Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04248
• Subject: NM_019449.2
• Aligned Length: 1865
• Identities: 1531
• Gaps: 82

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGGAGGCGGA  11
                                                                           |||||||.|||
Sbjct    1  ATGAAGGAAGTCCCAACCAGCTGCTGGTGCCCAGAACTGCAAGCCCTTGATCTGGATCTGGTCATGGAGGTGGA  74

Query   12  GCCGCCGCTCTACCCGATGGCGGGGGCTGCGGGGCCGCAGGGCGACGAGGACCTGCTCGGGGTCCCGGACGGGC  85
            |||.|||||||||||..||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||.||.|||.||.||.||.||||
Sbjct   75  GCCTCCGCTCTACCCTGTGGCCGGGGCCGCGGGTCCTCAAGGGGATGAAGACCGGCACGGAGTTCCTGATGGGC  148

Query   86  CCGAGGCCCCGCTGGACGAGCTGGTGGGCGCGTACCCCAACTACAACGAGGAGGAGGAGGAGCGCCGCTACTAC  159
            |.|||||.||..|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CAGAGGCTCCCTTGGACGAACTCGTGGGTGCGTACCCCAACTACAATGAGGAGGAGGAAGAGCGCCGCTACTAC  222

Query  160  CGCCGCAAGCGCCTGGGCGTGCTCAAGAACGTGCTGGCTGCCAGCGCCGGGGGCATGCTCACCTACGGCGTCTA  233
            ||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||.|.||.|.||..||.||.|||||||||||
Sbjct  223  CGCCGCAAGCGCCTCGGAGTGGTCAAGAACGTGCTGGCGGCCAGCACGGGTGTCACCCTTACTTACGGCGTCTA  296

Query  234  CCTGGGCCTCCTGCAGATGCAGCTGATCCTGCACTACGACGAGACCTACCGCGAGGTGAAGTATGGCAACATGG  307
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGGGCCTCCTGCAGATGCAACTGATCCTGCACTATGATGAGACCTACAGAGAGGTGAAGTATGGCAACATGG  370

Query  308  GGCTGCCCGACATCGACAGCAAAATGCTGATGGGCATCAACGTGACTCCCATCGCCGCCCTGCTCTACACACCT  381
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGCCGGACATCGATAGCAAGATGCTGATGGGTATCAACGTGACGCCTATCGCTGCCCTGCTCTACACACCT  444

Query  382  GTGCTCATCAGGTTTTTTGGAACGAAGTGGATGATGTTCCTCGCTGTGGGCATCTACGCCCTCTTTGTCTCCAC  455
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  GTGCTCATCAGGTTTTTTGGTACCAAGTGGATGATGTTCTTGGCTGTGGGCATCTATGCCCTCTTTGTCTCTAC  518

Query  456  CAACTACTGGGAGCGCTACTACACGCTTGTGCCCTCGGCTGTGGCCCTGGGCATGGCCATCGTGCCTCTTTGGG  529
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  519  CAACTACTGGGAACGCTACTACACGCTGGTGCCCTCTGCTGTGGCTCTGGGCATGGCCATTGTGCCTCTGTGGG  592

Query  530  CTTCCATGGGCAACTACATCACCAGGATGGCGCAGAAGTACCATGAGTACTCCCACTACAAGGAGCAGGATGGG  603
            |.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct  593  CCTCCATGGGCAACTATATCACCAGGATGTCCCAGAAGTACTATGAATACTCCCACTACAAGGAGCAAGATGAG  666

Query  604  CAGGGGATGA----AGCAGCGGCCTCCGCGGGGCTCCCACGCGCCCTATCTCCTGGTCTTCCAAGCCATCTTCT  673
            ||||    ||    |||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  667  CAGG----GACCTCAGCAGCGCCCACCACGAGGTTCCCACGCACCCTATCTCCTGGTTTTCCAGGCCATCTTCT  736

Query  674  ACAGCTTCTTCCATCTGAGCTTCGCCTGCGCCCAGCTGCCCATGATTTATTTCCTGAACCACTACCTGTATGAC  747
            |.|||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  737  ATAGCTTCTTCCACTTGAGCTTCGCGTGTGCCCAGCTGCCCATGATTTACTTCCTCAACAACTACCTGTATGAC  810

Query  748  CTGAACCACACGCTGTACAATGTGCAGAGCTGCGGCACCAACAGCCACGGGATCCTCAGCGGCTTCAACAAGAC  821
            |||||||||||.|||..|||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|..||||||||||||||
Sbjct  811  CTGAACCACACACTGATCAACGTGCAGAGCTGCGGTACTAAGAGCCAAGGCATTCTGAATGGCTTCAACAAGAC  884

Query  822  GGTTCTGCGGACGCTCCCGCGGAGCGGAAACCTCATTGTGGTGGAGAGCGTGCTCATGGCAGTGGCCTTCCTGG  895
            |||.||.||||||||.|||||.|||..||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  885  GGTCCTTCGGACGCTGCCGCGCAGCAAAAACCTTATTGTTGTAGAGAGCGTGCTCATGGCGGTGGCCTTCTTGG  958

Query  896  CCATGCTGCTGGTGCTGGGTTTGTGCGGAGCCGCTTACCGGCCCACGGAGGAGATCGATCTGCGCAGCGTGGGC  969
            ||||||||.||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  959  CCATGCTGATGGTGCTGGGCCTGTGTGGAGCCGCTTACCGGCCCACGGAAGAGATCGACCTGCGCAGCGTGGGC  1032

Query  970  TGGGGCAACATCTTCCAGCTGCCCTTCAAGCACGTGCGTGACTACCGCCTGCGCCACCTCGTGCCTTTCTTTAT  1043
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||.|.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1033  TGGGGCAACATCTTCCAGCTGCCCTTCAAACACGTGCGTGACTTTCGCTTACGCCATCTGGTGCCCTTCTTTAT  1106

Query 1044  CTACAGCGGCTTCGAGGTGCTCTTTGCCTGCACTGGTATCGCCTTGGGCTATGGCGTGTGCTCGGTGGGGCTGG  1117
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct 1107  CTACAGTGGCTTTGAGGTGCTCTTTGCCTGCACTGGTTTTGCCCTGGGCTACGGCGTGTGCTCCATGGGGCTGG  1180

Query 1118  AGCGGCTGGCTTACCTCCTCGTGGCTTACAGCCTGGGCGCCTCAGCCGCCTCACTCCTGGGCCTGCTGGGCCTG  1191
            ||||.|||||.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||.||||..|.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1181  AGCGACTGGCATACCTGCTCATAGCTTACAGCCTGGGTGCCTCAGCCTCCTCGGTTCTGGGGCTGCTGGGACTG  1254

Query 1192  TGGCTGCCACGCCCGGTGCCCCTGGTGGCCGGAGCAGGGGTGCACCTGCTGCTCACCTTCATCCTCTTTTTCTG  1265
            ||||||||.|||.|.||.||.||.|||||.||.|||||..|||||||.|||||||||.|.|.||||||||||||
Sbjct 1255  TGGCTGCCTCGCTCTGTCCCGCTCGTGGCTGGGGCAGGACTGCACCTACTGCTCACCCTTAGCCTCTTTTTCTG  1328

Query 1266  GGCCCCTGTGCCTCGGGTCCTGCAACACAGCTGGATCCTCTATGTGGCAGCTGCCCTTTGGGGTGTGGGCAGTG  1339
            |||.||||..|||||||||||.||.|||||.||||||.|.||..|.|..||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1329  GGCTCCTGCTCCTCGGGTCCTCCAGCACAGTTGGATCTTTTACTTCGTGGCTGCCCTCTGGGGTGTGGGCAGCG  1402

Query 1340  CCCTGAACAAGACTGGACTCAGCACACTCCTGGGAATCTTGTACGAAGACAAGGAGAGACAGGACTTCATCTTC  1413
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1403  CCCTCAACAAGACCGGACTTAGCACACTCCTGGGCATCCTATATGAAGACAAAGAGAGGCAGGACTTCATCTTC  1476

Query 1414  ACCATCTACCACTGGTGGCAGGCTGTGGCCATCTTCACCGTGTACCTGGGCTCGAGCCTGCACATGAAGGCTAA  1487
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||....||||||||||||||.|||.|||.|||||||||.||
Sbjct 1477  ACCATCTATCACTGGTGGCAGGCCGTGGCCATCTTTGTTGTGTACCTGGGCTCCAGCTTGCCCATGAAGGCCAA  1550

Query 1488  GCTGGCGGTGCTGCTGGTGACGCTGGTGGCGGCCGCGGTCTCCTACCTGCGGATGGAGCAGAAGCTGCGCCGGG  1561
            ||||||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||.||||||.||||||||||||||.|||..|..|
Sbjct 1551  GCTGGCAGTGTTGCTGGTGACCCTGGTAGCAGCAGCAGCCTCATACCTGTGGATGGAGCAGAAGTTGCAGCAAG  1624

Query 1562  GCGTGGCCCCGCGCCAGCCCCGCATCCCGCGGCCCCAGCACAAGGTGCGCGGTTACCGCTACTTGGAGGAGGAC  1635
            |..|||.||||||.|||||.|||||.|||..|||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1625  GATTGGTCCCGCGGCAGCCGCGCATTCCGAAGCCACAGCACAAAGTCCGCGGCTACCGCTACCTGGAGGAGGAC  1698

Query 1636  AACTCGGACGAGAGCGACGCGGAGGGCGAG------CATGGGGACGGCGCGGAGGAGGAGGCGCCGCCCGCAGG  1703
            ||||||||.|||||.|||..||||||||||      ||.||||||.||||.|||||.||.||.||.|..|||||
Sbjct 1699  AACTCGGATGAGAGTGACATGGAGGGCGAGCAGGGTCAGGGGGACTGCGCAGAGGACGAAGCACCACAGGCAGG  1772

Query 1704  GCCCAGGCCT-GGCCCCGAGCCCGCTGGACTCGGCCGCCGGCCCTGCCCGTACGAACAGGCGCAGGGGGGAGAC  1776
            |||    ||| ||..|.|||||.|||||.|.|.|||||..||||||.||.||.||||||||.|.|||.||.||.
Sbjct 1773  GCC----CCTGGGTGCAGAGCCAGCTGGCCCCTGCCGCAAGCCCTGTCCCTATGAACAGGCTCTGGGTGGCGAT  1842

Query 1777  GGGCCGGAGGAGCAG  1791
            |||||.|||||||||
Sbjct 1843  GGGCCTGAGGAGCAG  1857