Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04216
- Subject:
- XM_017027326.1
- Aligned Length:
- 1173
- Identities:
- 1017
- Gaps:
- 153
Alignment
Query 1 ATGGCCGCCCCGCCGCGCCCCGCGCCATCGCCCCCCGCCCCGCGGCGCCTCGACACGAGCGACGTCCTGCAGCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GATCATGGCCATCACCGACCAGAGCCTGGACGAGGCACAGGCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA 148
||| ||..||||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----ATG-----------CCTCAGCCT-------------CCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA 46
Query 149 AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAG----------------------------- 193
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAGCATCTTCATTTCTCACGCGTCCGTGTGAA 120
Query 194 ----------------------TGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAAGATCCCCCTGACGCCCAGCTCCT 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAGACCACCAAACAGGCTTTCTTGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAAGATCCCCCTGACGCCCAGCTCCT 194
Query 246 GAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAGAGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCA 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 GAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAGAGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCA 268
Query 320 GGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGCACTCTGACTACAGGGCCAAGCTG 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 GGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGCACTCTGACTACAGGGCCAAGCTG 342
Query 394 TCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCCTGTCGTGAGTTCACCACGCACGT 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 TCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCCTGTCGTGAGTTCACCACGCACGT 416
Query 468 CACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGAGATTGAGCGCATGGTCGGCGCCA 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 CACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGAGATTGAGCGCATGGTCGGCGCCA 490
Query 542 TTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTGAGGCAGTGATGACCCTGCGTTCG 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTGAGGCAGTGATGACCCTGCGTTCG 564
Query 616 CGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACGGAAGTGCTGAATGAGTATTTTTA 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACGGAAGTGCTGAATGAGTATTTTTA 638
Query 690 CTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGCCAGGAAGGGCGGCCTCACCATCT 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 CTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGCCAGGAAGGGCGGCCTCACCATCT 712
Query 764 CCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACATGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCT 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACATGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCT 786
Query 838 ACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCAGGGAACCACGCCAGCTGCCTGTC 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 ACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCAGGGAACCACGCCAGCTGCCTGTC 860
Query 912 AACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGACGCCTTCCTCACCCTGCGGACTC 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 AACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGACGCCTTCCTCACCCTGCGGACTC 934
Query 986 TGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCCAGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 TGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCCAGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACC 1008
Query 1060 CCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCCAGTACATCTAAT 1122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCCAGTACATCTAAT 1071