCGTGGAACATAATAACTT  740

Query  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCTCGCATTTGTAAAAACGACATGGGTGGCTCACAGCGGGTCCTGGAGA  814

Query  815  AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT  888
            |||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  815  AACACTGGACTTCCTTCCTTAAGGCTCGGCTGAACTGCTCCGTTCCTGGAGATTCCTTTTTCTACTTCGACGTC  888

Query  889  CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA  962
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CTGCAGTCTATAACAGACATAATCCAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTTGGGGTCTTCACCACACAGCTCAA  962

Query  963  TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG  1036
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CAGCATTCCTGGTTCTGCAGTCTGTGCCTTTAGCATGGACGACATTGAGAAAGTGTTCAAAGGGCGGTTCAAAG  1036

Query 1037  AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGAAAACCCCAGACTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTACCAAAACCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110

Query 1111  GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC  1184
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||||||||.||
Sbjct 1111  GCCAAACACGGCCTCGCAGAAGCTTACAAGACCTCCATCGACTTTCCAGATGACACCCTGGCTTTCATCAAGTC  1184

Query 1185  TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA  1258
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCCGCTGATGGACTCTGCCGTCCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACACGGGTCAGGTACA  1258

Query 1259  GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332
            |..||||.||||||..||||||||.||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTGACAGCCATCGAAGTGGACCGTTCAGCAGGGCCATACCAAAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332

Query 1333  GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT  1406
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GCTGGCGTGGTACTTAAAGTTTTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTCTGAATGACAGTGTATTACTCGAAGAGAT  1406

Query 1407  TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA  1480
            ||||||.||.||||..||.||||||||.||.||||.||||||.||||.||||||..|||||||||||.||||.|
Sbjct 1407  TGAAGCTTATAACCCAGCCAAGTGCAGCGCCGAGAGTGAGGAGGACAGAAAGGTGGTCTCATTACAGCTGGACA  1480

Query 1481  AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT  1554
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1481  AGGATCACCATGCTTTATACGTGGCCTTCTCTAGCTGCGTGGTCCGCATCCCCCTCAGCCGCTGTGAGCGCTAC  1554

Query 1555  GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG  1628
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||...||||..||
Sbjct 1555  GGATCGTGTAAAAAGTCTTGCATTGCATCACGTGACCCGTACTGTGGTTGGTTAAGCCAGGGAGTTTGTGAGAG  1628

Query 1629  AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC  1702
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||||.|
Sbjct 1629  AGTGACCCTAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGCCCTGGAGGATATGAGC  1702

Query 1703  AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCC--------------------------------  1744
            |.|||||.||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||                                
Sbjct 1703  AGGACACGGAGTACGGCAACACAGCCCACCTAGGGGACTGCCACGAAAGTTTGCCTCCTTCAACTACACCAGAT  1776

Query 1745  --------------------------------------------------------------------------  1744
                                                                                      
Sbjct 1777  TACAAAATATTTGGCGGTCCAACATCTGACATGGAGGTATCCTCATCTTCTGTTACCACTGTGGCAAGTAGCCC  1850

Query 1745  --------------------------------------------------------------------------  1744
                                                                                      
Sbjct 1851  AGAAATTACATCTAAAGTGATTGATACCTGGAGACCTAAACTGACGAGCTCCCGGAAATTTGTAGTTCAAGATG  1924

Query 1745  ---------------------------------------------ATGGTGTACGATGGGAAGTCCAGTCTGGA  1773
                                                         |.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCCAAATACTTCTGATTTTACTGATACTATATCAGGTATCCCAAAGGGTGTACGGTGGGAAGTCCAGTCTGGA  1998

Query 1774  GAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCATTCAT  1847
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1999  GAATCCAATCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGCGTGTTTGCCGCTTTTGTCTTGGGCGCGTTCAT  2072

Query 1848  TGCAGGTGTGGCAGTATACTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATGCAGAGT  1921
            .|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2073  CGCAGGAGTGGCCGTGTACTGCTACCGTGACATGTTCGTTCGGAAGAACAGAAAGATCCATAAAGACGCAGAAT  2146

Query 1922  CCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCAAGGAA  1995
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2147  CCGCCCAGTCGTGCACAGACTCCAGCGGAAGCTTCGCCAAGCTGAACGGCCTCTTTGACAGCCCCGTCAAGGAA  2220

Query 1996  TACCAACAGAATATTGATTCTCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCCAATGG  2069
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||...
Sbjct 2221  TACCAGCAGAACATTGATTCTCCCAAACTCTACAGCAACCTGCTGACCAGTCGGAAGGAACTGCCACCAAACAC  2294

Query 2070  AGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGAGTCTA  2143
            .|||||.||.|||||||...|||||||..||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.||.||.||.|
Sbjct 2295  GGATACAAAGTCCATGGCCGTGGACCACAGAGGCCAGCCTCCCGAGCTGGCTGCTCTCCCCACGCCGGAATCCA  2368

Query 2144  CACCCGTGCTTCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAGCTTCA  2217
            ||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||.||.||||||
Sbjct 2369  CACCTGTCCTCCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCTGAGAAGGCCCACAGCCACGGTGCTTCA  2442

Query 2218  AGGAAAGAA-ACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAGTCATGGGCATATCCCCA  2290
            ||||||||| ||||| |||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2443  AGGAAAGAACACCCC-CAGTTTTTTCCTTCTAGTCCTCCACCCCATTCCCCATTGAGTCACGGGCATATCCCCA  2515

Query 2291  GTGCCATTGTTCTTCCAAATGCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAGCTGAA  2364
            |||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2516  GTGCCATCGTTCTTCCAAACGCCACTCACGACTACAATACATCCTTCTCCAACTCGAATGCCCACAAAGCCGAA  2589

Query 2365  AAGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCACCGGCGTTCTGTTGATTC  2438
            |||||||||||.|.|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2590  AAGAAGCTTCAGAGCATGGATCACCCTCTTACGAAGTCATCCAGTAAGCGGGAGCACCGGCGGTCTGTGGATTC  2663

Query 2439  CAGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGGAGACA  2512
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 2664  CAGGAATACTCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTAAATGACCCAAACAGTAACCCCAAAGCCATCCTGGGAGAGA  2737

Query 2513  TCCAGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCCCACCTAAAGTCCCTAAC  2586
            ||||.|||||.||.||.|.|.|.||||||||.||..|||||.|.|||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2738  TCCATATGGCTCATCAAACCCTCATGCTGGACCCGGTGGGACCAATGGCTGAGGTCCCACCCAAGGTCCCTAAC  2811

Query 2587  CGGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTCCCCAC  2660
            |||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 2812  CGGGAGGCATCTCTATACTCCCCTCCCTCCACACTCCCCAGAAATAGTCCAACCAAGAGAGTAGATGTCCCCAC  2885

Query 2661  CACTCCTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTA  2734
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  CACTCCTGGGGTGCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGGGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCACTCTA  2959

Query 2735  TATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACCGTGGA  2808
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2960  TATCTGCCGTGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCTAGACAGCCGAGTATGAACCGTGGA  3033

Query 2809  GGATATATGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTGAGTGTTCATCTGCAGCC  2882
            ||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3034  GGCTATATGCCCACCCCAACAGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGGACACCGGTGAGTGTTCATCTGCAGCC  3107

Query 2883  TTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCCGTCCT  2956
            .|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 3108  CTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTATACCAGTAATGGCACCCTCCCCAGGACGGGACTAAAGAGGACACCATCCT  3181

Query 2957  TAAAACCTGACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCACTGAACAAATACACA  3030
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 3182  TAAAACCTGATGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCGCAAACCACATCTGTCAGACCACTGAACAAGTACACG  3255

Query 3031  TAC  3033
            |||
Sbjct 3256  TAC  3258