Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04177
Subject:
NM_001164422.1
Aligned Length:
813
Identities:
653
Gaps:
54

Alignment

Query   1  ATGGAGGCCGAGGGCCTGGACTGGCTCCTGGTGCCACTGCACCAGCTGGTGTCCTGGGGCGCGGCCGCGGCCAT  74
           |||||.||.||.|||.|||..|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||..||.||.|.||||||
Sbjct   1  ATGGAAGCGGAAGGCTTGGGATGGCTTCTGGTCCCGCTGCACCAGCTGGTTTCCTGGGTGGCCGCTGGGGCCAT  74

Query  75  GGTCTTCGGAGGGGTGGTGCCCTACGTCCCGCAGTATCGGGACATTCGCAGGACGCAGAACGCCGACGGCTTCT  148
           |||||||||||||||.||.||.|||.|.||.||.||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  75  GGTCTTCGGAGGGGTAGTACCGTACATACCCCAATACAGGGACATCCGGAGGACTCAGAATGCCGACGGTTTCT  148

Query 149  CCACCTACGTGTGCCTGGTGCTGCTGGTGGCCAACATTTTGCGGATACTCTTCTGGTTTGGAAGGCGCTTTGAG  222
           |||||.|.||||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||
Sbjct 149  CCACCCATGTGTGCCTGGTGCTATTGGTGGCCAATATTTTACGGATACTCTTTTGGTTCGGAAGGCACTTCGAG  222

Query 223  TCCCCGCTGCTGTGGCAGAGCGCCATCATGATCCTGACCATGCTGCTGATGCTGAAGCTGTGCACCGAGGTCCG  296
           ||||||||.||||||||||||....||||||||||.||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223  TCCCCGCTCCTGTGGCAGAGCATAGTCATGATCCTTACGATGTTGCTCATGCTGAAGCTCTGCACCGAGGTCCG  296

Query 297  TGTGGCCAACGAGCTCAACGCCAGGCGCCGCTCCTTTACAGCTGCAGATAGCAAGGATGAAGAAGTCAAGGTTG  370
           .||||||||.|||||.|||..||.|||||||||||||.||                                  
Sbjct 297  CGTGGCCAATGAGCTGAACATCAAGCGCCGCTCCTTTGCA----------------------------------  336

Query 371  CCCCCAGGCGGTCCTTCCTGGACTTCGACCCCCACCACTTCTGGCAGTGGAGCAGCTTCTCGGACTACGTGCAG  444
                               |||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 337  --------------------GACTTTGATCCTCACCACTTCTGGCACTGGAGCAGCTTCTCAGACTATGTGCAG  390

Query 445  TGCGTCCTGGCCTTCACGGGCGTGGCGGGCTACATCACCTACCTGTCCATTGACTCCGCCCTGTTTGTGGAGAC  518
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 391  TGTGTCCTGGCCTTCACGGGCGTGGCGGGCTACATCACCTACCTGTCCATCGACTCGGCTCTGTTTGTGGAGAC  464

Query 519  CCTGGGCTTCCTGGCTGTGCTGACCGAAGCCATGCTGGGTGTGCCCCAGCTTTACCGCAACCACCGCCACCAGT  592
           .|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||.||||||..|
Sbjct 465  GCTGGGCTTCCTGGCTGTGCTGACTGAAGCCATGCTGGGGGTGCCACAGCTGTACCGAAACTACTGCCACCGCT  538

Query 593  CCACGGAGGGCATGAGCATCAAGATGGTGCTCATGTGGACCAGTGGTGACGCCTTCAAGACGGCCTACTTCCTG  666
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 539  CCACGGAGGGCATGAGCCTCAAGATGGTGCTCATGTGGACAAGTGGTGACACCTTCAAGACGGCCTACTTCTTG  612

Query 667  CTGAAGGGTGCCCCTCTGCAGTTCTCCGTGTGCGGCCTGCTGCAGGTGCTGGTGGACCTGGCCATCCTGGGGCA  740
           ||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||..||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 613  CTCAACGGCGCACCTCTGCAGTTCTCAGTCTGCGGTCTACTACAGGTCATGGTGGACCTGGTCATCCTGGGGCA  686

Query 741  GGCCTACGCCTTCGCCCGCCACCCCCAGAAGCCGGCGCCCCACGCCGTGCACCCCACTGGCACCAAGGCCCTC  813
           ||||||.|||||.||.|.|||||||||||||||.|||.||||.||.||||||||..|..|.||||||||.|||
Sbjct 687  GGCCTATGCCTTTGCTCACCACCCCCAGAAGCCAGCGGCCCATGCAGTGCACCCTGCCAGTACCAAGGCTCTC  759