Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04233
• Subject: NM_030787.4
• Aligned Length: 1707
• Identities: 1707
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTGCTCTTATTCAGTGTAATCCTAATCTCATGGGTATCCACTGTTGGGGGAGAAGGAACACTTTGTGATTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGCTCTTATTCAGTGTAATCCTAATCTCATGGGTATCCACTGTTGGGGGAGAAGGAACACTTTGTGATTT  74

Query   75  TCCAAAAATACACCATGGATTTCTGTATGATGAAGAAGATTATAACCCTTTTTCCCAAGTTCCTACAGGGGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCAAAAATACACCATGGATTTCTGTATGATGAAGAAGATTATAACCCTTTTTCCCAAGTTCCTACAGGGGAAG  148

Query  149  TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGACTCGCATAACATGCACAGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGACTCGCATAACATGCACAGAA  222

Query  223  GAAGGATGGTCACCAACACCGAAGTGTCTCAGAATGTGTTCCTTTCCTTTTGTGAAAAATGGTCATTCTGAATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGGATGGTCACCAACACCGAAGTGTCTCAGAATGTGTTCCTTTCCTTTTGTGAAAAATGGTCATTCTGAATC  296

Query  297  TTCAGGACTAATACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGATACAGCCTTCAAAACAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCAGGACTAATACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGATACAGCCTTCAAAACAATG  370

Query  371  AGAAAAACATTTCGTGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCATATGCAGCTTCACTAAAGGAGAATGTCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAAAACATTTCGTGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCATATGCAGCTTCACTAAAGGAGAATGTCAT  444

Query  445  GTTCCAATTTTAGAAGCCAATGTAGATGCTCAGCCAAAAAAAGAAAGCTACAAAGTTGGAGACGTGTTGAAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTCCAATTTTAGAAGCCAATGTAGATGCTCAGCCAAAAAAAGAAAGCTACAAAGTTGGAGACGTGTTGAAATT  518

Query  519  CTCCTGCAGAAAAAATCTTATAAGAGTTGGATCAGACTCAGTTCAATGTTACCAATTTGGGTGGTCACCTAACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCTGCAGAAAAAATCTTATAAGAGTTGGATCAGACTCAGTTCAATGTTACCAATTTGGGTGGTCACCTAACT  592

Query  593  TTCCAACATGCAAAGGACAAGTACGATCATGTGGTCCACCTCCTCAACTCTCCAATGGTGAAGTTAAGGAGATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCCAACATGCAAAGGACAAGTACGATCATGTGGTCCACCTCCTCAACTCTCCAATGGTGAAGTTAAGGAGATA  666

Query  667  AGAAAAGAGGAATATGGACACAATGAAGTAGTGGAATATGATTGCAATCCTAATTTTATAATAAACGGGCCTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAAAAGAGGAATATGGACACAATGAAGTAGTGGAATATGATTGCAATCCTAATTTTATAATAAACGGGCCTAA  740

Query  741  GAAAATACAATGTGTGGATGGAGAATGGACAACTTTACCCACTTGTGTTGAACAAGTGAAAACATGTGGATACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAAATACAATGTGTGGATGGAGAATGGACAACTTTACCCACTTGTGTTGAACAAGTGAAAACATGTGGATACA  814

Query  815  TACCTGAACTCGAGTACGGTTATGTTCAGCCGTCTGTCCCTCCCTATCAACATGGAGTTTCAGTCGAGGTGAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACCTGAACTCGAGTACGGTTATGTTCAGCCGTCTGTCCCTCCCTATCAACATGGAGTTTCAGTCGAGGTGAAT  888

Query  889  TGCAGAAATGAATATGCAATGATTGGAAATAACATGATTACCTGTATTAATGGAATATGGACAGAGCTTCCTAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAGAAATGAATATGCAATGATTGGAAATAACATGATTACCTGTATTAATGGAATATGGACAGAGCTTCCTAT  962

Query  963  GTGTGTTGCAACACACCAACTTAAGAGGTGCAAAATAGCAGGAGTTAATATAAAAACATTACTCAAGCTATCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGTGTTGCAACACACCAACTTAAGAGGTGCAAAATAGCAGGAGTTAATATAAAAACATTACTCAAGCTATCTG  1036

Query 1037  GGAAAGAATTTAATCATAATTCTAGAATACGTTACAGATGTTCAGACATCTTCAGATACAGGCACTCAGTCTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAAGAATTTAATCATAATTCTAGAATACGTTACAGATGTTCAGACATCTTCAGATACAGGCACTCAGTCTGT  1110

Query 1111  ATAAACGGGAAATGGAATCCTGAAGTAGACTGCACAGAAAAAAGGGAACAATTCTGCCCACCGCCACCTCAGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATAAACGGGAAATGGAATCCTGAAGTAGACTGCACAGAAAAAAGGGAACAATTCTGCCCACCGCCACCTCAGAT  1184

Query 1185  ACCTAATGCTCAGAATATGACAACCACAGTGAATTATCAGGATGGAGAAAAAGTAGCTGTTCTCTGTAAAGAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCTAATGCTCAGAATATGACAACCACAGTGAATTATCAGGATGGAGAAAAAGTAGCTGTTCTCTGTAAAGAAA  1258

Query 1259  ACTATCTACTTCCAGAAGCAAAAGAAATTGTATGTAAAGATGGACGATGGCAATCATTACCACGCTGTGTTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTATCTACTTCCAGAAGCAAAAGAAATTGTATGTAAAGATGGACGATGGCAATCATTACCACGCTGTGTTGAG  1332

Query 1333  TCTACTGCATATTGTGGGCCCCCTCCATCTATTAACAATGGAGATACCACCTCATTCCCATTATCAGTATATCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTACTGCATATTGTGGGCCCCCTCCATCTATTAACAATGGAGATACCACCTCATTCCCATTATCAGTATATCC  1406

Query 1407  TCCAGGGTCAACAGTGACGTACCGTTGCCAGTCCTTCTATAAACTCCAGGGCTCTGTAACTGTAACATGCAGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCAGGGTCAACAGTGACGTACCGTTGCCAGTCCTTCTATAAACTCCAGGGCTCTGTAACTGTAACATGCAGAA  1480

Query 1481  ATAAACAGTGGTCAGAACCACCAAGATGCCTAGATCCATGTGTGGTATCTGAAGAAAACATGAACAAAAATAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAAACAGTGGTCAGAACCACCAAGATGCCTAGATCCATGTGTGGTATCTGAAGAAAACATGAACAAAAATAAC  1554

Query 1555  ATACAGTTAAAATGGAGAAACGATGGAAAACTCTATGCAAAAACAGGGGATGCTGTTGAATTCCAGTGTAAATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATACAGTTAAAATGGAGAAACGATGGAAAACTCTATGCAAAAACAGGGGATGCTGTTGAATTCCAGTGTAAATT  1628

Query 1629  CCCACATAAAGCGATGATATCATCACCACCATTTCGAGCAATCTGTCAGGAAGGGAAATTTGAATATCCTATAT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCACATAAAGCGATGATATCATCACCACCATTTCGAGCAATCTGTCAGGAAGGGAAATTTGAATATCCTATAT  1702

Query 1703  GTGAA  1707
            |||||
Sbjct 1703  GTGAA  1707