Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04228
• Subject: XM_006529807.3
• Aligned Length: 1212
• Identities: 1003
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||..||||||||||.|||||.|||..|.|
Sbjct    1  ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCGCGCCGCGGCCATCTGCCGGGAAGGAAGCACAGGGACG  74

Query   75  ACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTGATG  148
            ||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  ACCCGTGCTCTTTGAGGACCTGCCCCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGCTCTGGGGGACCTTTACTCTTTGATG  148

Query  149  ATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAAGGG  222
            ||||.||.||.|||..|||||||.|||||||||||||||||||||||...||||||.||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAGGTTCCCAGGTGGTGAAGACTGAAGGG  222

Query  223  AAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA  296
            ||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA  296

Query  297  AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG  370
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG  370

Query  371  CCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATATTTT  444
            ||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATACTTT  444

Query  445  GCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAATCAG  518
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  GCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAATCAG  518

Query  519  AAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGCATA  592
            .||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.|||||.|
Sbjct  519  GAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGCACA  592

Query  593  CTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGTGTT  666
            |.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  CCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGTGTC  666

Query  667  CTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGAGGA  740
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGAGGA  740

Query  741  GAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGATAC  814
            .|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  AAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGATAC  814

Query  815  AGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGACGGG  888
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  815  AGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGATGGG  888

Query  889  CAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT  962
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT  962

Query  963  TTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTCTCG  1036
            ||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  TTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCCTTG  1036

Query 1037  AGGAT----GAAAA-------------GATCCAG--ACCCGGGAAGGGAAGTCCGCAG-------CCGACGCCC  1084
            |||.|    ||.||             |.|||.|  .||| .||||.| ||.||..||       |.|.||.||
Sbjct 1037  AGGTTCCTAGACAACTTCATTCATCTCGTTCCTGTTTCCC-TGAAGTG-AGCCCTGAGAGGATGACTGTCGTCC  1108

Query 1085  --GC-TACGAAGCAGCCTG-CAA---CAGGCTGGCCAACAAG-GC--GGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGT  1148
              || ||| |..||| ||| |||   ||||          || ||  |||.|      |||  |||       |
Sbjct 1109  TGGCTTAC-ACCCAG-CTGTCAATCTCAGG----------AGTGCTTGGTTC------GCT--GCC-------T  1155

Query 1149  CACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC  1176
            .|.|| ||||||.               
Sbjct 1156  GAGTG-GATGGTC---------------  1167