Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04171
Subject:
XM_017317014.1
Aligned Length:
3190
Identities:
2650
Gaps:
197

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCTTCCTGCTTTGTGCCTACATACTGCTGCTGATGGTTTCCCAGTTGAGGGCAGTCAGCTTTCCTGA  74
            |||.||.||.|.||||||||...||.|.|.|||.|.||..||||.|||..|||..||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGGGTTCCTTCTGCTTTGGTTCTGCGTGCTGTTCCTTCTGGTCTCCAGGTTACGGGCGGTCAGCTTCCCAGA  74

Query   75  AGATGATGAACCCCTTAATACTGTCGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148
            |||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACGATGAGCCCCTCAACACGGTTGACTATCACTATTCAAGGCAATATCCGGTTTTTAGAGGACGCCCTTCAG  148

Query  149  GCAATGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAACGAATCGCAGCACAGGCTGGACTTTCAGCTGATGTTGAAAATTCGAGACACACTTTATATTGCTGGCAGG  222

Query  223  GATCAAGTTTATACAGTAAACTTAAATGAAATGCCCAAAACAGAAGTAATACCCAACAAGAAACTGACATGGCG  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|.||||||.|||||.|||.|
Sbjct  223  GATCAAGTCTATACAGTGAACTTAAATGAAATCCCCCAAACAGAGGTGATACCAAGCAAGAAGCTGACGTGGAG  296

Query  297  ATCAAGACAACAGGATCGAGAAAACTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTTATCAAAG  370
            .||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GTCCAGACAGCAGGATCGAGAAAATTGTGCTATGAAAGGCAAGCATAAAGATGAATGCCACAACTTCATCAAAG  370

Query  371  TATTTGTTCCAAGAAACGATGAGATGGTTTTTGTTTGTGGTACCAATGCATTCAATCCCATGTGTAGATACTAC  444
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGTCCCAAGAAATGATGAGATGGTTTTTGTCTGTGGTACCAATGCTTTCAACCCGATGTGCAGATACTAT  444

Query  445  AGGTTGAGTACCTTAGAATATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCAAGATGCCCATTTGATGCCAGACAAAC  518
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  445  AGGTTGAGAACGTTAGAGTATGATGGGGAAGAAATTAGTGGCCTGGCACGATGCCCGTTTGATGCCCGACAAAC  518

Query  519  CAATGTTGCCCTCTTTGCTGATGGGAAGCTGTATTCTGCCACAGTGGCTGACTTCTTGGCCAGCGATGCCGTTA  592
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  CAATGTCGCCCTCTTTGCTGATGGAAAACTCTATTCTGCCACAGTGGCTGATTTCCTGGCCAGTGATGCTGTCA  592

Query  593  TTTATCGAAGCATGGGTGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATATGATTCCAAATGGATAAAAGAGCCACAC  666
            ||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  TTTACAGAAGCATGGGAGATGGATCTGCCCTTCGCACAATAAAATACGATTCCAAGTGGATCAAAGAACCACAC  666

Query  667  TTTCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTTCGAGAAATCGCTGTCGAACATAATAATTT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TTCCTTCATGCCATAGAATATGGAAACTATGTCTATTTCTTCTTCAGAGAAATCGCCGTGGAACATAATAACTT  740

Query  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCCCGCATATGTAAAAACGACATGGGTGGTTCCCAGCGGGTCCTGGAGA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCAAGGCTGTGTATTCCCGCGTGGCTCGCATTTGTAAAAACGACATGGGTGGCTCACAGCGGGTCCTGGAGA  814

Query  815  AACACTGGACTTCATTTCTAAAGGCTCGGCTGAACTGTTCTGTCCCTGGAGATTCGTTTTTCTACTTTGATGTT  888
            |||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  815  AACACTGGACTTCCTTCCTTAAGGCTCGGCTGAACTGCTCCGTTCCTGGAGATTCCTTTTTCTACTTCGACGTC  888

Query  889  CTGCAGTCTATTACAGACATAATACAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTCGGGGTGTTTACCACGCAGCTCAA  962
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CTGCAGTCTATAACAGACATAATCCAAATCAATGGCATCCCCACTGTGGTTGGGGTCTTCACCACACAGCTCAA  962

Query  963  TAGCATCCCTGGTTCTGCTGTCTGTGCATTTAGCATGGATGACATTGAAAAAGTATTCAAAGGACGGTTTAAGG  1036
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CAGCATTCCTGGTTCTGCAGTCTGTGCCTTTAGCATGGACGACATTGAGAAAGTGTTCAAAGGGCGGTTCAAAG  1036

Query 1037  AACAGAAAACTCCAGATTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTGCCAAAGCCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGAAAACCCCAGACTCTGTTTGGACAGCAGTTCCCGAAGACAAAGTACCAAAACCAAGGCCTGGCTGTTGT  1110

Query 1111  GCAAAACACGGCCTTGCCGAAGCTTATAAAACCTCCATCGATTTCCCGGATGAAACTCTGTCATTCATCAAATC  1184
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||||||||.||
Sbjct 1111  GCCAAACACGGCCTCGCAGAAGCTTACAAGACCTCCATCGACTTTCCAGATGACACCCTGGCTTTCATCAAGTC  1184

Query 1185  TCATCCCCTGATGGACTCTGCCGTTCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACTCGGGTCAGGTACA  1258
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCACCCGCTGATGGACTCTGCCGTCCCACCCATTGCCGATGAGCCCTGGTTCACAAAGACACGGGTCAGGTACA  1258

Query 1259  GACTGACGGCCATCTCAGTGGACCATTCAGCCGGACCCTACCAGAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332
            |..||||.||||||..||||||||.||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGTTGACAGCCATCGAAGTGGACCGTTCAGCAGGGCCATACCAAAACTACACAGTCATCTTTGTTGGCTCTGAA  1332

Query 1333  GCTGGCATGGTACTTAAAGTTCTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTTTGAACGACAGCGTATTACTGGAAGAGAT  1406
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GCTGGCGTGGTACTTAAAGTTTTGGCAAAGACCAGTCCTTTCTCTCTGAATGACAGTGTATTACTCGAAGAGAT  1406

Query 1407  TGAAGCCTACAACCATGCAAAGTGCAGTGCTGAGAATGAGGAAGACAAAAAGGTCATCTCATTACAGTTGGATA  1480
            ||||||.||.||||..||.||||||||.||.||||.||||||.||||.||||||..|||||||||||.||||.|
Sbjct 1407  TGAAGCTTATAACCCAGCCAAGTGCAGCGCCGAGAGTGAGGAGGACAGAAAGGTGGTCTCATTACAGCTGGACA  1480

Query 1481  AAGATCACCACGCTTTATATGTGGCGTTCTCTAGCTGCATTATCCGCATCCCCCTCAGTCGCTGTGAGCGTTAT  1554
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1481  AGGATCACCATGCTTTATACGTGGCCTTCTCTAGCTGCGTGGTCCGCATCCCCCTCAGCCGCTGTGAGCGCTAC  1554

Query 1555  GGATCATGTAAAAAGTCTTGTATTGCATCTCGTGACCCGTATTGTGGCTGGTTAAGCCAGGGATCCTGTGGTAG  1628
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||...||||..||
Sbjct 1555  GGATCGTGTAAAAAGTCTTGCATTGCATCACGTGACCCGTACTGTGGTTGGTTAAGCCAGGGAGTTTGTGAGAG  1628

Query 1629  AGTGACCCCAGGGATGCTGCTGTTAACCGAAGACTTCTTTGCTTTCCATAACCACAGTGCTGAAGGATATGAAC  1702
            ||||||||.|||||||||.|                                       |||.|||||||||.|
Sbjct 1629  AGTGACCCTAGGGATGCTCC---------------------------------------CTGGAGGATATGAGC  1663

Query 1703  AAGACACAGAATTCGGCAACACAGCTCATCTAGGGGACTGCCA-------------------------------  1745
            |.|||||.||.|.||||||||||||.||.||||||||||||||                               
Sbjct 1664  AGGACACGGAGTACGGCAACACAGCCCACCTAGGGGACTGCCACGACATGGAGGTATCCTCATCTTCTGTTACC  1737

Query 1746  --------------------------------------------------------------------------  1745
                                                                                      
Sbjct 1738  ACTGTGGCAAGTAGCCCAGAAATTACATCTAAAGTGATTGATACCTGGAGACCTAAACTGACGAGCTCCCGGAA  1811

Query 1746  ---------------------------------------------------TGGTGTACGATGGGAAGTCCAGT  1768
                                                               .||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1812  ATTTGTAGTTCAAGATGACCCAAATACTTCTGATTTTACTGATACTATATCAGGTGTACGGTGGGAAGTCCAGT  1885

Query 1769  CTGGAGAGTCCAACCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGTGTCTTTGCTGCTTTTGTTTTGGGGGCA  1842
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1886  CTGGAGAATCCAATCAGATGGTCCACATGAATGTCCTCATCACCTGCGTGTTTGCCGCTTTTGTCTTGGGCGCG  1959

Query 1843  TTCATTGCAGGTGTGGCAGTATACTGCTATCGAGACATGTTTGTTCGGAAAAACAGAAAGATCCATAAAGATGC  1916
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1960  TTCATCGCAGGAGTGGCCGTGTACTGCTACCGTGACATGTTCGTTCGGAAGAACAGAAAGATCCATAAAGACGC  2033

Query 1917  AGAGTCCGCCCAGTCATGCACAGACTCCAGTGGAAGTTTTGCCAAACTGAATGGTCTCTTTGACAGCCCTGTCA  1990
            |||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2034  AGAATCCGCCCAGTCGTGCACAGACTCCAGCGGAAGCTTCGCCAAGCTGAACGGCCTCTTTGACAGCCCCGTCA  2107

Query 1991  AGGAATACCAACAGAATATTGATTCTCCTAAACTGTATAGTAACCTGCTAACCAGTCGGAAAGAGCTACCACCC  2064
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2108  AGGAATACCAGCAGAACATTGATTCTCCCAAACTCTACAGCAACCTGCTGACCAGTCGGAAGGAACTGCCACCA  2181

Query 2065  AATGGAGATACTAAATCCATGGTAATGGACCATCGAGGGCAACCTCCAGAGTTGGCTGCTCTTCCTACTCCTGA  2138
            ||....|||||.||.|||||||...|||||||..||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 2182  AACACGGATACAAAGTCCATGGCCGTGGACCACAGAGGCCAGCCTCCCGAGCTGGCTGCTCTCCCCACGCCGGA  2255

Query 2139  GTCTACACCCGTGCTTCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCAGAAAAGGCCCATGGCCATGGAG  2212
            .||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||.||.|
Sbjct 2256  ATCCACACCTGTCCTCCACCAGAAGACCCTGCAGGCCATGAAGAGCCACTCTGAGAAGGCCCACAGCCACGGTG  2329

Query 2213  CTTCAAGGAAAGAA-ACCCCTCAGTTTTTTCCGTCTAGTCCGCCACCTCATTCCCCATTAAGTCATGGGCATAT  2285
            |||||||||||||| ||||| |||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2330  CTTCAAGGAAAGAACACCCC-CAGTTTTTTCCTTCTAGTCCTCCACCCCATTCCCCATTGAGTCACGGGCATAT  2402

Query 2286  CCCCAGTGCCATTGTTCTTCCAAATGCTACCCATGACTACAACACGTCTTTCTCAAACTCCAATGCTCACAAAG  2359
            ||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 2403  CCCCAGTGCCATCGTTCTTCCAAACGCCACTCACGACTACAATACATCCTTCTCCAACTCGAATGCCCACAAAG  2476

Query 2360  CTGAAAAGAAGCTTCAAAACATTGATCACCCTCTCACAAAGTCATCCAGTAAGAGAGATCACCGGCGTTCTGTT  2433
            |.||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.
Sbjct 2477  CCGAAAAGAAGCTTCAGAGCATGGATCACCCTCTTACGAAGTCATCCAGTAAGCGGGAGCACCGGCGGTCTGTG  2550

Query 2434  GATTCCAGAAATACCCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTGAATGACCCAAATAGTAACCCCAAAGCCATCATGGG  2507
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2551  GATTCCAGGAATACTCTCAATGATCTCCTGAAGCATCTAAATGACCCAAACAGTAACCCCAAAGCCATCCTGGG  2624

Query 2508  AGACATCCAGATGGCACACCAGAACTTAATGCTGGATCCCATGGGATCGATGTCTGAGGTCCCACCTAAAGTCC  2581
            |||.|||||.|||||.||.||.|.|.|.||||||||.||..|||||.|.|||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct 2625  AGAGATCCATATGGCTCATCAAACCCTCATGCTGGACCCGGTGGGACCAATGGCTGAGGTCCCACCCAAGGTCC  2698

Query 2582  CTAACCGGGAGGCATCGCTATACTCCCCTCCTTCAACTCTCCCCAGAAATAGCCCAACCAAGCGAGTGGATGTC  2655
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 2699  CTAACCGGGAGGCATCTCTATACTCCCCTCCCTCCACACTCCCCAGAAATAGTCCAACCAAGAGAGTAGATGTC  2772

Query 2656  CCCACCACTCCTGGAGTCCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGAGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCA  2729
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2773  CCCACCACTCCTGGGGTGCCAATGACTTCTCTGGAAAGACAAAGGGGTTATCACAAAAATTCCTCCCAGAGGCA  2846

Query 2730  CTCTATATCTGCTATGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCCAGACAGCCTAGTATGAACC  2803
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2847  CTCTATATCTGCCGTGCCTAAAAACTTAAACTCACCAAATGGTGTTTTGTTATCTAGACAGCCGAGTATGAACC  2920

Query 2804  GTGGAGGATATATGCCCACCCCCACTGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGAACACCAGTGAGTGTTCATCTG  2877
            |||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 2921  GTGGAGGCTATATGCCCACCCCAACAGGGGCGAAGGTGGACTATATTCAGGGGACACCGGTGAGTGTTCATCTG  2994

Query 2878  CAGCCTTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTACACCAGTAATGGCACTCTTCCTAGGACGGGACTAAAGAGGACGCC  2951
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2995  CAGCCCTCCCTCTCCAGACAGAGCAGCTATACCAGTAATGGCACCCTCCCCAGGACGGGACTAAAGAGGACACC  3068

Query 2952  GTCCTTAAAACCTGACGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCTCAAACCCCATCTGTCAGACCACTGAACAAAT  3025
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3069  ATCCTTAAAACCTGATGTGCCACCAAAGCCTTCCTTTGTTCCGCAAACCACATCTGTCAGACCACTGAACAAGT  3142

Query 3026  ACACATAC  3033
            ||||.|||
Sbjct 3143  ACACGTAC  3150