Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04171
Subject:
XM_017317010.1
Aligned Length:
3202
Identities:
2688
Gaps:
170

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA  74
            |||.||.||.|.||||||||...||.|.|.|||.|.||..||||.|||..|||..||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGGGTTCCTTCTGCTTTGGTTCTGCGTGCTGTTCCTTCTGGTCTCCAGGTTACGGGCGGTCAGCTTCCCAGA  74

Query   75  AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148
            |||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACGATGAGCCCCTCAACACGGTTGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148

Query  149  GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAACGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222

Query  223  GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||.|||||.|||.|
Sbjct  223  GATCAAGTCTATACAGTGAACTTAAATGAAATCCCCCAAACAGAGGTGATACCAAGCAAGAAGCTGACGTGGAG  296

Query  297  ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG  370
            .||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GTCCAGACAGCAGGATCGAGAAAATTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTCATCAAAG  370

Query  371  TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC  444
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGTCCCAAGAAATGATGAGATGGTTTTTGTCTGTGGTACCAATGCTTTCAACCCGATGTGCAGATACTAT  444

Query  445  AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC  518
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  445  AGGTTGAGAACGTTAGAGTATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCACGATGCCCGTTTGATGCCCGACAAAC  518

Query  519  CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA  592
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  CAATGTCGCCCTCTTTGCTGATGGAAAACTCTATTCTGCCACAGTGGCTGATTTCCTGGCCAGTGATGCTGTCA  592

Query  593  TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC  666
            ||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  TTTACAGAAGCATGGGAGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATACGATTCCAAGTGGATCAAAGAACCACAC  666

Query  667  TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TTCCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTCAGAGAAATCGCCGTGGAACATAATAACTT  740

Query  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCTCGCATTTGTAAAAACGACATGGGTGGCTCACAGCGGGTCCTGGAGA  814

Query  815  AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT  888
            |||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  815  AACACTGGACTTCCTTCCTTAAGGCTCGGCTGAACTGCTCCGTTCCTGGAGATTCCTTTTTCTACTTCGACGTC  888

Query  889  CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA  962
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CTGCAGTCTATAACAGACATAATCCAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTTGGGGTCTTCACCACACAGCTCAA  962

Query  963  TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG  1036
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CAGCATTCCTGGTTCTGCAGTCTGTGCCTTTAGCATGGACGACATTGAGAAAGTGTTCAAAGGGCGGTTCAAAG  1036

Query 1037  AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGAAAACCCCAGACTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTACCAAAACCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110

Query 1111  GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC  1184
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||||||||.||
Sbjct 1111  GCCAAACACGGCCTCGCAGAAGCTTACAAGACCTCCATCGACTTTCCAGATGACACCCTGGCTTTCATCAAGTC  1184

Query 1185  TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA  1258
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCCGCTGATGGACTCTGCCGTCCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACACGGGTCAGGTACA  1258

Query 1259  GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332
            |..||||.||||||..||||||||.||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTGACAGCCATCGAAGTGGACCGTTCAGCAGGGCCATACCAAAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332

Query 1333  GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT  1406
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GCTGGCGTGGTACTTAAAGTTTTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTCTGAATGACAGTGTATTACTCGAAGAGAT  1406

Query 1407  TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA  1480
            ||||||.||.||||..||.||||||||.||.||||.||||||.||||.||||||..|||||||||||.||||.|
Sbjct 1407  TGAAGCTTATAACCCAGCCAAGTGCAGCGCCGAGAGTGAGGAGGACAGAAAGGTGGTCTCATTACAGCTGGACA  1480

Query 1481  AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT  1554
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1481  AGGATCACCATGCTTTATACGTGGCCTTCTCTAGCTGCGTGGTCCGCATCCCCCTCAGCCGCTGTGAGCGCTAC  1554

Query 1555  GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG  1628
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||...||||..||
Sbjct 1555  GGATCGTGTAAAAAGTCTTGCATTGCATCACGTGACCCGTACTGTGGTTGGTTAAGCCAGGGAGTTTGTGAGAG  1628

Query 1629  AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC  1702
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||||.|
Sbjct 1629  AGTGACCCTAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGCCCTGGAGGATATGAGC  1702

Query 1703  AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCC--------------------------------  1744
            |.|||||.||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||                                
Sbjct 1703  AGGACACGGAGTACGGCAACACAGCCCACCTAGGGGACTGCCACGACATGGAGGTATCCTCATCTTCTGTTACC  1776

Query 1745  --------------------------------------------------------------------------  1744
                                                                                      
Sbjct 1777  ACTGTGGCAAGTAGCCCAGAAATTACATCTAAAGTGATTGATACCTGGAGACCTAAACTGACGAGCTCCCGGAA  1850

Query 1745  --------------------------------------------------------------ATGGTGTACGAT  1756
                                                                          |.||||||||.|
Sbjct 1851  ATTTGTAGTTCAAGATGACCCAAATACTTCTGATTTTACTGATACTATATCAGGTATCCCAAAGGGTGTACGGT  1924

Query 1757  GGGAAGTCCAGTCTGGAGAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTT  1830
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1925  GGGAAGTCCAGTCTGGAGAATCCAATCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGCGTGTTTGCCGCTTTT  1998

Query 1831  GTTTTGGGGGCATTCATTGCAGGTGTGGCAGTATACTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGAT  1904
            ||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1999  GTCTTGGGCGCGTTCATCGCAGGAGTGGCCGTGTACTGCTACCGTGACATGTTCGTTCGGAAGAACAGAAAGAT  2072

Query 1905  CCATAAAGATGCAGAGTCCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTG  1978
            |||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2073  CCATAAAGACGCAGAATCCGCCCAGTCGTGCACAGACTCCAGCGGAAGCTTCGCCAAGCTGAACGGCCTCTTTG  2146

Query 1979  ACAGCCCTGTCAAGGAATACCAACAGAATATTGATTCTCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAA  2052
            |||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2147  ACAGCCCCGTCAAGGAATACCAGCAGAACATTGATTCTCCCAAACTCTACAGCAACCTGCTGACCAGTCGGAAG  2220

Query 2053  GAGCTACCACCCAATGGAGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCT  2126
            ||.||.|||||.||....|||||.||.|||||||...|||||||..||||.||.|||||.|||.||||||||||
Sbjct 2221  GAACTGCCACCAAACACGGATACAAAGTCCATGGCCGTGGACCACAGAGGCCAGCCTCCCGAGCTGGCTGCTCT  2294

Query 2127  TCCTACTCCTGAGTCTACACCCGTGCTTCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCC  2200
            .||.||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2295  CCCCACGCCGGAATCCACACCTGTCCTCCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCTGAGAAGGCCC  2368

Query 2201  ATGGCCATGGAGCTTCAAGGAAAGAA-ACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAG  2273
            |..||||.||.||||||||||||||| ||||| |||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 2369  ACAGCCACGGTGCTTCAAGGAAAGAACACCCC-CAGTTTTTTCCTTCTAGTCCTCCACCCCATTCCCCATTGAG  2441

Query 2274  TCATGGGCATATCCCCAGTGCCATTGTTCTTCCAAATGCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCA  2347
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 2442  TCACGGGCATATCCCCAGTGCCATCGTTCTTCCAAACGCCACTCACGACTACAATACATCCTTCTCCAACTCGA  2515

Query 2348  ATGCTCACAAAGCTGAAAAGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCAC  2421
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||
Sbjct 2516  ATGCCCACAAAGCCGAAAAGAAGCTTCAGAGCATGGATCACCCTCTTACGAAGTCATCCAGTAAGCGGGAGCAC  2589

Query 2422  CGGCGTTCTGTTGATTCCAGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAA  2495
            |||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2590  CGGCGGTCTGTGGATTCCAGGAATACTCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTAAATGACCCAAACAGTAACCCCAA  2663

Query 2496  AGCCATCATGGGAGACATCCAGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCC  2569
            |||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||.|.|.|.||||||||.||..|||||.|.|||.|||||||||
Sbjct 2664  AGCCATCCTGGGAGAGATCCATATGGCTCATCAAACCCTCATGCTGGACCCGGTGGGACCAATGGCTGAGGTCC  2737

Query 2570  CACCTAAAGTCCCTAACCGGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAG  2643
            ||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2738  CACCCAAGGTCCCTAACCGGGAGGCATCTCTATACTCCCCTCCCTCCACACTCCCCAGAAATAGTCCAACCAAG  2811

Query 2644  CGAGTGGATGTCCCCACCACTCCTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTC  2717
            .||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2812  AGAGTAGATGTCCCCACCACTCCTGGGGTGCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGGGGTTATCACAAAAATTC  2885

Query 2718  CTCCCAGAGGCACTCTATATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGC  2791
            ||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2886  CTCCCAGAGGCACTCTATATCTGCCGTGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCTAGACAGC  2959

Query 2792  CTAGTATGAACCGTGGAGGATATATGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTG  2865
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2960  CGAGTATGAACCGTGGAGGCTATATGCCCACCCCAACAGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGGACACCGGTG  3033

Query 2866  AGTGTTCATCTGCAGCCTTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACT  2939
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 3034  AGTGTTCATCTGCAGCCCTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTATACCAGTAATGGCACCCTCCCCAGGACGGGACT  3107

Query 2940  AAAGAGGACGCCGTCCTTAAAACCTGACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGAC  3013
            |||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 3108  AAAGAGGACACCATCCTTAAAACCTGATGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCGCAAACCACATCTGTCAGAC  3181

Query 3014  CACTGAACAAATACACATAC  3033
            ||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3182  CACTGAACAAGTACACGTAC  3201