Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04228
- Subject:
- XM_006529811.3
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 995
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||..||||||
Sbjct 1 ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCGCGCCGCGGCCATCTGCCG------------------- 55
Query 75 ACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTGATG 148
||||| |||||||||||.||.|||||||
Sbjct 56 ------GCTCT-----------------------------------------GGGGGACCTTTACTCTTTGATG 82
Query 149 ATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAAGGG 222
||||.||.||.|||..|||||||.|||||||||||||||||||||||...||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 83 ATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAGGTTCCCAGGTGGTGAAGACTGAAGGG 156
Query 223 AAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA 296
||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 AAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA 230
Query 297 AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG 370
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG 304
Query 371 CCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATATTTT 444
||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 305 CCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATACTTT 378
Query 445 GCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAATCAG 518
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 379 GCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAATCAG 452
Query 519 AAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGCATA 592
.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.|||||.|
Sbjct 453 GAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGCACA 526
Query 593 CTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGTGTT 666
|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 527 CCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGTGTC 600
Query 667 CTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGAGGA 740
||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 601 CTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGAGGA 674
Query 741 GAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGATAC 814
.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 675 AAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGATAC 748
Query 815 AGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGACGGG 888
||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 749 AGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGATGGG 822
Query 889 CAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT 962
||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 CAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT 896
Query 963 TTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTCTCG 1036
||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 897 TTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCCTTG 970
Query 1037 AGGATGAAAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGTCCGCAGCCGACGCCCGCTACGAAGCAGCCTGCAACAGGCTG 1110
|||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|..||.||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 971 AGGATGACAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGCCTGCTGTTGATGCCCGCTATGAAGCTGCATGCAACAGGCTG 1044
Query 1111 GCCAACAAGGCGGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGTCACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC 1176
|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1045 GCCAACAAGGCAGTGCAGCGGGGCTCAGCAGACAACGTGACGGTGATGGTGGTGAGGATAGGACAC 1110