Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04248
• Subject: XM_006531798.1
• Aligned Length: 1865
• Identities: 1383
• Gaps: 244

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGGAGGCGGA  11
                                                                           |||||||.|||
Sbjct    1  ATGAAGGAAGTCCCAACCAGCTGCTGGTGCCCAGAACTGCAAGCCCTTGATCTGGATCTGGTCATGGAGGTGGA  74

Query   12  GCCGCCGCTCTACCCGATGGCGGGGGCTGCGGGGCCGCAGGGCGACGAGGACCTGCTCGGGGTCCCGGACGGGC  85
            |||.|||||||||||..||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||.||.|||.||.||.||.||||
Sbjct   75  GCCTCCGCTCTACCCTGTGGCCGGGGCCGCGGGTCCTCAAGGGGATGAAGACCGGCACGGAGTTCCTGATGGGC  148

Query   86  CCGAGGCCCCGCTGGACGAGCTGGTGGGCGCGTACCCCAACTACAACGAGGAGGAGGAGGAGCGCCGCTACTAC  159
            |.|||||.||..|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CAGAGGCTCCCTTGGACGAACTCGTGGGTGCGTACCCCAACTACAATGAGGAGGAGGAAGAGCGCCGCTACTAC  222

Query  160  CGCCGCAAGCGCCTGGGCGTGCTCAAGAACGTGCTGGCTGCCAGCGCCGGGGGCATGCTCACCTACGGCGTCTA  233
            ||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||.|.||.|.||..||.||.|||||||||||
Sbjct  223  CGCCGCAAGCGCCTCGGAGTGGTCAAGAACGTGCTGGCGGCCAGCACGGGTGTCACCCTTACTTACGGCGTCTA  296

Query  234  CCTGGGCCTCCTGCAGATGCAGCTGATCCTGCACTACGACGAGACCTACCGCGAGGTGAAGTATGGCAACATGG  307
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGGGCCTCCTGCAGATGCAACTGATCCTGCACTATGATGAGACCTACAGAGAGGTGAAGTATGGCAACATGG  370

Query  308  GGCTGCCCGACATCGACAGCAAAATGCTGATGGGCATCAACGTGACTCCCATCGCCGCCCTGCTCTACACACCT  381
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGCCGGACATCGATAGCAAGATGCTGATGGGTATCAACGTGACGCCTATCGCTGCCCTGCTCTACACACCT  444

Query  382  GTGCTCATCAGGTTTTTTGGAACGAAGTGGATGATGTTCCTCGCTGTGGGCATCTACGCCCTCTTTGTCTCCAC  455
            ||||||||                                                                  
Sbjct  445  GTGCTCAT------------------------------------------------------------------  452

Query  456  CAACTACTGGGAGCGCTACTACACGCTTGTGCCCTCGGCTGTGGCCCTGGGCATGGCCATCGTGCCTCTTTGGG  529
                                                                                      
Sbjct  453  --------------------------------------------------------------------------  452

Query  530  CTTCCATGGGCAACTACATCACCAGGATGGCGCAGAAGTACCATGAGTACTCCCACTACAAGGAGCAGGATGGG  603
                                  |||||||.|.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct  453  ----------------------CAGGATGTCCCAGAAGTACTATGAATACTCCCACTACAAGGAGCAAGATGAG  504

Query  604  CAGGGGATGA----AGCAGCGGCCTCCGCGGGGCTCCCACGCGCCCTATCTCCTGGTCTTCCAAGCCATCTTCT  673
            ||||    ||    |||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  505  CAGG----GACCTCAGCAGCGCCCACCACGAGGTTCCCACGCACCCTATCTCCTGGTTTTCCAGGCCATCTTCT  574

Query  674  ACAGCTTCTTCCATCTGAGCTTCGCCTGCGCCCAGCTGCCCATGATTTATTTCCTGAACCACTACCTGTATGAC  747
            |.|||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  575  ATAGCTTCTTCCACTTGAGCTTCGCGTGTGCCCAGCTGCCCATGATTTACTTCCTCAACAACTACCTGTATGAC  648

Query  748  CTGAACCACACGCTGTACAATGTGCAGAGCTGCGGCACCAACAGCCACGGGATCCTCAGCGGCTTCAACAAGAC  821
            |||||||||||.|||..|||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|..||||||||||||||
Sbjct  649  CTGAACCACACACTGATCAACGTGCAGAGCTGCGGTACTAAGAGCCAAGGCATTCTGAATGGCTTCAACAAGAC  722

Query  822  GGTTCTGCGGACGCTCCCGCGGAGCGGAAACCTCATTGTGGTGGAGAGCGTGCTCATGGCAGTGGCCTTCCTGG  895
            |||.||.||||||||.|||||.|||..||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  723  GGTCCTTCGGACGCTGCCGCGCAGCAAAAACCTTATTGTTGTAGAGAGCGTGCTCATGGCGGTGGCCTTCTTGG  796

Query  896  CCATGCTGCTGGTGCTGGGTTTGTGCGGAGCCGCTTACCGGCCCACGGAGGAGATCGATCTGCGCAGCGTGGGC  969
            ||||||||.||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  797  CCATGCTGATGGTGCTGGGCCTGTGTGGAGCCGCTTACCGGCCCACGGAAGAGATCGACCTGCGCAGCGTGGGC  870

Query  970  TGGGGCAACATCTTCCAGCTGCCCTTCAAGCACGTGCGTGACTACCGCCTGCGCCACCTCGTGCCTTTCTTTAT  1043
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||.|.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  871  TGGGGCAACATCTTCCAGCTGCCCTTCAAACACGTGCGTGACTTTCGCTTACGCCATCTGGTGCCCTTCTTTAT  944

Query 1044  CTACAGCGGCTTCGAGGTGCTCTTTGCCTGCACTGGTATCGCCTTGGGCTATGGCGTGTGCTCGGTGGGGCTGG  1117
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct  945  CTACAGTGGCTTTGAGGTGCTCTTTGCCTGCACTGGTTTTGCCCTGGGCTACGGCGTGTGCTCCATGGGGCTGG  1018

Query 1118  AGCGGCTGGCTTACCTCCTCGTGGCTTACAGCCTGGGCGCCTCAGCCGCCTCACTCCTGGGCCTGCTGGGCCTG  1191
            ||||.|||||.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||.||||..|.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1019  AGCGACTGGCATACCTGCTCATAGCTTACAGCCTGGGTGCCTCAGCCTCCTCGGTTCTGGGGCTGCTGGGACTG  1092

Query 1192  TGGCTGCCACGCCCGGTGCCCCTGGTGGCCGGAGCAGGGGTGCACCTGCTGCTCACCTTCATCCTCTTTTTCTG  1265
            ||||||||.|||.|.||.||.||.|||||.||.|||||..|||||||.|||||||||.|.|.||||||||||||
Sbjct 1093  TGGCTGCCTCGCTCTGTCCCGCTCGTGGCTGGGGCAGGACTGCACCTACTGCTCACCCTTAGCCTCTTTTTCTG  1166

Query 1266  GGCCCCTGTGCCTCGGGTCCTGCAACACAGCTGGATCCTCTATGTGGCAGCTGCCCTTTGGGGTGTGGGCAGTG  1339
            |||.||||..|||||||||||.||.|||||.||||||.|.||..|.|..||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1167  GGCTCCTGCTCCTCGGGTCCTCCAGCACAGTTGGATCTTTTACTTCGTGGCTGCCCTCTGGGGTGTGGGCAGCG  1240

Query 1340  CCCTGAACAAGACTGGACTCAGCACACTCCTGGGAATCTTGTACGAAGACAAGGAGAGACAGGACTTCATCTTC  1413
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1241  CCCTCAACAAGACCGGACTTAGCACACTCCTGGGCATCCTATATGAAGACAAAGAGAGGCAGGACTTCATCTTC  1314

Query 1414  ACCATCTACCACTGGTGGCAGGCTGTGGCCATCTTCACCGTGTACCTGGGCTCGAGCCTGCACATGAAGGCTAA  1487
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||....||||||||||||||.|||.|||.|||||||||.||
Sbjct 1315  ACCATCTATCACTGGTGGCAGGCCGTGGCCATCTTTGTTGTGTACCTGGGCTCCAGCTTGCCCATGAAGGCCAA  1388

Query 1488  GCTGGCGGTGCTGCTGGTGACGCTGGTGGCGGCCGCGGTCTCCTACCTGCGGATGGAGCAGAAGCTGCGCCGGG  1561
            ||||||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||.||||||.||||||||||||||.|||..|..|
Sbjct 1389  GCTGGCAGTGTTGCTGGTGACCCTGGTAGCAGCAGCAGCCTCATACCTGTGGATGGAGCAGAAGTTGCAGCAAG  1462

Query 1562  GCGTGGCCCCGCGCCAGCCCCGCATCCCGCGGCCCCAGCACAAGGTGCGCGGTTACCGCTACTTGGAGGAGGAC  1635
            |..|||.||||||.|||||.|||||.|||..|||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1463  GATTGGTCCCGCGGCAGCCGCGCATTCCGAAGCCACAGCACAAAGTCCGCGGCTACCGCTACCTGGAGGAGGAC  1536

Query 1636  AACTCGGACGAGAGCGACGCGGAGGGCGAG------CATGGGGACGGCGCGGAGGAGGAGGCGCCGCCCGCAGG  1703
            ||||||||.|||||.|||..||||||||||      ||.||||||.||||.|||||.||.||.||.|..|||||
Sbjct 1537  AACTCGGATGAGAGTGACATGGAGGGCGAGCAGGGTCAGGGGGACTGCGCAGAGGACGAAGCACCACAGGCAGG  1610

Query 1704  GCCCAGGCCT-GGCCCCGAGCCCGCTGGACTCGGCCGCCGGCCCTGCCCGTACGAACAGGCGCAGGGGGGAGAC  1776
            |||    ||| ||..|.|||||.|||||.|.|.|||||..||||||.||.||.||||||||.|.|||.||.||.
Sbjct 1611  GCC----CCTGGGTGCAGAGCCAGCTGGCCCCTGCCGCAAGCCCTGTCCCTATGAACAGGCTCTGGGTGGCGAT  1680

Query 1777  GGGCCGGAGGAGCAG  1791
            |||||.|||||||||
Sbjct 1681  GGGCCTGAGGAGCAG  1695