Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_04228
- Subject:
- XM_006529812.3
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 980
- Gaps:
- 84
Alignment
Query 1 ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||..||||||
Sbjct 1 ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCGCGCCGCGGCCATCTGCCG------------------- 55
Query 75 ACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTGATG 148
||||| |||||||||||.||.|||||||
Sbjct 56 ------GCTCT-----------------------------------------GGGGGACCTTTACTCTTTGATG 82
Query 149 ATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAAGGG 222
||||.||.||.|||..|||||||.|||||||| ||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 83 ATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGT------------------TCCCAGGTGGTGAAGACTGAAGGG 138
Query 223 AAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA 296
||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 AAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA 212
Query 297 AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG 370
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG 286
Query 371 CCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATATTTT 444
||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 287 CCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATACTTT 360
Query 445 GCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAATCAG 518
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 361 GCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAATCAG 434
Query 519 AAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGCATA 592
.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.|||||.|
Sbjct 435 GAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGCACA 508
Query 593 CTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGTGTT 666
|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 509 CCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGTGTC 582
Query 667 CTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGAGGA 740
||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 583 CTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGAGGA 656
Query 741 GAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGATAC 814
.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 657 AAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGATAC 730
Query 815 AGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGACGGG 888
||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 731 AGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGATGGG 804
Query 889 CAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT 962
||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 CAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT 878
Query 963 TTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTCTCG 1036
||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 879 TTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCCTTG 952
Query 1037 AGGATGAAAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGTCCGCAGCCGACGCCCGCTACGAAGCAGCCTGCAACAGGCTG 1110
|||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|..||.||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 953 AGGATGACAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGCCTGCTGTTGATGCCCGCTATGAAGCTGCATGCAACAGGCTG 1026
Query 1111 GCCAACAAGGCGGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGTCACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC 1176
|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1027 GCCAACAAGGCAGTGCAGCGGGGCTCAGCAGACAACGTGACGGTGATGGTGGTGAGGATAGGACAC 1092