Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04228
- Subject:
- XM_006529808.3
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 1035
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||..||||||||||.|||||.|||..|.|
Sbjct 1 ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCGCGCCGCGGCCATCTGCCGGGAAGGAAGCACAGGGACG 74
Query 75 ACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTGATG 148
||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 ACCCGTGCTCTTTGAGGACCTGCCCCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGCTCTGGGGGACCTTTACTCTTTGATG 148
Query 149 ATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAAGGG 222
||||.||.||.|||..|||||||.|||||||| ||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGT------------------TCCCAGGTGGTGAAGACTGAAGGG 204
Query 223 AAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA 296
||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 205 AAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA 278
Query 297 AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG 370
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 279 AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG 352
Query 371 CCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATATTTT 444
||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 353 CCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATACTTT 426
Query 445 GCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAATCAG 518
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 427 GCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAATCAG 500
Query 519 AAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGCATA 592
.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.|||||.|
Sbjct 501 GAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGCACA 574
Query 593 CTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGTGTT 666
|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 575 CCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGTGTC 648
Query 667 CTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGAGGA 740
||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 649 CTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGAGGA 722
Query 741 GAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGATAC 814
.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 723 AAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGATAC 796
Query 815 AGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGACGGG 888
||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 797 AGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGATGGG 870
Query 889 CAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT 962
||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 CAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT 944
Query 963 TTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTCTCG 1036
||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 945 TTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCCTTG 1018
Query 1037 AGGATGAAAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGTCCGCAGCCGACGCCCGCTACGAAGCAGCCTGCAACAGGCTG 1110
|||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|..||.||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1019 AGGATGACAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGCCTGCTGTTGATGCCCGCTATGAAGCTGCATGCAACAGGCTG 1092
Query 1111 GCCAACAAGGCGGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGTCACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC 1176
|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1093 GCCAACAAGGCAGTGCAGCGGGGCTCAGCAGACAACGTGACGGTGATGGTGGTGAGGATAGGACAC 1158