Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_04216
Subject:
XM_017027326.1
Aligned Length:
1173
Identities:
1017
Gaps:
153

Alignment

Query    1  ATGGCCGCCCCGCCGCGCCCCGCGCCATCGCCCCCCGCCCCGCGGCGCCTCGACACGAGCGACGTCCTGCAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATCATGGCCATCACCGACCAGAGCCTGGACGAGGCACAGGCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA  148
                |||           ||..|||||             .|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATG-----------CCTCAGCCT-------------CCCAGAAAGCATGCTCTGAATTGCCATCGGATGA  46

Query  149  AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAG-----------------------------  193
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct   47  AGCCTGCTCTGTTCAGCGTGCTCTGTGAGATCAAGGAAAAGACAGCATCTTCATTTCTCACGCGTCCGTGTGAA  120

Query  194  ----------------------TGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAAGATCCCCCTGACGCCCAGCTCCT  245
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GAGACCACCAAACAGGCTTTCTTGGTAAGCATCCGTGGCATTCAAGACGAAGATCCCCCTGACGCCCAGCTCCT  194

Query  246  GAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAGAGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCA  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  GAGGCTGGATAACATGCTGCTGGCTGAGGGCGTGTGCAGGCCCGAGAAGAGAGGAAGAGGAGGAGCGGTGGCCA  268

Query  320  GGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGCACTCTGACTACAGGGCCAAGCTG  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  GGGCCGGCACAGCAACACCAGGTGGCTGTCCAAATGACAATAGCATTGAGCACTCTGACTACAGGGCCAAGCTG  342

Query  394  TCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCCTGTCGTGAGTTCACCACGCACGT  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  TCCCAGATCCGACAGATTTACCACTCTGAGCTAGAGAAATATGAACAGGCCTGTCGTGAGTTCACCACGCACGT  416

Query  468  CACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGAGATTGAGCGCATGGTCGGCGCCA  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CACCAACCTCCTCCAGGAGCAGAGCAGGATGAGGCCTGTCTCCCCTAAGGAGATTGAGCGCATGGTCGGCGCCA  490

Query  542  TTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTGAGGCAGTGATGACCCTGCGTTCG  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  TTCACGGCAAGTTCAGCGCCATCCAGATGCAGTTGAAGCAGAGCACCTGTGAGGCAGTGATGACCCTGCGTTCG  564

Query  616  CGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACGGAAGTGCTGAATGAGTATTTTTA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CGGCTGCTCGATGCCAGGCGCAAGCGGCGGAATTTCAGCAAGCAGGCGACGGAAGTGCTGAATGAGTATTTTTA  638

Query  690  CTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGCCAGGAAGGGCGGCCTCACCATCT  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  CTCCCATCTGAACAACCCTTACCCCAGCGAAGAAGCCAAAGAAGAGCTGGCCAGGAAGGGCGGCCTCACCATCT  712

Query  764  CCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACATGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCT  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCCAGGTCTCTAACTGGTTTGGCAACAAAAGAATCCGGTATAAAAAGAACATGGGGAAGTTTCAAGAAGAGGCT  786

Query  838  ACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCAGGGAACCACGCCAGCTGCCTGTC  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  ACCATTTACACGGGTAAAACGGCTGTGGATACCACGGAAGTTGGGGTCCCAGGGAACCACGCCAGCTGCCTGTC  860

Query  912  AACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGACGCCTTCCTCACCCTGCGGACTC  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  AACACCTAGCTCCGGCTCCTCTGGACCCTTCCCGCTGCCCAGCGCTGGGGACGCCTTCCTCACCCTGCGGACTC  934

Query  986  TGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCCAGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACC  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  TGGCCTCTCTCCAGCCTCCTCCTGGGGGAGGCTGCCTGCAGTCCCAGGCCCAGGGTAGCTGGCAGGGGGCCACC  1008

Query 1060  CCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCCAGTACATCTAAT  1122
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  CCCCAACCTGCAACTGCCTCACCTGCTGGAGACCCTGGCAGCATCAACTCCAGTACATCTAAT  1071